| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,484,059 | G→T | 11.9% | F55L (TTC→TTA) | idnD ← | L‑idonate 5‑dehydrogenase, NAD‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,484,059 | 0 | G | T | 11.9% | 835.4 / 68.4 | 257 | F55L (TTC→TTA) | idnD | L‑idonate 5‑dehydrogenase, NAD‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (113/113); new base T (19/12); total (132/125) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 | |||||||||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
TTCTCGTTATGTTCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTG > CP009273/4483910‑4484208 | ttCTCGTTATGTTCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATg > 1:3738565/1‑150 (MQ=255) cGTTATGTTCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAAt > 1:4089845/1‑150 (MQ=255) cGTTATGTTCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAAt > 2:2624290/1‑150 (MQ=255) cGTTATGTTCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAAt < 1:1842963/150‑1 (MQ=255) gTTATGTTCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAAtt > 2:2818237/1‑150 (MQ=255) tATGTTCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTAc < 1:3178347/150‑1 (MQ=255) tATGTTCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTAc > 1:2522469/1‑150 (MQ=255) tATGTTCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACAATCGGTGCCTTTATCATGAAATTAc > 2:3475223/1‑150 (MQ=255) gTTCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATTAAATTACCTa > 2:304909/1‑150 (MQ=255) gTTCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTa < 1:4419851/150‑1 (MQ=255) ttCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATTAAATTACCTAc > 1:3743729/1‑150 (MQ=255) ttCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTAc > 1:2864515/1‑150 (MQ=255) tCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACt < 1:3800455/150‑1 (MQ=255) aaTGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACttt < 2:3960892/150‑1 (MQ=255) gTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTttccttc > 1:1096382/1‑150 (MQ=255) gTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTttccttc > 2:4520003/1‑150 (MQ=255) tATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTttccttcc < 2:3842727/150‑1 (MQ=255) aTTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTtccttcct < 2:3126102/150‑1 (MQ=255) tttGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTg < 2:3824418/150‑1 (MQ=255) tGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGat < 1:4256887/150‑1 (MQ=255) aGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGataat < 1:46476/150‑1 (MQ=255) tGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGAtaataa > 2:37645/1‑150 (MQ=255) cGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATTAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTa > 2:2099514/1‑150 (MQ=255) cGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTa > 2:2181509/1‑150 (MQ=255) cACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTaaa < 1:3109115/150‑1 (MQ=255) aCGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAAt > 1:1684871/1‑150 (MQ=255) cGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATc > 2:65320/1‑150 (MQ=255) ggTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCg > 2:2073602/1‑150 (MQ=255) gACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCg < 1:4447231/150‑1 (MQ=255) cGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCa < 2:1597529/150‑1 (MQ=255) cGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCa < 2:1597437/150‑1 (MQ=255) ggATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCaa > 1:2454753/1‑150 (MQ=255) aTTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAAt < 2:1886026/150‑1 (MQ=255) aTTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAAt < 1:2728486/150‑1 (MQ=255) aaTGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATTAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTcc < 1:641141/150‑1 (MQ=255) aaTGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTcc > 1:3304054/1‑150 (MQ=255) ggCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCAcc < 1:2936871/150‑1 (MQ=255) gCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATTAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCt > 2:4331848/1‑150 (MQ=255) cTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTc > 1:619381/1‑150 (MQ=255) cGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGt < 2:4017610/150‑1 (MQ=255) gTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGtt < 1:750309/150‑1 (MQ=255) gCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTAttt < 2:808870/150‑1 (MQ=255) gCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATAGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTAttt > 1:1572430/1‑150 (MQ=255) cccTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTg < 2:1656761/150‑1 (MQ=255) ccTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGt > 2:896421/1‑150 (MQ=255) ccTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGt > 2:2483174/1‑150 (MQ=255) tGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTAATTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATAGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAAt > 1:3851651/1‑150 (MQ=255) tAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGt > 2:2928519/1‑150 (MQ=255) aaTTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGtt > 2:79895/1‑150 (MQ=255) aaTTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGtt > 2:604525/1‑150 (MQ=255) aTTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCAACTCGGGTTATTTGTACTAATGtta > 2:3074844/1‑149 (MQ=255) ttCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTcc < 2:4485648/150‑1 (MQ=255) cTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCAACGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCat > 2:1251881/1‑150 (MQ=255) tgatgaGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCatt < 1:2181509/150‑1 (MQ=255) gatgaGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCatta < 1:2604239/150‑1 (MQ=255) aGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTACCACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCattattat < 1:1218224/150‑1 (MQ=255) aGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCattattat > 2:3735888/1‑150 (MQ=255) gTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCattattatt < 2:693709/150‑1 (MQ=255) cGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTcc > 1:963354/1‑150 (MQ=255) cGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTcc < 1:3003295/150‑1 (MQ=255) gCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCa > 1:1981147/1‑150 (MQ=255) gCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCa < 2:3231776/150‑1 (MQ=255) tATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCCTCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAAt < 2:3086245/150‑1 (MQ=255) aTAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATc < 2:2439964/150‑1 (MQ=255) aaCTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATTAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGt > 1:1035343/1‑150 (MQ=255) aaCTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATTAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGt > 1:3315064/1‑150 (MQ=255) aCTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATTAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTc > 1:2021285/1‑150 (MQ=255) ttACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCACATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGACTGc > 1:3030565/1‑150 (MQ=255) tACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCt > 1:594101/1‑150 (MQ=255) ccGAGAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGTAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCTCCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCATTCTATCGTCTGCTCg < 1:3895888/150‑1 (MQ=255) gATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCAGTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGt > 1:482423/1‑150 (MQ=255) gATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATAGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCTTTATTATTCCAATCTATCGTATGCTCGGt > 2:2304348/1‑150 (MQ=255) aaCTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATTAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAAc < 2:4269050/150‑1 (MQ=255) aaCTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAAc < 1:3068160/150‑1 (MQ=255) ttCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGc > 1:1494748/1‑150 (MQ=255) tCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCa < 2:3583316/150‑1 (MQ=255) tCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCa < 2:3705184/150‑1 (MQ=255) cATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCac > 2:1903017/1‑149 (MQ=255) cATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCaa > 2:1371391/1‑150 (MQ=255) aTGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAAc > 1:4047019/1‑150 (MQ=255) aTGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAAc > 2:2867160/1‑150 (MQ=255) gACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAg < 1:4132682/150‑1 (MQ=255) ccTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGtt > 1:4241744/1‑150 (MQ=255) ccTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGtt > 2:431559/1‑150 (MQ=255) ccTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGtt < 1:2375921/150‑1 (MQ=255) cTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGttt < 1:2619362/150‑1 (MQ=255) cTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGttt < 1:354512/150‑1 (MQ=255) tAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGtttt < 2:2577238/150‑1 (MQ=255) aaCACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTc > 1:3443864/1‑150 (MQ=255) aaCACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTc > 2:461694/1‑150 (MQ=255) aaCACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTc > 2:2725768/1‑150 (MQ=255) acacCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTCt > 2:3283588/1‑150 (MQ=255) cATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTCTTGcc > 2:296077/1‑150 (MQ=255) gTGCCTTTATCATTAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTCTTGCCCGcaa > 2:2065432/1‑150 (MQ=255) gCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTCTTGCCCGcaaca < 2:1117749/150‑1 (MQ=255) aTCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTCTTGCCCGCAACAACGCAg > 1:4218853/1‑150 (MQ=255) cATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTCTTGCCCGCAACAACGCAGGa > 1:1153398/1‑150 (MQ=255) aTGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTCTTGCCCGCAACAACGCAGGAc > 1:1817544/1‑150 (MQ=255) aTGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTCTTGCCCGCAACAACGCAGGAc > 1:1465924/1‑150 (MQ=255) aTGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTCTTGCCCGCAACAACGCAGGAc < 2:527281/150‑1 (MQ=255) | TTCTCGTTATGTTCAATGCAGTATTTGCAGTGACCGCACGGTTTAGACGGATTAATGGCTACCGTTTGCCCTTCATGTAATTCTGATGAGTCGCTATGAATAACTTTACCGATAACTTCATGACCTAACACCATCGGTGCCTTTATCATGAAATTACCTACTTTTCCTTCCTGATAATAATGTAAATCGGAACCGCAAATTCCACCTCGGGTTATTTGTACTAATGTTCCATTATTATTCCAATCTATCGTCTGCTCGGTAACGGCAACAGTTTTCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTG > CP009273/4483910‑4484208 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |