| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 92,728 | G→T | 9.7% | L80L (CTG→CTT) | mraY → | phospho‑N‑acetylmuramoyl‑pentapeptide transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 92,728 | 0 | G | T | 9.7% | 1004.9 / 58.4 | 278 | L80L (CTG→CTT) | mraY | phospho‑N‑acetylmuramoyl‑pentapeptide transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (129/122); new base T (15/12); total (144/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.92e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
CTGACCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGTAAAGACACCAAAGGGTTGATCGC > CP009273/92579‑92877 | ctgACCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTg > 2:842535/1‑150 (MQ=255)ctgACCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTg < 2:3128378/150‑1 (MQ=255) aCCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACg < 1:946027/150‑1 (MQ=255) cgcgCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGc > 2:3921438/1‑150 (MQ=255) cgcgCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGc < 1:2972815/150‑1 (MQ=255) cgcTGTTCATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGa < 2:2774684/150‑1 (MQ=255) tGTTCATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATtg < 1:1877753/150‑1 (MQ=255) gTTCATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTTACGGCGATtgt < 1:2314275/150‑1 (MQ=255) cATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGAt > 1:618849/1‑150 (MQ=255) aTCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGAtc < 1:1127852/150‑1 (MQ=255) tctcATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGAtct > 2:3527556/1‑150 (MQ=255) cATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCg < 1:3653161/150‑1 (MQ=255) cATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCg < 2:1808060/150‑1 (MQ=255) aTTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGt > 2:2591352/1‑150 (MQ=255) ttGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTa < 2:1628926/150‑1 (MQ=255) gtgGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTAct < 2:932904/150‑1 (MQ=255) gtgGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTAct < 2:2266780/150‑1 (MQ=255) tgGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTActg > 2:3250404/1‑150 (MQ=255) gCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTggg < 2:59649/150‑1 (MQ=255) cccGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGc > 2:1539052/1‑150 (MQ=255) cgTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTAc > 1:3000686/1‑150 (MQ=255) cgTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTAc > 2:3262937/1‑150 (MQ=255) cgTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTAc < 1:1493216/150‑1 (MQ=255) gTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTAcc < 2:4012164/150‑1 (MQ=255) gTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGAATTATGATCCTTACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTAcc < 1:1288804/150‑1 (MQ=255) aTGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCg > 2:3089367/1‑150 (MQ=255) aTGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCg > 1:3476240/1‑150 (MQ=255) aTGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCg > 2:4181120/1‑150 (MQ=255) aTGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCg > 2:816351/1‑150 (MQ=255) gATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTc > 2:3323918/1‑150 (MQ=255) aTTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTcc < 2:3022033/150‑1 (MQ=255) gCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAAt < 1:1667473/150‑1 (MQ=255) tCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTTACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATcc > 2:4000778/1‑150 (MQ=255) tCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATcc > 2:3695026/1‑150 (MQ=255) tGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACg > 2:3939830/1‑150 (MQ=255) tGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACg > 2:3829466/1‑150 (MQ=255) cAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTc > 2:3038131/1‑150 (MQ=255) aaaaaCTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCt > 1:4313571/1‑150 (MQ=255) aCTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTg > 2:1979085/1‑150 (MQ=255) cTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGc > 1:96907/1‑150 (MQ=255) ttCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCgt > 2:252079/1‑150 (MQ=255) ttCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCgt > 2:654137/1‑150 (MQ=255) cTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGtt > 1:3512753/1‑150 (MQ=255) cTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGtt < 2:388612/150‑1 (MQ=255) ttGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTtgg < 1:303531/150‑1 (MQ=255) ggTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTtggtg > 2:2885156/1‑150 (MQ=255) ggTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTtggtg > 2:606427/1‑150 (MQ=255) tCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTggtggt < 2:3539415/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGgtggtg < 1:485941/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGgtggtg > 1:320446/1‑150 (MQ=255) aGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGc > 2:48017/1‑150 (MQ=255) gtggtgCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTg < 1:2887851/150‑1 (MQ=255) tggtgCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTgg < 1:1188372/150‑1 (MQ=255) gtgCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTa < 2:2695815/150‑1 (MQ=255) tgCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAg < 2:291553/150‑1 (MQ=255) gCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAgg < 1:3112271/150‑1 (MQ=255) gTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGTTTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGtt < 1:3151077/150‑1 (MQ=255) gTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGtt > 2:3348073/1‑150 (MQ=255) tAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTa < 1:2929747/150‑1 (MQ=255) tAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTa < 1:2195596/150‑1 (MQ=255) cgacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACgg < 1:1299942/150‑1 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGgt > 1:198964/1‑150 (MQ=255) gacgGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGgt > 1:4162842/1‑150 (MQ=255) gTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTa > 1:253118/1‑150 (MQ=255) cTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTg < 2:158799/150‑1 (MQ=255) tGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTgg < 1:1045695/150‑1 (MQ=255) tGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTgg > 1:701537/1‑150 (MQ=255) gAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGc < 1:1563201/150‑1 (MQ=255) cacaCTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTttg > 2:1250222/1‑150 (MQ=255) cacaCTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTttg < 1:373967/150‑1 (MQ=255) acacTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTttgt < 1:825238/150‑1 (MQ=255) acTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTttgttg > 1:1655266/1‑150 (MQ=255) aGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATGGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTgatgat > 2:1830617/1‑150 (MQ=255) gCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGAtt < 1:3412794/150‑1 (MQ=255) cAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTTACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTa > 2:3586937/1‑150 (MQ=255) cAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTa < 1:427065/150‑1 (MQ=255) aaGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTTACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTAt < 2:1127157/150‑1 (MQ=255) aaGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTAt < 1:3323918/150‑1 (MQ=255) ggTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCaaa > 2:1877261/1‑150 (MQ=255) ggTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCaaa > 1:2160978/1‑150 (MQ=255) tACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTTACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAgt > 2:2212057/1‑150 (MQ=255) tACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTTACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAgt > 1:3622914/1‑150 (MQ=255) ccGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAgtggtg < 1:1010908/150‑1 (MQ=255) ccGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAgtggtg < 2:101757/150‑1 (MQ=255) cGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGc < 2:2541327/150‑1 (MQ=255) cGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGc < 1:3262937/150‑1 (MQ=255) gACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCg > 1:661562/1‑150 (MQ=255) aCCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGt > 2:2490972/1‑150 (MQ=255) tGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGTAAAg > 1:3987828/1‑150 (MQ=255) tGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGTAAAg > 1:1421119/1‑150 (MQ=255) gggCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGTAAAGa < 1:3922161/150‑1 (MQ=255) ggCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGTAAAGac < 1:3695026/150‑1 (MQ=255) gATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGTAAAGACACCaa < 2:2465207/150‑1 (MQ=255) aTTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGTAAAGACACCaaa > 2:1379724/1‑150 (MQ=255) tGATCCTTACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGTAAAGACACCAAAGGGt > 2:1113887/1‑150 (MQ=255) tGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGTAAAGACACCAAAGGGt > 2:1221723/1‑150 (MQ=255) tGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGTAAAGACACCAAAGGGt < 2:887578/150‑1 (MQ=255) cTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGTAAAGACACCAAAGGGTTGATc < 2:4279464/150‑1 (MQ=255) cTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGTAAAGACACCAAAGGGTTGATc > 1:3554790/1‑150 (MQ=255) cTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGTAAAGACACCAAAGGGTTGATc > 2:2429467/1‑150 (MQ=255) | CTGACCGCGCTGTTCATCTCATTGTGGATGGGCCCGCGTATGATTGCTCATTTGCAAAAACTTTCCTTTGGTCAGGTGGTGCGTAACGACGGTCCTGAATCACACTTCAGCAAGCGCGGTACGCCGACCATGGGCGGGATTATGATCCTGACGGCGATTGTGATCTCCGTACTGCTGTGGGCTTACCCGTCCAATCCGTACGTCTGGTGCGTGTTGGTGGTGCTGGTAGGTTACGGTGTTATTGGCTTTGTTGATGATTATCGCAAAGTGGTGCGTAAAGACACCAAAGGGTTGATCGC > CP009273/92579‑92877 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |