Predicted mutation | |||||||
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JC JC | CP009273 | 3,795,902 | IS5 (+) +4 bp | 8.1% | coding (514‑517/1020 nt) | waaR ← | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase |
New junction evidence | |||||||||||
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? | CP009273 | 3795902 = | 158 (0.650) | coding (517/1020 nt) | waaR | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase | |||||
* | ? | CP009273 | = 2283592 | NA (NA) | 16 (0.060) | 8/278 | NT | 8.8% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | CP009273 | = 3795905 | 161 (0.660) | coding (514/1020 nt) | waaR | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase |
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ATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGGCGCCT > CP009273/3795753‑3796051 | aTCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACAcc > 1:2886532/1‑150 (MQ=255) tCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCt > 1:469641/1‑150 (MQ=255) tCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCt < 1:3496490/150‑1 (MQ=255) ccTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTa > 1:3785556/1‑150 (MQ=255) ccTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTa > 1:2546430/1‑150 (MQ=255) tGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAAc < 2:3412249/150‑1 (MQ=255) tGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAAc < 1:194768/150‑1 (MQ=255) aTCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGa > 1:940252/1‑150 (MQ=255) 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ttttGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTccc < 2:2301823/150‑1 (MQ=255) tttGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCcca < 1:2372130/150‑1 (MQ=255) tttGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCcca > 2:2181688/1‑150 (MQ=255) attattTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgata < 1:832985‑M2/150‑26 (MQ=255) attattTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgata < 1:2960892‑M2/150‑26 (MQ=255) attattTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAg > 1:3995490/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGc > 2:580904/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGc < 1:2742655/150‑1 (MQ=255) cTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCtt < 1:1023686/150‑1 (MQ=255) cATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCtt < 2:1083685/150‑1 (MQ=255) aTTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTc < 1:855929/150‑1 (MQ=255) tttAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCt > 1:580336/1‑150 (MQ=255) ttAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTg > 1:1476126/1‑150 (MQ=255) ataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTg > 2:1751897‑M2/106‑150 (MQ=255) aacATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTa > 2:4274501/3‑150 (MQ=255) 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tAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGatat > 2:194423/1‑150 (MQ=255) aaaGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATc > 2:1111122/1‑150 (MQ=255) agaatttccccgcttattcgcaccttccCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCt > 1:1691131‑M2/29‑150 (MQ=255) aGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTg > 1:3076563/1‑150 (MQ=255) tAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCa > 1:1416358/1‑150 (MQ=255) aaCCTTTAGCAAGTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCAt < 2:540347/150‑1 (MQ=255) tttAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAg < 2:2039951/150‑1 (MQ=255) tAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGAt < 2:363404/150‑1 (MQ=255) cttattcgcaccttccCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATaa < 1:4309846‑M2/134‑1 (MQ=255) cAAGTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATaaa < 1:4146937/150‑1 (MQ=255) aaTTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAg > 2:4153363/1‑150 (MQ=255) tCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGAc < 2:2941437/150‑1 (MQ=255) tCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGAc > 1:889719/1‑150 (MQ=255) cccGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACt < 2:3709016/150‑1 (MQ=255) cGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACttt > 1:786301/1‑150 (MQ=255) gCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTa > 2:3745680/1‑150 (MQ=255) acacCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGgc < 1:382602/150‑1 (MQ=255) cacCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagattttcttg > 1:1932645‑M2/1‑7 (MQ=255) cacCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGgcg > 1:2352052/1‑150 (MQ=255) cacCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGgcg > 1:2522403/1‑150 (MQ=255) acCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagattttcttgt < 1:2650677‑M2/150‑145 (MQ=255) acCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGgcgc > 1:1811991/1‑150 (MQ=255) acCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGgcgc > 2:3120999/1‑150 (MQ=255) acCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGgcgc > 1:1226915/1‑150 (MQ=255) ccTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagattttcttgtc < 2:2665482‑M2/150‑146 (MQ=255) cCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCCGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTGTAGGCGcc > 1:4065196‑M2/2‑150 (MQ=255) cTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGGCGCCt > 1:3619332/1‑150 (MQ=255) | ATCCTGATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGGCGCCT > CP009273/3795753‑3796051 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |