| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,926,578 | T→G | 10.8% | intergenic (+34/‑133) | kup → / → rbsD | potassium transporter/putative cytoplasmic sugar‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,926,578 | 0 | T | G | 10.8% | 774.4 / 14.6 | 270 | intergenic (+34/‑133) | kup/rbsD | potassium transporter/putative cytoplasmic sugar‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (91/142); new base G (35/2); total (126/144) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.28e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
CGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGATGGAGAAAAAAATGAAAAAAGGCACC > CP009273/3926431‑3926725 | cGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGttt < 2:1109391/149‑1 (MQ=255) tCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGttttt < 2:264632/149‑1 (MQ=255) gcgcGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTGtttttt > 1:2826955/1‑149 (MQ=255) cgcgGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGttt < 2:3150684/149‑1 (MQ=255) cgcgGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGttt < 1:3506112/149‑1 (MQ=255) gcgGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTGTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGtttt > 2:3698652/1‑149 (MQ=255) ggCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCCTAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCa < 2:3296908/149‑1 (MQ=255) gCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCAt > 1:4263318/1‑149 (MQ=255) cAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATg < 1:2757889/149‑1 (MQ=255) cAAGCTGTACGTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGACCTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATg < 1:1644412/149‑1 (MQ=255) aGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATggg > 1:4150069/1‑148 (MQ=255) aGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGt > 2:3247281/1‑149 (MQ=255) aGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGt > 2:1534679/1‑149 (MQ=255) aGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTGTTTGTTTTCATGGt > 1:4150395/1‑149 (MQ=255) cTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTa < 1:4733987/149‑1 (MQ=255) tGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTaa < 2:1742935/149‑1 (MQ=255) tGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTaa < 2:4355944/149‑1 (MQ=255) tACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATc < 1:1728945/149‑1 (MQ=255) tACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTGGTTTTTTTCATGGTTTAta > 1:925819/1‑148 (MQ=255) tgctgctgcAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCa < 1:3698184/149‑1 (MQ=255) gctgctgcAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCG‑TTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATg > 2:1035161/1‑149 (MQ=255) tgcAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTGTTGTTTTAATTGTTAAAAACCCAGTaaa > 1:4897315/1‑149 (MQ=255) cAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAACTCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAAc < 2:3781389/149‑1 (MQ=255) cAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAAc < 1:1020340/149‑1 (MQ=255) cAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAAc < 2:3611312/149‑1 (MQ=255) gTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGttt < 1:1264243/149‑1 (MQ=255) gTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGttt < 1:5070344/149‑1 (MQ=255) aTGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGa < 2:4207768/149‑1 (MQ=255) tGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAg > 2:667884/1‑149 (MQ=255) tGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTGTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAg > 1:753872/1‑149 (MQ=255) tGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTGTTTGTTTTAATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAg > 1:3744663/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGCGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAgg < 1:3053228/149‑1 (MQ=255) gcTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGtt < 2:4753524/149‑1 (MQ=255) cTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTg < 1:4955535/149‑1 (MQ=255) tGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGa > 2:675341/1‑149 (MQ=255) tGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGa < 2:1179607/149‑1 (MQ=255) tGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTGTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGa > 2:4169619/1‑149 (MQ=255) gCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGAt < 2:2321405/149‑1 (MQ=255) tGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATcac < 2:3922603/149‑1 (MQ=255) gCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATcaca < 1:668925/149‑1 (MQ=255) cACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACAt < 1:1938108/149‑1 (MQ=255) cACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATAACAt > 2:1153690/1‑149 (MQ=255) aCCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTTTTTTCATTGTTAATAACCATGTAAAACGTTTCGAGGGTGATCACAtt > 1:5002868/1‑149 (MQ=255) aCCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAAAGTTTCGAGGTTGATCACAtt > 2:4875805/1‑149 (MQ=255) aCCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATAACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACAtt > 2:2863389/1‑149 (MQ=255) ccAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTTTTTTAATGGGTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGGTGATAACAttt > 1:4322863/1‑149 (MQ=255) ccAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACAttt > 2:144023/1‑149 (MQ=255) aGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTGTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTcc > 1:2122639/1‑149 (MQ=255) tCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGTTCACATTTCCGTa > 1:2841846/1‑149 (MQ=255) cAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTaa < 1:549205/149‑1 (MQ=255) aaTTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAAc < 2:200302/149‑1 (MQ=255) gAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCAc < 2:4826035/149‑1 (MQ=255) gCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGttg > 2:3892739/1‑148 (MQ=255) ccACACAGGGTTATCGCACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGATTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGtttt < 2:3026931/149‑1 (MQ=255) ccAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCATACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGtttt < 2:2499313/149‑1 (MQ=255) aaaCAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTcc > 2:1278925/1‑149 (MQ=255) aaCAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTGTTTGTTTTTATGGTTGATAACCATGTTAAAAGTTTAGAGGTTGTTAACATTTACGGAAAGGCACCCTTGTTTTacc > 1:2595244/1‑149 (MQ=255) aaCAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTGTTTGTTTTCATGGTTAATAACCATGTAAAACGTTTAGAGGTTGGTCACAATTCCGTAACGTCACGATGGTTTTacc > 1:36205/1‑149 (MQ=255) aGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTGTTTGTTTTAATGGTTAATCACCAATTAAAAACTTTCGAGGTTTATCACCTTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTACCCAc > 1:2387102/1‑149 (MQ=255) gggTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTTTTTTAATTGTTAATAAACAATTAAAAAGTTTAGATGTTGTTAACAATTACGTAACGTCACGATGGTTTTGCCAACt > 1:1346849/1‑149 (MQ=255) gTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACtca < 2:3439783/149‑1 (MQ=255) gTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTACATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAAAAAACATTTAAAAAGTTTAGAGGGTGATAACAATTACGTAACGTAACGATTGTTTTAACAACtaa > 2:3561612/1‑147 (MQ=255) aTCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCATTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATAACATTTCAGTAACGTAACGAAGGTTTTCCCAACtaagtc > 2:2770396/1‑149 (MQ=255) cGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACtcagtcag < 1:2904384/149‑1 (MQ=255) cGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATGTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACtcagtcag < 2:1644242/149‑1 (MQ=255) aaCTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGa < 1:1400673/149‑1 (MQ=255) aaCTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGa < 1:1011141/149‑1 (MQ=255) ccTGGGTACTCAGGTCGAAAACTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGAt < 1:1666932/148‑1 (MQ=255) tACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTGTTTTTTTTAATTGTTTATAACCATGTAAAAAGTTTAGAGGTTGATCACATTTCCGTAACCTCACGATGGTTTTAACCACACAGTCAGGATTAAAca > 1:2270022/1‑148 (MQ=255) tCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACtgtg < 2:2805031/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTgg > 2:4529991/1‑149 (MQ=255) ggTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGt < 2:1510567/149‑1 (MQ=255) ggTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGt < 1:841085/149‑1 (MQ=255) ggTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTAATGGGTAATCACCAAGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACCTTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTAAGTCCGGATTAAACTGTgggg > 2:28196/1‑148 (MQ=255) ggTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTGTTTTTTTTAAATGTTAATAACCAAGTAAAAAGTTTAGAGGGTGTTCACCGTTCCCGAACCTCCCCATGGGTTTACCCACCCCGGCCCGCTTAAACGGTgggg > 1:1035007/1‑148 (MQ=255) tCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTTTTTTCATGGTTAATAACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTTTTCACATTTACGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTggggaa > 1:3880813/1‑146 (MQ=255) tCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCa < 1:4000765/149‑1 (MQ=255) tCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGGTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCa > 2:2154497/1‑149 (MQ=255) tCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGaaa < 1:1094915/149‑1 (MQ=255) tCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTAATGGTTAATAACCATTTAAAACGTTTCGAGGTTTTTCACATTTACGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGTTTAAAATGTTGGGCAGCGgaa > 1:5171839/1‑149 (MQ=255) aaCGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTGATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGTTCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGCTTAAACGGTGGGTGAGCGCAAccg > 2:1391674/1‑147 (MQ=255) aCGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTAATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTACGTAAAGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAAATGTGGGTCAGCGAAACGtt > 2:673555/1‑149 (MQ=255) cGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGttt < 1:3069498/149‑1 (MQ=255) cGCCAGACGCCTCCTGTCTTCATAAGGGGGCGAGTTGGTTTTCCTGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGAGGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGCCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGttt < 2:470791/149‑1 (MQ=255) gCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTc < 2:5132312/149‑1 (MQ=255) ccAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGGTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGAGTAAACTGTGGGTCCGCGAAACGTTTCg > 2:2611285/1‑149 (MQ=255) cGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGAt < 2:2230023/149‑1 (MQ=255) cGCCTCCATTCTCCATAAGGGGGCGTTTTTGTTGTCATGGTTAATCACCATGGAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGAt < 2:2181762/149‑1 (MQ=255) ctcctTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGATGga < 1:1746530/149‑1 (MQ=255) ctcctTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATAACCATGTAAAAAGTTTCGAGGTTGATCACATTTACGTAAAGTCAAGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAAATGTGGGTCAGCGAAAACTTTAGCAGATGga > 2:133031/1‑149 (MQ=255) tcctTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTTTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGATGgag < 1:3247281/149‑1 (MQ=255) tcctTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGATGgag < 1:1534623/149‑1 (MQ=255) tcctTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCAATTAAAAAGTTTCGAGGTTGATAACAATTACGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACAAAGTCAGGATTAAACAGTGGGTCAGCGAAAACATTAGCTGATggtg > 2:3218147/1‑147 (MQ=255) ctTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTTTTTTCATGGTTAATCACCAATTAAAACGTTTCGATGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGATGGAGaa > 2:426947/1‑149 (MQ=255) tcATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGATGGAGAAAAAAAt < 2:4829678/149‑1 (MQ=255) aTAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGATGGAGAAAAAAATGa < 2:753872/149‑1 (MQ=255) tAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGATGGAGAAAAAAATGaa < 2:925856/149‑1 (MQ=255) ggggCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGATGGAGAAAAAAATGaaaaaa < 2:4150069/149‑1 (MQ=255) ggggCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGATGGAGAAAAAAATGaaaaaa < 1:4454481/149‑1 (MQ=255) gTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGATGGAGAAAAAAATGAAAAAAGGCAc < 2:2595244/149‑1 (MQ=255) | CGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCCAAACAGGGTTATCGAACTGGGTACTCAGGTCGAAATCTAACGCCAGACGCCTCCTTTCTTCATAAGGGGGCGTTTTTGTTTTCATGGTTAATCACCATGTAAAACGTTTCGAGGTTGATCACATTTCCGTAACGTCACGATGGTTTTCCCAACTCAGTCAGGATTAAACTGTGGGTCAGCGAAACGTTTCGCTGATGGAGAAAAAAATGAAAAAAGGCACC > CP009273/3926431‑3926725 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |