Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 602,045 | C→A | 7.6% | L265L (CTG→CTT) | ybdK ← | weak gamma‑glutamyl:cysteine ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 602,045 | 0 | C | A | 7.6% | 1052.1 / 40.7 | 280 | L265L (CTG→CTT) | ybdK | weak gamma‑glutamyl:cysteine ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (133/125); new base A (9/13); total (142/138) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.80e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
AGCAATCGCAAGGTATCTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCA > CP009273/601896‑602193 | gCAATCGCAAGGTATCTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCa > 2:1760284/1‑150 (MQ=255) aaTCGCAAGGTATCTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTAAGt < 2:1013344/150‑1 (MQ=255) cGCAAGGTATCTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAAc > 1:1707609/1‑150 (MQ=255) cAAGGTATCTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGGGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCa < 1:3236837/150‑1 (MQ=255) gTATCTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTgg < 2:4005240/150‑1 (MQ=255) gTATCTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTgg > 1:192758/1‑150 (MQ=255) gTATCTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTAAGTAACCAGTgg < 2:268843/150‑1 (MQ=255) tATCTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTggg > 2:3287535/1‑150 (MQ=255) aTCTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGc < 2:3170713/150‑1 (MQ=255) cTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCgg < 1:134669/150‑1 (MQ=255) ttCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCTACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGt < 1:407341/150‑1 (MQ=255) ttCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGt > 2:239998/1‑150 (MQ=255) ccGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAg > 2:2186836/1‑150 (MQ=255) ttAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCt < 2:853865/150‑1 (MQ=255) tgaGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCt < 1:2347528/148‑1 (MQ=255) aGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTAAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGa > 2:1631196/1‑150 (MQ=255) ggTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAAtt > 2:135686/1‑150 (MQ=255) ggTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAAtt < 2:1269312/150‑1 (MQ=255) cgacgaTCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAAt > 1:2878587/1‑150 (MQ=255) gacgaTCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATc < 2:841446/150‑1 (MQ=255) gacgaTCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATc < 1:3482032/150‑1 (MQ=255) gacgaTCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAACCTGAATTAATc > 2:1072491/1‑150 (MQ=255) gaTCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCg > 2:3765937/1‑150 (MQ=255) tctcCAGTGTGTGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGcc > 1:3753599/1‑150 (MQ=255) tctcCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGcc > 2:1650566/1‑150 (MQ=255) ctcCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCa < 1:145374/150‑1 (MQ=255) gtgtGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATAttt < 2:1829476/150‑1 (MQ=255) tgtgCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTa < 2:3237011/150‑1 (MQ=255) gtgCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTAc < 1:870192/150‑1 (MQ=255) tgCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACt < 1:1532414/150‑1 (MQ=255) tgCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACt < 2:4145745/150‑1 (MQ=255) tgCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACt < 2:684198/150‑1 (MQ=255) tgCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCATGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACt < 1:3767688/150‑1 (MQ=255) gCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTg < 2:198583/150‑1 (MQ=255) ggATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCg > 2:3143383/1‑150 (MQ=255) gATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGt > 2:3151176/1‑150 (MQ=255) tCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTgg < 1:3933834/150‑1 (MQ=255) tCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTgg < 2:3898255/150‑1 (MQ=255) tgatgaCGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCtca > 2:3450301/1‑148 (MQ=255) tgaCGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAggg < 1:130191/150‑1 (MQ=255) cGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTa < 1:199789/150‑1 (MQ=255) cTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACg < 1:593901/150‑1 (MQ=255) cTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACg < 1:2734335/150‑1 (MQ=255) tCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACggg < 2:887957/150‑1 (MQ=255) tCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACggg < 1:2412546/150‑1 (MQ=255) gCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTAt < 1:2670151/150‑1 (MQ=255) cccATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATc > 1:3150428/1‑150 (MQ=255) cccATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATc > 2:4324144/1‑150 (MQ=255) tAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTAAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATc < 2:3689680/150‑1 (MQ=255) cGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCAcc > 1:3957939/1‑150 (MQ=255) gACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCAccc > 1:1422041/1‑150 (MQ=255) ccTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCt < 1:4192897/150‑1 (MQ=255) tGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTcc > 2:1887497/1‑150 (MQ=255) ggAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCa > 1:4263325/1‑150 (MQ=255) gAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTAAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCAc < 2:2305682/150‑1 (MQ=255) gAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTAAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCAc < 2:4182387/150‑1 (MQ=255) aaaCGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCAcc > 1:829107/1‑150 (MQ=255) aaaCGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTAAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCAcc > 2:495556/1‑150 (MQ=255) cGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTg > 1:3930819/1‑150 (MQ=255) cGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTg > 1:1240127/1‑150 (MQ=255) ggTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGc > 1:1097681/1‑150 (MQ=255) ggTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGc > 2:2415713/1‑150 (MQ=255) gAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCaaa > 2:3851477/1‑150 (MQ=255) aTTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAAt < 1:3956662/150‑1 (MQ=255) aTTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAAt < 1:3956756/150‑1 (MQ=255) aTTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAAt > 1:3583125/1‑150 (MQ=255) aTTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAAt > 1:2087482/1‑150 (MQ=255) tttATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTTGACTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATg < 2:2267900/150‑1 (MQ=255) tttATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATg > 2:1514073/1‑150 (MQ=255) ttATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGa > 1:2734884/1‑150 (MQ=255) ataCAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAATCGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAgg < 1:750356/150‑1 (MQ=255) ataCAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAgg > 1:1009659/1‑150 (MQ=255) ataCAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAgg > 1:1009579/1‑150 (MQ=255) cagcagGTAATCTTTTTCCTGAAGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACt > 2:553587/1‑150 (MQ=255) cagGTAATCTTTGTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTggg < 1:3051942/150‑1 (MQ=255) ccTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGt > 2:3775893/1‑150 (MQ=255) cTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTg > 2:174108/1‑150 (MQ=255) gATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCa > 2:3640749/1‑150 (MQ=255) aTGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAg < 1:4130055/150‑1 (MQ=255) aTGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAg > 1:1827111/1‑150 (MQ=255) gTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGAt < 2:1680446/150‑1 (MQ=255) ttAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCt > 1:1849149/1‑150 (MQ=255) tAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCtt > 2:3556391/1‑150 (MQ=255) tAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCtt > 2:3556082/1‑150 (MQ=255) tAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCtt > 2:144949/1‑150 (MQ=255) tAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCtt < 1:2603796/150‑1 (MQ=255) tAAACGGGCGTTCCGTAAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCtt < 1:465093/150‑1 (MQ=255) aaaCGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCttt < 1:3410950/150‑1 (MQ=255) aaaCGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCttt > 1:2265176/1‑150 (MQ=255) aaaCGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCttt > 2:4262000/1‑150 (MQ=255) aCGGGCGTTCCGTCAGTAAACAGTGGGCGGTATCCATAATAAATCCCGCCAAAATTAAAGAGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATACATCACCCGAACCTCCACCCTGCCAAAATGAGGACAGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTaa > 1:4014500/1‑150 (MQ=255) gggCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATg < 2:2557539/150‑1 (MQ=255) ggCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGc > 1:697788/1‑150 (MQ=255) gTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGt > 2:585994/1‑150 (MQ=255) gTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGt > 1:3395336/1‑150 (MQ=255) tCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCTGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCg < 1:2986580/150‑1 (MQ=255) tCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGatca < 2:4085013/150‑1 (MQ=255) tCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGatca > 1:1591310/1‑150 (MQ=255) tCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGatca < 2:61127/150‑1 (MQ=255) tCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGatca < 1:1862516/150‑1 (MQ=255) | AGCAATCGCAAGGTATCTTCCGTTAGCGGTCGACGATCTCCAGTGTGCGGATCGGTGATGACGCCTTCAAGCCCATAGCGACAGGCCTGGAAACGGTTGAATTTATACAGCAGGTAATCTTTTTCCTGATGTTTAAACGGGCGTTCCGTCAGTAACCAGTGGGCGGTAGCCTGAATTAATCCCGCCATATTTACTGCGTGGCTAAGGGTTAACGGGGTATCCATCACCCGAACCTCCACCGTGCCAAAATGAGGACTGGGGCGAATATCCCAGTGCAGATCTTTAATGCTGTCGATCA > CP009273/601896‑602193 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |