| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,469,871 | T→A | 6.8% | intergenic (‑72/+95) | yheO ← / ← fkpA | putative PAS domain‑containing DNA‑binding transcriptional regulator/FKBP‑type peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase (rotamase) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,469,871 | 0 | T | A | 6.8% | 851.3 / 3.3 | 277 | intergenic (‑72/+95) | yheO/fkpA | putative PAS domain‑containing DNA‑binding transcriptional regulator/FKBP‑type peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase (rotamase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (137/110); new base A (23/5); total (162/115) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.79e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
AAATCGGTCTGGTCGAAAGGACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGC > CP009273/3469723‑3470019 | aaaTCGGTCTGGTCGAAAGGACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATTCGGGTAACt > 1:1578460/1‑149 (MQ=255)aaaTCGGTCTGGTCGAAAGGACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACt > 1:4562409/1‑149 (MQ=255) ggTCGAAAGGACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATAc < 2:1625186/149‑1 (MQ=255) ggTCGAAAGGACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTGGACATTTCAGGGCAGGCTCAATAATTATTCGGGTTACTAAAATAATAc > 1:2173311/1‑149 (MQ=255) gTCTAAAGGACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACa < 2:378839/149‑1 (MQ=255) gTCGAAAGGACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTGACTTTTAAGGGGAGGCTCATTAATGTTGCGGGTAACAAAATTAATaaa > 1:2786541/1‑147 (MQ=255) gTCGAAAGGACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACa < 2:381145/149‑1 (MQ=255) tCGAAAGGACGTTGCTCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAg < 2:4828241/149‑1 (MQ=255) tCGAAAGGACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAg < 2:1845489/149‑1 (MQ=255) tCGAAAGGACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACATTTAAGGGCAGGCGCAGTAAAGTTGCGGGTAACTAAATTAATACAg > 1:2285482/1‑149 (MQ=255) gAAAGGACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATTATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCg > 2:569297/1‑149 (MQ=255) aGGACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAg > 2:4449952/1‑149 (MQ=255) ggACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATTCGGGTAAATAAAATAATACAGCGGAgg > 2:3091882/1‑149 (MQ=255) gACGTTTATCCAGTAAATCCAACTCACTTGTTTCGTTGTTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGt < 1:1793124/149‑1 (MQ=255) gACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAAATTTTAAGGGCAGGCTCATTAATTATTCGGGTAACTAAATTAATAAAGCCGAGGt > 1:1878189/1‑149 (MQ=255) gTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTcc < 2:2057445/149‑1 (MQ=255) ttGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCg > 1:4283135/1‑149 (MQ=255) gATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATAAAGCGGAGGTTCCGCt > 2:1582721/1‑149 (MQ=255) gATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTGAACATTTAAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAAATAAATTAATAAATCGGCGGTTCCGCt > 1:4200757/1‑149 (MQ=255) aTCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCtt > 2:4904756/1‑149 (MQ=255) cAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTcc < 2:317492/149‑1 (MQ=255) cAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACATTTCAGGGCAGGCTCATTAAAGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTcc > 2:3986276/1‑149 (MQ=255) gTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTGTACATTTCAGGGCCGGGTCATTAATGATGCGGGGAACTAAATTAATAAAACGGAGGGTGCGCGTTACAg > 1:487337/1‑149 (MQ=255) tAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGAGGGTAACAAAAATAATACAGCGGAGGTTACGCTTTCCAGc > 2:20332/1‑149 (MQ=255) aaTCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAACTTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCAc < 2:3449436/149‑1 (MQ=255) aaTCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCAc > 1:353450/1‑149 (MQ=255) aaTCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAAATTTTGAGGGCAGGCGCCTTAATTATGGGGGTTACTAAAATAATAAAGCGGAGGTTGCGCTTTACAGCAc > 1:4047772/1‑149 (MQ=255) aaTCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAAAATTTCAGGGCAGGCTCAATAATTATGCGGGTTACAAAAATAATAAAGCGGAGGGTCCGCTTTCCAGCAc > 1:1668790/1‑149 (MQ=255) ccAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTACAGCACTaa > 2:1549310/1‑149 (MQ=255) cAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACATTTCAGGGCAGGCGCATTAAAGATTCGGGTAACAAAAATAAAAAAGCGGAGGTTCCGCATTACAGCACAAAt > 1:2761844/1‑149 (MQ=255) aaCTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAAtt < 2:3394384/149‑1 (MQ=255) aCTCACTGGTTTCGTTGTTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATta < 1:453993/149‑1 (MQ=255) cTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATtat < 2:4880789/149‑1 (MQ=255) tCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATtata < 2:369586/149‑1 (MQ=255) tCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTGAAAATTTAATGGGAGGCTCATTAATTATTAGGGTTACAAAAATAATAAAACCGAGGTTCCCCATTCAAGCACTAAAtata > 1:15098/1‑149 (MQ=255) cACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTAAGGGCAGGCTAAATAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTACGCTTTCCAGCACTAATTatat > 2:2265450/1‑149 (MQ=255) aCTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATc < 1:1910766/149‑1 (MQ=255) aCTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATAAAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATc > 2:272711/1‑149 (MQ=255) tttCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGcc < 1:4838545/149‑1 (MQ=255) ttCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCt < 1:5104171/149‑1 (MQ=255) ttCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCt < 2:4334526/149‑1 (MQ=255) ttGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTAAGGGCAGGCTCATTAATGATTCGGGTAACTAAAATAATAAAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATACGGCCTGtaa > 2:2184159/1‑149 (MQ=255) ttGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACATTTAAGGGCAGGCTCAATAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAACGGAGGTTCCGCATTCCAGCACAAATTATATCCGGCCTGtaa > 1:4630832/1‑149 (MQ=255) ttGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTGAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGCGGGTCCGCTTTCCAGCACGAATTATATCCGGCCGGtaa > 1:5108489/1‑149 (MQ=255) tGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGtaat < 2:5147295/149‑1 (MQ=255) tGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACATTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGGAACTAAATTAATACAGCGGCGGTTCCGCTTTCCAGCACTAAGTATATCCCGCCGGtaat > 1:2946208/1‑149 (MQ=255) ggTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAAATTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATTCGGGTAAATAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACAAAATATATCCGGCCTGtaata > 1:1921589/1‑149 (MQ=255) aaaaGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATaaaaa < 1:1693166/149‑1 (MQ=255) aaaGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATaaaaaa < 1:1104628/149‑1 (MQ=255) aaaGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATAAAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATaaaaaa > 2:2447165/1‑149 (MQ=255) cgCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAAc < 1:3934731/148‑1 (MQ=255) aGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAAc < 1:2465300/149‑1 (MQ=255) aGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCATTCCAGCACAAATTATATACGGCCTGTAATAAAAAAAc > 2:3869552/1‑149 (MQ=255) ccTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTAAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGGAACTAAATTAATAAAGCGGAGGTTACGCTTTACAGCACTCATTATATCCGGCCGGTAATAAAAAAAaagccg > 1:4920210/1‑149 (MQ=255) ggACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAAACGCCGCCt > 1:2094951/1‑149 (MQ=255) gACATGAAAAAAAACACTCGTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCTGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTg < 2:4200345/149‑1 (MQ=255) aattaaaaaaaaCACCCCTGTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGATGGCTCATTAATGAGGCGGTTAACAAAATTAATACAGGGGTGGTTCCGCTTTCCAGAACTAATTATATCGGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGt < 2:207489/145‑1 (MQ=255) tGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCCGGCTCATTAATTGTTCGGGTAACTAAATTAATAAATCGGTGGTTACGCTTTACAGCACTAAATATATCCGGCCTGTAAAAAAAAAAACGCCCCCAGGTCa > 2:3046465/1‑149 (MQ=255) aaaaaaaaCACTCCTTTTCCGTAGCCTGTCGTTAATTTTTCTGGGCAGGCTAATTATTTATGCGGGTAAATAAATTAATACAGCGTCGTTTCCGCTTTCCAGCAATAATTTTATCCGGCCTTTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAgg < 1:788595/149‑1 (MQ=255) aaaaaaaaCACTCCTTTTCCGGTGCCTGTCGTTAACTTTCCCGGGCAGGCACTTTATTTATGCGGGTAACTAAATTAATACCGCGGTGGTACGGCTTACCACCAATAATTATACCCGGCGTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAgg < 1:796082/149‑1 (MQ=255) aaaaCACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAggcggc > 2:2387616/1‑149 (MQ=255) aaCACTCTTTTTCAGGAGCCTGTCTTTAACTTTTCCGGGCAGGATCATTAATGTTGGGGGTAAATAAATTAATACAGCGTTGGTTCCGATTTCCAGCACTATTTATATCCGGCCTTTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGcggcgg < 1:3835719/149‑1 (MQ=255) acacTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGAAGGCTAATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGTGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTTTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGt < 2:4499037/149‑1 (MQ=255) cacTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACTGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGtt < 2:1920512/149‑1 (MQ=255) cacGCCTTTTCCGGAGCCTGGCGTAAACTTTTCGGGGCAGGCTAATTAATTATGGGGTTAAATAAATTAATACAGCGGTGGTTCCGCTTTCCCGAACTAATTATCTCCGGCCTGAAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGtt < 1:4741462/149‑1 (MQ=255) cTCCTTTTCCGGCGCCTGTCGTTAAATTTACCGGGCTGGCTCATTAATGTGGGGGTTAACTAAATAAATACCGGGGTGTTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATACCCGGCCTTTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCt < 1:2543918/149‑1 (MQ=255) cTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGGTCt > 2:2791307/1‑149 (MQ=255) ccTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAAATAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACAAAATATATCCGGCCTGTAATAAAAAAAACGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGGTCTTa > 1:4686706/1‑149 (MQ=255) cTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTCATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGGTCTTaa > 2:3825380/1‑149 (MQ=255) cTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTaa > 2:1213848/1‑149 (MQ=255) cTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACAAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTACAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAAACGCCCCCGGGTCCGGCGGCGGGTCTTaa > 2:1762509/1‑149 (MQ=255) ttttCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTAAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGGTACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTACCGCACTAAGTGTCTCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCGGGTGAGGGGGGGGGTCGTagg > 2:3200763/1‑147 (MQ=255) cAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCAGGTCCGGCGGCGGTTCTTAATGCtt > 2:4228051/1‑149 (MQ=255) cAGGAGCCTGTCGTTAACGTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCtt < 2:4274153/149‑1 (MQ=255) aGGAGCCTGTCGTTAAATTTTCAGGGCAGGCTAATTAATGATTCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCAGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAAAGCTTa > 2:704864/1‑149 (MQ=255) ggAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAAAAAAAAAAACGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTAt > 2:4756660/1‑149 (MQ=255) gAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATTATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTAtt < 2:2549848/149‑1 (MQ=255) gTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTat > 2:45650/1‑148 (MQ=255) gTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAg > 2:3749403/1‑149 (MQ=255) tCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGc > 1:1192601/1‑149 (MQ=255) gTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAg > 2:1066201/1‑149 (MQ=255) atttttCCGGGCTGGCAAATAATTTATGGGGTAAAATAATTTAATACGGGGTTGTTTCCGTTTCCCACAACTATTTATATCCGCCATTAAAAAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATc < 1:2721906/147‑1 (MQ=255) aCTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGACTc > 1:2979922/1‑149 (MQ=255) ttttCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTg > 1:121141/1‑149 (MQ=255) ttCAGGGCAGGATCATTAATTATGCGGGTAACTAAATTAATACCGCGTAGTTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCg < 2:3744107/149‑1 (MQ=255) cgggCAGGCTAATAAATTTGGGGGGTAACTAAATCAATACCCCGGCGGTCCCGCTTACCCCCAAAAATTATATCCGCCCTTAAAAAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCt < 1:3620592/148‑1 (MQ=255) gggCAGGCTCATTATTGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGAGGCtt < 2:4662619/149‑1 (MQ=255) gCAGGCTCATTATTGAGGCGGGTAACAAAATTAATACCGCGGTGGTCCCGCTTTCCAGCACAAATTATATCCGGCCTGAAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTc < 1:322163/149‑1 (MQ=255) aGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGc > 1:2217920/1‑149 (MQ=255) ggCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTGCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCa > 1:3187786/1‑149 (MQ=255) cTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATc < 2:4711120/149‑1 (MQ=255) tCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCa > 2:3264135/1‑149 (MQ=255) taaaTGAGGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCt < 2:1780366/147‑1 (MQ=255) tAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCtt > 2:2821614/1‑149 (MQ=255) aaTGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTc < 2:2953049/149‑1 (MQ=255) tgCGGTTAACTAAAGTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCt < 2:4096036/149‑1 (MQ=255) gCGGGTAAATAAATTAAAACCGCGGAGTTTCCGCTTTCCATCACTAATTATATCGGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCtt < 1:3256201/149‑1 (MQ=255) cGGTTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTTTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCttt < 1:807308/149‑1 (MQ=255) gTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCa > 1:4178719/1‑149 (MQ=255) aaCTAAATTAATACAGCGGTGGTTCCGGTTTCCCGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATc < 2:3645239/149‑1 (MQ=255) | AAATCGGTCTGGTCGAAAGGACGTTGATCCAGTAAATCCAACTCACTGGTTTCGTTGGTTAAAAGCGACCTGGACATGAAAAAAAACACTCCTTTTCAGGAGCCTGTCGTTAACTTTTCAGGGCAGGCTCATTAATGATGCGGGTAACTAAATTAATACAGCGGAGGTTCCGCTTTCCAGCACTAATTATATCCGGCCTGTAATAAAAAAACCGCCGCCTGGTCAGGCGGCGGTTCTTAATGCTTATTTTTTAGCAGAATCTGCGGCTTTCGCATCAGCTTCCGGCTTTGCATCAGC > CP009273/3469723‑3470019 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |