Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 863,745 | T→A | 10.9% | F257Y (TTT→TAT) | gsiA → | glutathione transporter ATP‑binding protein, ABC superfamily |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 863,745 | 0 | T | A | 10.9% | 811.9 / 72.2 | 248 | F257Y (TTT→TAT) | gsiA | glutathione transporter ATP‑binding protein, ABC superfamily |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (122/99); new base A (9/18); total (131/117) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.06e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CCTGCAATTAATCAAAGTATTGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGCCCCCCCCATCGAGCAGAAAACGG > CP009273/863596‑863894 | ccTGCAATTAATCAAAGTATTGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGAtttt < 2:149492/150‑1 (MQ=255) cAATTAATCAAAGTATTGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCAt < 2:2080060/150‑1 (MQ=255) aaTTAATCAAAGTATTGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATg < 2:115948/150‑1 (MQ=255) aTTAATCAAAGTATTGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGc > 2:1361778/1‑150 (MQ=255) tAATCAAAGTATTGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCATGCAc < 1:1010273/150‑1 (MQ=255) cAAAGTATTGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCa < 1:1648181/150‑1 (MQ=255) aaGTATTGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAAc > 2:1741332/1‑150 (MQ=255) aaGTATTGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAAc < 1:1984532/150‑1 (MQ=255) aGTATTGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACa < 2:2681709/150‑1 (MQ=255) gTATTGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACAt < 2:1958665/150‑1 (MQ=255) aTTGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATcc < 2:1027609/150‑1 (MQ=255) tGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCtt < 1:1106415/150‑1 (MQ=255) gCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTa > 2:1335543/1‑150 (MQ=255) cAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTac < 1:777938/150‑1 (MQ=255) aaaaaGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTaca > 1:1530909/1‑150 (MQ=255) aaaaaGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTaca > 2:309063/1‑150 (MQ=255) aaaGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACAACCTTACAcc > 1:1568750/1‑150 (MQ=255) agagATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCg < 1:577063/150‑1 (MQ=255) agaTGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTg > 1:1997795/1‑150 (MQ=255) aTGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACTGGTAACGTCGAAAAGATTTTACATGCACCGCAACATCCTTACACACGTgcg > 1:2753440/1‑150 (MQ=255) aTGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTgcg < 2:3395494/150‑1 (MQ=255) aTGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTgcg < 2:2983114/150‑1 (MQ=255) tCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTg < 1:3073604/150‑1 (MQ=255) cGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGt > 1:3858213/1‑150 (MQ=255) gATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGtt > 1:3988988/1‑150 (MQ=255) aTGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGTGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTa < 1:3972497/150‑1 (MQ=255) tGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAg > 2:428884/1‑150 (MQ=255) ggCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAgct < 2:3621022/150‑1 (MQ=255) ttATCTTGATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGAGTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGCGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACCTCCTTCCACCCGTGCGCTGTTAGctgctg < 2:1622058/150‑1 (MQ=255) tATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGt < 2:2485196/150‑1 (MQ=255) tATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGt < 2:310522/150‑1 (MQ=255) aTCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGtt > 2:1320010/1‑150 (MQ=255) cTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTcc > 1:2836583/1‑150 (MQ=255) cTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTcc > 1:4038399/1‑150 (MQ=255) cTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTcc > 1:1848142/1‑150 (MQ=255) cTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTcc < 1:2551778/150‑1 (MQ=255) cTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTcc < 1:4254123/150‑1 (MQ=255) cTTGATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTcc < 2:4151291/150‑1 (MQ=255) tATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCCGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCa > 1:3279624/1‑150 (MQ=255) actcacGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACtt > 2:635771/1‑150 (MQ=255) actcacGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACtt > 2:786825/1‑150 (MQ=255) ctcacGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTg > 1:1726658/1‑150 (MQ=255) ctcacGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTg > 1:4297973/1‑150 (MQ=255) tcacGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGAGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTgg > 1:2426745/1‑150 (MQ=255) tcacGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTgg < 2:539870/150‑1 (MQ=255) gATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCg > 2:1709678/1‑150 (MQ=255) gATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCg < 1:1097451/150‑1 (MQ=255) gATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCg > 1:2128288/1‑150 (MQ=255) gATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCg < 1:2358089/150‑1 (MQ=255) gATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCg < 1:2462396/150‑1 (MQ=255) tatGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGAt < 2:876691/150‑1 (MQ=255) atGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATg > 1:2152679/1‑150 (MQ=255) atGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATg > 1:2152296/1‑150 (MQ=255) atGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATg > 2:3663676/1‑150 (MQ=255) tGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGa < 2:3832154/150‑1 (MQ=255) gtggtgGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAggg < 1:3387300/150‑1 (MQ=255) gtggCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTa < 1:1604956/150‑1 (MQ=255) tggCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAg > 1:2872038/1‑150 (MQ=255) tggCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAg < 1:2225422/150‑1 (MQ=255) tggCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAg < 2:1301660/150‑1 (MQ=255) tggCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAg < 2:2785049/150‑1 (MQ=255) cAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGAtt < 1:4313259/150‑1 (MQ=255) cAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGAtt < 2:1080111/150‑1 (MQ=255) agagATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTa > 1:4196775/1‑150 (MQ=255) gagaTTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTAt < 2:3747422/150‑1 (MQ=255) gaTTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATcc > 2:2755126/1‑150 (MQ=255) aTTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATccc > 2:1325874/1‑150 (MQ=255) aTTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATccc < 1:980879/150‑1 (MQ=255) aTTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATccc < 2:1862827/150‑1 (MQ=255) ttGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATcccc < 1:631323/150‑1 (MQ=255) cGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACg > 1:2575623/1‑150 (MQ=255) cGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTc < 2:669387/150‑1 (MQ=255) gggTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTcc < 2:2349739/150‑1 (MQ=255) tACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGt > 1:499699/1‑150 (MQ=255) tGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGGTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGa > 2:1379509/1‑150 (MQ=255) gTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGata < 2:539569/150‑1 (MQ=255) tGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGatat < 1:3047418/150‑1 (MQ=255) tGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTATCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGatat < 1:3603954/150‑1 (MQ=255) gATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATc < 1:1361778/150‑1 (MQ=255) aTGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCg < 2:2232497/150‑1 (MQ=255) aTGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCg < 2:1573207/150‑1 (MQ=255) aTGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCg < 2:3168485/150‑1 (MQ=255) gTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATTAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCt > 2:3985202/1‑150 (MQ=255) tCAGGGCGAGGCTGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGa < 1:1074237/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGaa > 2:3336392/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCACCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGaa > 2:3999525/1‑150 (MQ=255) ggCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACAt > 1:4098943/1‑150 (MQ=255) ggCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACAt < 1:446622/150‑1 (MQ=255) cGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATcc < 1:265389/150‑1 (MQ=255) cGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGa > 2:1907513/1‑150 (MQ=255) cGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGa > 2:19014/1‑150 (MQ=255) ggTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGccccc > 1:315433/1‑150 (MQ=255) ggTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGccccc > 1:3472829/1‑150 (MQ=255) cGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGCCCCCCCCATCGa > 1:2249155/1‑150 (MQ=255) cGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGCCCCCCCCATCGa > 1:1944384/1‑150 (MQ=255) aGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGCCCCCCCCATCGAGCAGa > 2:4235381/1‑150 (MQ=255) gATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGCCCCCCCCATCGAGCAGaa > 2:781830/1‑150 (MQ=255) aTTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGCCCCCCCCATCGAGCAGaaa < 1:1335543/150‑1 (MQ=255) ttttCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGCCCCCCCCATCGAGCAGAAAAc < 2:2580997/150‑1 (MQ=255) ttttCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGCCCCCCCCATCGAGCAGAAAAc < 1:1152148/150‑1 (MQ=255) | CCTGCAATTAATCAAAGTATTGCAAAAAGAGATGTCGATGGGCGTTATCTTTATCACTCACGATATGGGCGTGGTGGCAGAGATTGCCGATCGGGTACTGGTGATGTATCAGGGCGAGGCGGTGGAAACGGGTACCGTCGAACAGATTTTTCATGCACCGCAACATCCTTACACCCGTGCGCTGTTAGCTGCTGTTCCGCAACTTGGTGCGATGAAAGGGTTAGATTATCCCCGACGTTTCCCGTTGATATCGCTTGAACATCCAGCGAAACAGGCCCCCCCCATCGAGCAGAAAACGG > CP009273/863596‑863894 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |