| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,468,165 | A→G | 87.7% | intergenic (‑37/‑125) | argI ← / → rraB | ornithine carbamoyltransferase 1/protein inhibitor of RNase E |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,468,165 | 0 | A | G | 87.7% | 842.9 / 86.1 | 280 | intergenic (‑37/‑125) | argI/rraB | ornithine carbamoyltransferase 1/protein inhibitor of RNase E |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (21/13); new base G (116/129); total (137/143) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.43e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.45e-01 | |||||||||||
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
TACCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTGG > CP009273/4468017‑4468311 | aCCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGtt < 1:1981998/150‑1 (MQ=255) ccGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTc > 1:1403004/1‑150 (MQ=255) gCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCaa > 1:3949823/1‑150 (MQ=255) cTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAt < 1:170904/150‑1 (MQ=255) ttCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTta > 2:1482956/1‑150 (MQ=255) ttCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTta > 1:1653582/1‑150 (MQ=255) ttCTTATCGGCTCTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTta > 2:3447749/1‑150 (MQ=255) tCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTtat < 1:4215646/150‑1 (MQ=255) tCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTtat < 2:4460454/150‑1 (MQ=255) cTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTtata > 1:194397/1‑150 (MQ=255) cTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTtata > 1:4459870/1‑150 (MQ=255) cTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTtata > 1:2807390/1‑150 (MQ=255) ttATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTatat > 2:2973171/1‑150 (MQ=255) tATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATg > 1:3527799/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgat > 2:1943200/1‑150 (MQ=255) ggCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgatg < 1:2208118/150‑1 (MQ=255) ggCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgatg > 2:3108370/1‑150 (MQ=255) gCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgatga < 1:2838685/150‑1 (MQ=255) gCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgatga < 2:2872184/150‑1 (MQ=255) gCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGgatga < 2:1136577/150‑1 (MQ=255) cTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgatgat > 2:2986427/1‑150 (MQ=255) cTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgatgat > 1:4381477/1‑150 (MQ=255) tCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGattat > 1:468788/1‑150 (MQ=255) aGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTc < 2:1884967/150‑1 (MQ=255) aGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTc > 2:3331605/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCAtt < 2:3858106/150‑1 (MQ=255) cgGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCa < 1:2090717/150‑1 (MQ=255) gCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAg < 1:795312/150‑1 (MQ=255) gCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAg < 1:1327535/150‑1 (MQ=255) tAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGAGCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATAGGGATGATTATTCATTTGCAAGTc < 2:527067/150‑1 (MQ=255) aaCTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCt > 2:4334071/1‑150 (MQ=255) tGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTaaa > 1:1594612/1‑150 (MQ=255) tGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTaaa > 1:595250/1‑150 (MQ=255) cagcagGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGc < 1:2724483/150‑1 (MQ=255) cagcagGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGc > 1:2544311/1‑150 (MQ=255) ggCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATaaa < 1:1189176/150‑1 (MQ=255) ggCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATaaa < 1:3195880/150‑1 (MQ=255) tGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCt > 2:3529938/1‑150 (MQ=255) tGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCt > 2:1245552/1‑150 (MQ=255) gTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCtt < 2:2381685/150‑1 (MQ=255) tGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTg < 1:3372694/150‑1 (MQ=255) tGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTg < 1:1486169/150‑1 (MQ=255) gAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGt < 1:1114356/150‑1 (MQ=255) aGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTc < 2:3832858/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGAAAGTCTAAATCATAAATCTTTGTca > 1:2332542/1‑150 (MQ=255) ttCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTcac < 2:828091/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATTATTATTAATTTGCAAGTATAAATCATAAATAtttttaaaaa > 2:1617487/1‑143 (MQ=255) aGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACaaa < 2:2716228/150‑1 (MQ=255) cTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAgg > 1:376249/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGt > 2:2644080/1‑150 (MQ=255) gTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAg > 2:3618376/1‑150 (MQ=255) gTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAg < 1:3938368/150‑1 (MQ=255) gAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGc > 2:3265/1‑150 (MQ=255) gAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGc > 2:3291/1‑150 (MQ=255) aTCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAAt > 2:2947229/1‑150 (MQ=255) aTCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAAt > 2:1713992/1‑150 (MQ=255) cGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGt > 2:1290620/1‑150 (MQ=255) cGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGt > 2:4441808/1‑150 (MQ=255) tCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGgtgt > 1:602480/1‑150 (MQ=255) cAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGgtgtg > 2:2164084/1‑150 (MQ=255) aGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGgtgtgt > 1:3499380/1‑150 (MQ=255) aGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGgtgtgt < 2:233996/150‑1 (MQ=255) aaTGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACa < 2:3731514/150‑1 (MQ=255) aaTGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAATTATATGGATGATAATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAAACTTAGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACa > 1:3584445/1‑150 (MQ=255) tGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAAt < 2:3949823/150‑1 (MQ=255) ttATAATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAag < 1:2594442/150‑1 (MQ=255) tATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAaga > 2:2364119/1‑150 (MQ=255) gATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTa < 2:2350614/150‑1 (MQ=255) gATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTa < 1:493918/150‑1 (MQ=255) gATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTa < 2:801645/150‑1 (MQ=255) tAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATc < 2:2514811/150‑1 (MQ=255) aaaCCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCgg > 1:861220/1‑150 (MQ=255) cGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGa > 1:511878/1‑150 (MQ=255) gACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACa > 2:2383891/1‑150 (MQ=255) gACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACa > 1:1821237/1‑150 (MQ=255) aCATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACAt > 1:1556700/1‑150 (MQ=255) cATAGCTCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACAtt < 2:3781826/150‑1 (MQ=255) aTAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTa < 1:997229/150‑1 (MQ=255) aTAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTa < 1:3263585/150‑1 (MQ=255) aGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAag < 2:695747/150‑1 (MQ=255) aTCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAagag > 1:4288440/1‑150 (MQ=255) aTCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAagag < 2:2104836/150‑1 (MQ=255) tcctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATg < 2:2252121/150‑1 (MQ=255) tcctGTGGCTAACGCCTCAATGAATAAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGACTg > 2:3021522/1‑150 (MQ=255) ctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAg < 2:468788/150‑1 (MQ=255) ctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAg < 1:2973171/150‑1 (MQ=255) gtgGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGcc < 1:4458758/150‑1 (MQ=255) tgGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCa < 1:4089344/150‑1 (MQ=255) ggCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATACATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCAt < 2:1432967/150‑1 (MQ=255) gCTAAAGCCTCAATGAATTATAGTTATATTTTTATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATg < 2:1538090/150‑1 (MQ=255) tAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGc < 2:1989932/150‑1 (MQ=255) aaCGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCa < 1:3817098/150‑1 (MQ=255) aTGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaa > 1:2818996/1‑150 (MQ=255) tGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaac > 1:3073849/1‑150 (MQ=255) tGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCACACCCGGaac > 2:3073855/1‑150 (MQ=255) gAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaaca > 1:3897844/1‑150 (MQ=255) aTTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaacaac > 1:1863994/1‑150 (MQ=255) aTTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaacaac < 2:1025389/150‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaacaac < 2:1024735/150‑1 (MQ=255) ttAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACt > 2:2820320/1‑150 (MQ=255) | TACCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTGG > CP009273/4468017‑4468311 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |