| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,525,215 | A→C | 11.8% | L195R (CTG→CGG) | yhgE ← | DUF4153 family putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,525,215 | 0 | A | C | 11.8% | 718.3 / 17.0 | 268 | L195R (CTG→CGG) | yhgE | DUF4153 family putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (87/138); new base C (38/2); total (125/143) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.04e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
AATCGCGCTCAGGCCCGTAAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAG > CP009273/3525067‑3525363 | aaTCGCGCTCAGGCCCGTAAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTTAACCTGTATGTGTTAGCGCGAGGGTCACCGCCa > 2:1720217/1‑149 (MQ=255) aTCGCGCTCAGGCCCGTAAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTAGCGCGAGGCTCACCGCCAg > 2:4511029/1‑149 (MQ=255) gcgcTCAGGCCCGTAAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGAATGTGTTCGCGCGAGGATAACCGCCCgcgc > 1:1874147/1‑149 (MQ=255) gcTCAGGCCCGTAAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCgg < 2:5154908/149‑1 (MQ=255) tCAGGCCCGTAAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAACGTTACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCCCCAGCGCggga > 1:2708430/1‑147 (MQ=255) gCCCGTAAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTACCGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCa < 2:4556812/149‑1 (MQ=255) gCCCGTAAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCa < 1:3743651/149‑1 (MQ=255) cccGTACACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTACCGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAg < 2:1391619/149‑1 (MQ=255) cGTAAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAACGGGACTGTGTTCGCGCGAGGATAACCCCCAGCGCGGTAAacacac > 2:3791051/1‑149 (MQ=255) aaaCGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTa < 1:2904073/149‑1 (MQ=255) aCGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATAACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCAAAc > 2:2096624/1‑149 (MQ=255) gCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTg < 1:1022994/149‑1 (MQ=255) aGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTgag < 2:2426693/149‑1 (MQ=255) aGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTgag < 2:399885/149‑1 (MQ=255) ggTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGat < 2:1838343/149‑1 (MQ=255) ggTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGat < 2:4182513/149‑1 (MQ=255) gTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACAGTGTTCGCGCGAGGATCACCCCCCCCGCGGTAACCAGACCAAACGTGAGata > 1:1271884/1‑149 (MQ=255) tgatAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGataaata < 1:4351666/149‑1 (MQ=255) tgatAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGataaata < 1:5044174/149‑1 (MQ=255) tgatAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAACTTACAGTGTTCGCGCGAGGATCAACGCCCCCGCGGTAACCAGACCGAACGTGAGctaaatt > 2:3300039/1‑148 (MQ=255) atAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGAtaaataaa < 1:277198/149‑1 (MQ=255) atAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGGGACTGGGTTCGCGCGAGGATCAACCCCCGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGAtaaataaa > 1:217688/1‑149 (MQ=255) tAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTTAACATGTCTGTGTTGGCGCGAGGATAACCCCCCCCGCGGGAAACACACCAAACGTGAGAtaaaaaaaa > 1:4381675/1‑148 (MQ=255) tAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTTAAAGTGACAGTTTTGGCGCGAGGTTCACCCCCCCCGCGGTAACCACACCAAAAGTGAGAtaaaaaaaa > 1:1769711/1‑148 (MQ=255) aaCATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCa < 2:3041930/149‑1 (MQ=255) acctCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAg < 2:4704869/146‑1 (MQ=255) aCATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGAATGTGTTCGCGCGAGGATCACCCCCCCCGCGGTAACCACACCAAACATGTGATAAAAAAAACaa > 1:3981739/1‑148 (MQ=255) aCATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAACGTGTCTGTGTTCGCGCGCGGATAACCGCCACCGCGGTAAACCGACCAAAAGTGAGATAAATAAAcccg > 1:3438315/1‑147 (MQ=255) aTCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACGCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTTAAAGTTTATGTTTTGGCGCGAGGATAACCGCCAGCGCGGTTACCAGAACGAAAGTTAGAtaaataaaaaacta > 1:4899201/1‑143 (MQ=255) aTCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAAACTGCCAGGGGTCGCGCCAGGATCACCCCCCCCCCGGTAACCACACCAAACCTGAGAAAAAAAAAccccgc > 1:4204522/1‑145 (MQ=255) aTCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTGTGAATAGAGTCGAGTAAACCTGACGGTGTTCGCGCGCGGATCACCCCCCCCCCGGGAACCACACCAAACCGGAGATAAAAAAACCacac > 1:4204561/1‑146 (MQ=255) aTCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCAGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTTAATAGAGTCGAGTAAAAGTGAAAGTTTTAGCGCGAAGATAAAAGAAACCCCGCTAACCAGACCAAAAAAGAGAtaaaaaaaaaaatc > 1:318582/1‑143 (MQ=255) aGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGt < 2:4990433/149‑1 (MQ=255) ttAGCATTGTTACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCa < 1:4469464/149‑1 (MQ=255) ttAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGGCTGTGTTCGCGCGAGGATCACCCCCCCCGCGGGAACCACCCCGAAAGGGAGATAAATAAACCACTCGGTTGCa > 1:4521338/1‑149 (MQ=255) ttgCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCaa < 1:2263164/147‑1 (MQ=255) gCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAACTGACAGGGTTCGCGCCAGGATCCCCCCCCCCGCCGGAACCACACCAAACCGGACCTAAAAAAACCACGCGGGTGCcaaa > 2:3496889/1‑149 (MQ=255) aaTGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCaaaaaa < 2:1893572/149‑1 (MQ=255) aaTGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGACAGGGTTCGCGCGAGGATAACCGCCAGCGCGGTAACCAGTCCTAACCTGAGATAAATAAACCCGTCGGGTGCaaaaaa > 2:206234/1‑149 (MQ=255) aTACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTAGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCGAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAAAGc > 2:4730570/1‑149 (MQ=255) tACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCg < 2:2824520/149‑1 (MQ=255) aCTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCCGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGt > 2:5172878/1‑149 (MQ=255) tAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTAt < 1:4758141/149‑1 (MQ=255) tAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAAAGTGACGGTGTTGGCGCGCGGATCACCGCCCGCGCGGTAACCAGACCAAACGTGTGATAAAAAAACCAGTCGGGTGCAAAAAATAGCGTAt > 2:3513390/1‑149 (MQ=255) cagcaACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGaaaa < 2:3215272/149‑1 (MQ=255) agcaACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGaaaaa < 1:1579896/149‑1 (MQ=255) gcaACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCAAACGTGAGATAAAAAAACCAGTCGGTTGGAAAAAATAGCGTATTGtaaaaa > 2:3285192/1‑148 (MQ=255) aaCCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTTAACGTGTCTGGGGTCGCGCGAGGGTCACCCCCAGCGCCGTAACCAGACCGAAAGGGAGGAAAATAAACCACTCGGGTGCCAAAAAGAGCCTATTGaaaaaact > 2:4357023/1‑146 (MQ=255) aCCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGACTGTGTTCGCGCGAGGGTAACCGCCCGCCCCGGAACCAGACCAAAACTGAGGTAAAAAAAACACTCGGGTGCAAAAAAAAGCGTATTTtaaaaactt > 1:4461894/1‑145 (MQ=255) ccGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCAAAACTGAGATAAATAAAACAGTAGGGTTCAAAAAAGAGCGGATTGAAAAACGTGAtt > 2:3870504/1‑148 (MQ=255) gTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGcc < 2:2779441/149‑1 (MQ=255) ttAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGt < 2:1247658/149‑1 (MQ=255) tAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGtt < 1:2491693/149‑1 (MQ=255) tAACGTGAACAACTTTGGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGtt < 1:3070861/149‑1 (MQ=255) aaCGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGttt < 1:3255279/149‑1 (MQ=255) aCGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATAACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAAAGTGATGCCAACAAATTTa > 2:3696590/1‑149 (MQ=255) gTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCTGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTaaa < 1:3569886/149‑1 (MQ=255) gTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAAAGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCCCCCGCGCGGTAACCAGAACTAACGTGAGATAAATAAACCACTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTTAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTaaa > 2:4879249/1‑149 (MQ=255) tGAACAACTTTTGAATAGAGTCGAGTAAAAGTGACTGTGTTCGCGCGAGGTTCACCCCCACCGCGGTAACCAGCCCGAACGTGTGATAAATAAAACAGTCGGTTTCAAAAAAGAGCGGATTGAAAAACGTTTTGCCCACAACGTTaaaa > 2:1123232/1‑148 (MQ=255) acatcTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAaacaac < 2:2586409/149‑1 (MQ=255) acaacTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAaacaac < 1:4309795/149‑1 (MQ=255) caacTTTTGAATAGAGTCGATTAAAACTTACGGTGTTCCCGCGAGGATCACCCCCACCGCCGTAACCACAACAAACAGGAGATAAAAAAACCAGTAGGTTTCAAAAAAGAGCGGATTTAAAAACCAGAAGCCCACCAATTTAaaaaaca > 2:3115221/1‑148 (MQ=255) caaaTTTTTAATAGAGTCGATTAAACTTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAact < 2:5069333/149‑1 (MQ=255) aacTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAactc < 2:871255/149‑1 (MQ=255) aattttTAATAGTGTCGATTAAACGTTACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGGTTTAACCAGACCTAAGGTGTGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAATAGCGTTTTGAAAAACTTGATGCCAACAAGTTTAAACAactca < 1:3288854/147‑1 (MQ=255) aattttGAATAGAGTCTTTAAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGAACACCGCCAGCGCGGTAACCATACATAACGTGATATAAAAAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAactca < 1:3115807/147‑1 (MQ=255) agTCTATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGATATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTaaa < 2:1315588/149‑1 (MQ=255) gTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTaaaa > 1:3210046/1‑149 (MQ=255) gTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTaaaa > 1:619561/1‑149 (MQ=255) ttAAACTTTACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGTTAACCAGACATAACGTTATATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTG‑AAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCa < 1:4579024/149‑1 (MQ=255) ttAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGTTAACCAGACCAAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTG‑AAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCa < 1:1968563/149‑1 (MQ=255) aaCGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGc > 2:1597429/1‑149 (MQ=255) aCGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGcc > 1:341056/1‑149 (MQ=255) aCGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGcc > 2:15249/1‑149 (MQ=255) gTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCAc > 1:3539593/1‑149 (MQ=255) tGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACg > 1:3399968/1‑149 (MQ=255) aCTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTc < 2:1903491/149‑1 (MQ=255) cTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCa < 2:4204561/149‑1 (MQ=255) tgtgTTCGCGCGTGGAACCCCGCCAGCGGGGTAACCAGACCTAACTTTCTATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCaa < 1:3900738/149‑1 (MQ=255) ggtTCGCGCGAGTATCACCGCCTGCGCGGAAACCAGACCTAACTTGATATAAATAACCCAGTCGGTTGAAAAAAAGAGCTTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGc < 1:960160/148‑1 (MQ=255) ttCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCa > 2:4816128/1‑149 (MQ=255) tCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCAt < 2:74355/149‑1 (MQ=255) cgcgcgAGTATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGATATAAATAAACCAGTCGTTTGCAAAAAAGAGCTTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCAtt < 2:4774493/149‑1 (MQ=255) cgcgcgAGTACCACCGCCAGCGCGTTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAACCCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCAtt < 1:3221148/149‑1 (MQ=255) gcgcgAGGATCACCGCCAGCGCGTTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTg < 1:4248574/149‑1 (MQ=255) gcgcgAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTg < 1:2044509/149‑1 (MQ=255) cgAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCg > 1:151996/1‑149 (MQ=255) cgAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCg > 1:4930861/1‑149 (MQ=255) gcggATCCCCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCga < 1:1053126/147‑1 (MQ=255) gAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCga > 1:5195518/1‑149 (MQ=255) ggATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCgaga < 2:2639231/149‑1 (MQ=255) tCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGaaaa > 2:4458062/1‑149 (MQ=255) tCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGaaaa > 1:4698133/1‑149 (MQ=255) cACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGaaaaa > 2:4018178/1‑149 (MQ=255) cACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGaaaaa > 2:2402563/1‑149 (MQ=255) aCCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAAt < 2:4493165/149‑1 (MQ=255) cGCCAGCGCGGTAACCAGACCTACCGTGAGATAAAAAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCa < 1:554926/149‑1 (MQ=255) aGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAg > 1:783032/1‑149 (MQ=255) aGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAg > 1:4097270/1‑149 (MQ=255) aGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAg > 1:2080821/1‑149 (MQ=255) | AATCGCGCTCAGGCCCGTAAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGTATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAG > CP009273/3525067‑3525363 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |