| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,602,131 | G→T | 20.5% | D177Y (GAT→TAT) | tam → | trans‑aconitate methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,602,131 | 0 | G | T | 20.5% | 682.0 / 128.1 | 249 | D177Y (GAT→TAT) | tam | trans‑aconitate methyltransferase |
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Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
CAGTACAGATGCCAGATAACTGGCTGGAGCCGACCCATGTGCTCATGCGCGAAGTTGCCTGGGAACAAAACTACCCGGATCGCGGGCGTGAGCCGTTGGCTGGCGTTCATGCTTACTACGATATTTTGAGCGAAGCCGGATGTGAGGTCGATATCTGGCGAACCACCTACTATCACCAGATGCCGTCACACCAGGCGATTATCGATTGGGTGACTGCCACTGGATTACGTCCGTGGTTACAGGATCTGACCGAGAGCGAACAGCAGCTTTTTCTTAAGCGCTACCATCAGATGCTGGA > CP009273/1601982‑1602279 | aGTACAGATGCCAGATAACTGGCTGGAGCCGACCCATGTGCTCATGCGCGAAGTTGCCTGGGAACAAAACTACCCGGATCGCGGGCGTGAGCCGTTGGCTGGCGTTCATGCTTACTACGATATTTTGAGCGAAGCCGGATGTGAGGTCGa > 2:1345449/1‑150 (MQ=255) aCAGATGCCAGATAACTGGCTGGAGCCGACCCATGTGCTCATGCGCGAAGTTGCCTGGGAACAAAACTACCCGGATCGCGGGCGTGAGCCGTTGGCTGGCGTTCATGCTTACTACGATATTTTGAGCGAAGCCGGATGTGAGGTCGatat > 2:3465517/1‑150 (MQ=255) cAGATGCCAGATAACTGGCTGGAGCCGACCCATGTGCTCATGCGCGAAGTTGCCTGGGAACAAAACTACCCGGATCGCGGGCGTGAGCCGTTGGCTGGCGTTCATGCTTACTACGATATTTTGAGCGAAGCCGGATGTGAGGTCTATATc < 1:721047/150‑1 (MQ=255) 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aGCCGGATGTGAGGTCTATATCTGGCGAACCACCTACTATCACCAGATGCCGTCACACCAGGCGATTATCGATTGGGTGACTGCCACTGGATTACGTCCGTGGTTACAGGATCTGACCGAGAGCGAACAGCAGCTTTTTCTTAAGCGCTa < 2:333421/150‑1 (MQ=255) aGCCGGATGTGAGGTCGATATCTGGCGAACCACCTACTATCACCAGATGCCGTCACACCAGGCGATTATCGATTGGGTGACTGCCACTGGATTACGTCCGTGGTTACAGGATCTGACCGAGAGCGAACAGCAGCTTTTTCTTAAGCGCTa > 2:1749230/1‑150 (MQ=255) aGCCGGATGTGAGGTCGATATCTGGCGAACCACCTACTATCACCAGATGCCGTCACACCAGGCGATTATCGATTGGGTGACTGCCACTGGATTACGTCCGTGGTTACAGGATCTGACCGAGAGCGAACAGCAGCTTTTTCTTAAGCGCTa > 2:4158656/1‑150 (MQ=255) gCCGGATGTGAGGTCGATATCTGGCGAACCACCTACTATCACCAGATGCCGTCACACCAGGCGATTATCGATTGGGTGACTGCCACTGGATTACGTCCGTGGTTACAGGATCTGACCGAGAGCGAACAGCAGCTTTTTCTTAAGCGCTAc < 1:4082542/150‑1 (MQ=255) ccGGATGTGAGGTCGATATCTGGCGAACCACCTACTATCACCAGATGCCGTCACACCAGGCGATTATCGATTGGGTGACTGCCACTGGATTACGTCCGTGGTTACAGGATCTGACCGAGAGCGAACAGCAGCTTTTTCTTAAGCGCTAcc < 2:2844513/150‑1 (MQ=255) cGGATGTGAGGTCGATATCTGGCGAACCACCTACTATCACCAGATGCCGTCACACCAGGCGATTATCGATTGGGTGACTGCCACTGGATTACGTCCGTGGTTACAGGATCTGACCGAGAGCGAACAGCAGCTTTTTCTTAAGCGCTACCa > 1:3568760/1‑150 (MQ=255) ggATGTGAGGTCTATATCTGGCGAACCACCTACTATCACCAGATGCCGTCACACCAGGCGATTATCGATTGGGTGACTGCCACTGGATTACGTCCGTGGTTACAGGATCTGACCGAGAGCGAACAGCAGCTTTTTCTTAAGCGCTACCAt > 1:1955657/1‑150 (MQ=255) ggATGTGAGGTCGATATCTGGCGAACCACCTACTATCACCAGATGCCGTCACACCAGGCGATTATCGATTGGGTGACTGCCACTGGATTACGTCCGTGGTTACAGGATCTGACCGAGAGCGAACAGCAGCTTTTTCTTAAGCGCTACCAt > 1:862809/1‑150 (MQ=255) gATGTGAGGTCGATATCTGGCGAACCACCTACTATCACCAGATGCCGTCACACCAGGCGATTATCGATTGGGTGACTGCCACTGGATTACGTCCGTGGTTACAGGATCTGACCGAGAGCGAACAGCAGCTTTTTCTTAAGCGCTACCATc > 1:1509919/1‑150 (MQ=255) gATGTGAGGTCGATATCTGGCGAACCACCTACTATCACCAGATGCCGTCACACCAGGCGATTATCGATTGGGTGACTGCCACTGGATTACGTCCGTGGTTACAGGATCTGACCGAGAGCGAACAGCAGCTTTTTCTTAAGCGCTACCATc < 1:2576221/150‑1 (MQ=255) gTCGATATCTGGCGAACCACCTACTATCACCAGATGCCGTCACACCAGGCGATTATCGATTGGGTGACTGCCACTGGATTACGTCCGTGGTTACAGGATCTGACCGAGAGCGAACAGCAGCTTTTTCTTAAGCGCTACCATCAGATGCTg > 2:1978478/1‑150 (MQ=255) tCGATATCTGGCGAACCACCTACTATCACCAGATGCCGTCACACCAGGCGATTATCGATTGGGTGACTGCCACTGGATTACGTCCGTGGTTACAGGATCTGACCGAGAGCGAACAGCAGCTTTTTCTTAAGCGCTACCATCAGATGCTgg > 2:920069/1‑150 (MQ=255) | CAGTACAGATGCCAGATAACTGGCTGGAGCCGACCCATGTGCTCATGCGCGAAGTTGCCTGGGAACAAAACTACCCGGATCGCGGGCGTGAGCCGTTGGCTGGCGTTCATGCTTACTACGATATTTTGAGCGAAGCCGGATGTGAGGTCGATATCTGGCGAACCACCTACTATCACCAGATGCCGTCACACCAGGCGATTATCGATTGGGTGACTGCCACTGGATTACGTCCGTGGTTACAGGATCTGACCGAGAGCGAACAGCAGCTTTTTCTTAAGCGCTACCATCAGATGCTGGA > CP009273/1601982‑1602279 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |