Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 4,372,891 | 0 | A | T | 7.3% | 917.6 / 47.1 | 261 | A144A (GCA→GCT) | epmA | Elongation Factor P Lys34 lysyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (135/107); new base T (8/11); total (143/118) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.39e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
TGTGCCGCAGCTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACCGCGACACGCTGCTACAATT > CP009273/4372743‑4373040 | tgtgCCGCAGCTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGcagcag > 2:1984339/1‑150 (MQ=255) gtgCCGCAGCTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGa > 1:2578671/1‑150 (MQ=255) gtgCCGCAGCTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGa > 1:2577997/1‑150 (MQ=255) 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ctctTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGAt > 1:2359573/1‑150 (MQ=255) tctTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATa > 1:127906/1‑150 (MQ=255) tctTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATa < 1:2708329/150‑1 (MQ=255) ctTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATAc < 1:1678180/150‑1 (MQ=255) ttACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATAcc < 2:214269/150‑1 (MQ=255) caacaGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCgaa > 2:927016/1‑150 (MQ=255) caGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCTGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCgaagaa > 2:4416467/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGAc < 2:2037545/150‑1 (MQ=255) tacttgACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGAcc < 1:1068589/145‑1 (MQ=255) cTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACcgc > 2:1772908/1‑150 (MQ=255) cTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACcgc > 1:3294686/1‑150 (MQ=255) cTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACcgc > 1:2955597/1‑150 (MQ=255) tGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACcgcg > 1:2264592/1‑150 (MQ=255) tGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACcgcg > 2:3520433/1‑150 (MQ=255) aCTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACCGCGaca > 1:3821088/1‑150 (MQ=255) ggCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACCGCGACACgctgct < 1:1802764/150‑1 (MQ=255) agAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACCGCGACACGCTGCTACAAtt > 1:1618068/1‑150 (MQ=255) | TGTGCCGCAGCTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAGTTCACTATGCTGGAGTGGTATCGACCGCACTATGATATGTACCGGTTGATGAACGAGGTGGACGATCTCTTACAACAGGTGCTGGACTGCCCGGCAGCAGAAAGCCTTTCTTATCAACAAGCTTTCTTGCGTTATCTGGAAATTGACCCGCTCTCTGCCGACAAAACGCAACTGCGGGAAGTCGCAGCGAAACTGGATTTGAGCAATGTTGCTGATACCGAAGAAGACCGCGACACGCTGCTACAATT > CP009273/4372743‑4373040 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |