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Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
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tCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAGGCGTAATACTCAGCAGGAGATAACAATGAAAATTTTCCAACGGTACAACCCACTTCAGGTGGCGAAGTACGTAAAGATCCTGTTCCGTGGACGGTTATACATCAAGGACGTTGgcg < 2:3251543/150‑1 (MQ=255) ataataGTTGGGCCTATTGTGGCACCGCACAGGCGTAATACTCAGCAGGAGATAACAATGAAAATTTTCCAACGGTACAACCCACTTCAGGTGGCGAAGTACGTAAAGATCCTGTTCCGTGGACGGTTATACATCAAGGACGTTGGCGCt > 1:4211931/1‑150 (MQ=255) ataataGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAGGCGTAATACTCAGCAGGAGATAACAATGAAAATTTTCCAACGGTACAACCCACTTCAGGTGGCGAAGTACGTAAAGATCCTGTTCCGTGGACGGTTATACATCAAGGACGTTGGCGCt > 1:1541938/1‑150 (MQ=255) taataGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAGGCGTAATACTCAGCAGGAGATAACAATGAAAATTTTCCAACGGTACAACCCACTTCAGGTGGCGAAGTACGTAAAGATCCTGTTCCGTGGACGGTTATACATCAAGGACGTTGGCGCtt < 1:979266/150‑1 (MQ=255) taataGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAGGCGTAATACTCAGCAGGAGATAACAATGAAAATTTTCCAACGGTACAACCCACTTCAGGTGGCGAAGTACGTAAAGATCCTGTTCCGTGGACGGTTATACATCAAGGACGTTGGCGCtt < 2:3152766/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |