Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,429,253 | 0 | G | T | 8.5% | 762.6 / 6.1 | 264 | pseudogene (13/51 nt) | ttcC | pseudogene, prophage Rac integration site ttcA duplication;Phage or Prophage Related |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (141/83); new base T (2/37); total (143/121) | |||||||||||
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |