Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 576,183 | 0 | G | T | 10.1% | 569.6 / 10.2 | 186 | intergenic (‑282/‑107) | ylcI/nohD | DUF3950 family protein, DLP12 prophage/DLP12 prophage; DNA packaging protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (104/53); new base T (2/26); total (106/80) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.60e-09 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
GTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTC‑GCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCG > CP009273/576035‑576331 | gTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTC‑GCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATg < 1:2298617/149‑1 (MQ=255) gTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTC‑GCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATg > 1:1070490/1‑149 (MQ=255) gTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTC‑GCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATg < 1:2057618/149‑1 (MQ=255) 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tAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTTTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCgg > 1:2497572/1‑149 (MQ=255) attGTTTTTATTTAAAATACCCCCTGAAAATAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGt < 2:1965300/147‑1 (MQ=255) | GTTGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTC‑GCTATTTATGAAAATTTTCCGGTTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCG > CP009273/576035‑576331 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |