| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 4,063,530 | 0 | A | C | 16.6% | 667.6 / 134.7 | 276 | C78G (TGT→GGT) | yihR | mutarotase superfamily protein, YihR family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (101/129); new base C (21/25); total (122/154) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.72e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
TGGGCGGCAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCG > CP009273/4063383‑4063673 | cggcAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTCACCGCCGtt > 2:771911/1‑150 (MQ=255) gcAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTgg < 1:1046553/150‑1 (MQ=255) gcAGAAAAGCTGTCAGGGTAACGCTGGTGGCGGTTAATTCACTAATTTGCCAGTCTCGCCAGGCAAGCAGCCCGTGAATAGCGGCTTTTGAACTATGTTCATTAATGGGTAACTGATATTCCTGCCCCTGATAGCGGTAACCGCCGTTgg < 1:1837468/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |