| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,625,116 | T→A | 10.6% | N19Y (AAC→TAC) | ydfI ← | putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,625,116 | 0 | T | A | 10.6% | 554.0 / 47.2 | 170 | N19Y (AAC→TAC) | ydfI | putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (56/96); new base A (4/14); total (60/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
ATCGGCAATTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGA > CP009273/1624967‑1625265 | aTCGGCACTTGGCTGGTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGtt < 1:3664692/150‑1 (MQ=255)aTCGGCAATTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGtt > 2:2226810/1‑150 (MQ=255)aTCGGCAATTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGtt < 1:1475224/150‑1 (MQ=255) tCGGCAATTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGtta < 2:2715335/150‑1 (MQ=255) cAATTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTaa > 1:342893/1‑150 (MQ=255) aTTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGa > 1:3307648/1‑150 (MQ=255) ttGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATc < 1:1602526/150‑1 (MQ=255) cTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATa < 2:644814/150‑1 (MQ=255) tCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACa < 1:3193831/150‑1 (MQ=255) ccgATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAgt < 1:1481318/150‑1 (MQ=255) ccgATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAgt < 1:2523075/150‑1 (MQ=255) ccgATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAgt < 2:667428/150‑1 (MQ=255) cgATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAgtg < 2:2743254/150‑1 (MQ=255) aTTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTc < 2:3978829/150‑1 (MQ=255) aTTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTc < 1:1029975/150‑1 (MQ=255) tAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGc > 2:3654373/1‑150 (MQ=255) tAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGc > 2:1262361/1‑150 (MQ=255) aGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCtt < 2:3630314/150‑1 (MQ=255) gTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCttt > 1:1717794/1‑150 (MQ=255) tGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTg < 2:666510/150‑1 (MQ=255) ataataTCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATaa > 1:1211572/1‑150 (MQ=255) ataataTCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATaa < 1:2690566/150‑1 (MQ=255) tatCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACaaa > 1:540281/1‑150 (MQ=255) tatCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACaaa > 1:2712525/1‑150 (MQ=255) atCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAat < 2:1438587/150‑1 (MQ=255) atCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAat < 2:1438612/150‑1 (MQ=255) atCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCGGATAACAAat > 1:740067/1‑150 (MQ=255) tCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAatt < 2:3841170/150‑1 (MQ=255) ccccAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGTCATACACACCCTTATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAatta < 1:1105323/150‑1 (MQ=255) ccccAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAatta < 2:1703210/150‑1 (MQ=255) ccAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCGTTTGCTGATTACAAattatt > 1:802145/1‑150 (MQ=255) ccAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCGTTTGCTGATAACAAattatt > 1:802137/1‑150 (MQ=255) cAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTAttt > 1:3870696/1‑150 (MQ=255) tCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTccc < 2:2940017/150‑1 (MQ=255) tCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTccc < 2:2867874/150‑1 (MQ=255) cTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATa < 2:1993269/150‑1 (MQ=255) gAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAAc < 2:1029617/150‑1 (MQ=255) gAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCACATAAc > 2:1746121/1‑150 (MQ=255) aTGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAAt < 2:2765801/150‑1 (MQ=255) aTGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATCAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAAt < 2:2765490/150‑1 (MQ=255) gTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTc < 1:3627274/150‑1 (MQ=255) ttCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAAAAAATTATTTCCCATAACAAttac > 2:2633263/1‑148 (MQ=255) tCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCGGATAACAAATTATTTCCCCTAACAATTACt > 1:1519864/1‑150 (MQ=255) gTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTtaa < 2:3208773/150‑1 (MQ=255) tAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTTCTGATAACAAATTATTTACCATAAAAATTACTtaaa > 1:3116933/1‑150 (MQ=255) cAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTtaaatat > 2:1243826/1‑150 (MQ=255) aGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTtaaatataa < 2:3008027/150‑1 (MQ=255) gAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAAATCCTtaaatataaa > 1:2653177/1‑150 (MQ=255) aaTATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTtaaatataaat < 1:1240595/150‑1 (MQ=255) atatCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTtaaatataaata < 2:1151725/150‑1 (MQ=255) tatCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTaaatataaatat < 2:342893/150‑1 (MQ=255) cATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAg < 1:4049505/150‑1 (MQ=255) cATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAg < 1:1383651/150‑1 (MQ=255) cATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAg < 1:297009/150‑1 (MQ=255) aTACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTACCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGc > 2:1094901/1‑150 (MQ=255) aTACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTACCATAACAAATCCTTAAATATAAATATGGCAAGc > 2:2057681/1‑150 (MQ=255) tACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCt < 1:3441576/150‑1 (MQ=255) tACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCt < 2:1090118/150‑1 (MQ=255) tACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCt < 2:1265958/150‑1 (MQ=255) acacCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCtata < 1:855348/150‑1 (MQ=255) cacCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTatat < 1:2101085/150‑1 (MQ=255) ccTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGtt < 2:793410/150‑1 (MQ=255) ccTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGtt < 2:4275245/150‑1 (MQ=255) ccTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGtt < 2:2086880/150‑1 (MQ=255) cTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGttt < 2:1282400/150‑1 (MQ=255) tGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGtttt < 1:2103714/150‑1 (MQ=255) gATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTg > 2:2613629/1‑150 (MQ=255) gATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTg > 2:95113/1‑150 (MQ=255) gATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTg > 2:118474/1‑150 (MQ=255) gcgcACTGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTta < 1:3738333/150‑1 (MQ=255) cgcACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTtat < 1:3698804/150‑1 (MQ=255) cgcACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTtat < 2:4217047/150‑1 (MQ=255) gcACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTtata < 1:2134851/150‑1 (MQ=255) ggTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGaa > 2:1104408/1‑150 (MQ=255) gAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATaa < 1:104357/150‑1 (MQ=255) aTGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAAAAAAATATTTCCCATAACAATTACATAAAAATAAAAATTGCAAGCTATATGTTTTGTTATATTAATaaaaa > 1:615903/1‑150 (MQ=255) gCACCAAAGCATAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGTTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATc < 2:4151279/150‑1 (MQ=255) cAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCct < 1:2966011/150‑1 (MQ=255) cAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCct < 1:945182/150‑1 (MQ=255) cAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCct < 1:2783249/150‑1 (MQ=255) aaGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCctct < 2:1956182/150‑1 (MQ=255) aGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAAAAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCtctc > 2:4092376/1‑150 (MQ=255) tAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGt < 1:4238940/150‑1 (MQ=255) tAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGt < 1:569556/150‑1 (MQ=255) aTGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCAAAACAAATCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATTTTTTGTTATATTAATAAAAATACCCACTCCGGTAag > 1:2308314/1‑150 (MQ=255) tGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAaga < 2:1673551/150‑1 (MQ=255) tGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAaga < 2:3335953/150‑1 (MQ=255) cAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAAATATTTACCAAAACAAATACATAAATATAAATATTGCCACCTAAAATTTTTTTTATATGAATAAAAAAAACCACACCCGTAAGAGAAg > 1:745027/1‑150 (MQ=255) tcatGGAGCCAGGTTATTAAGAACATAAACAGGGCGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAACTATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGAt < 2:860195/147‑1 (MQ=255) cTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGAtt > 2:468650/1‑150 (MQ=255) ttGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTa < 1:2072535/150‑1 (MQ=255) ttGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTa < 1:1250343/150‑1 (MQ=255) tGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAACTATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTaa < 1:2160880/150‑1 (MQ=255) aGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATACCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAggg > 2:2358370/1‑150 (MQ=255) gCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGt > 2:1314803/1‑150 (MQ=255) ccAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGtt < 1:354440/150‑1 (MQ=255) cAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGttt < 1:1593478/150‑1 (MQ=255) cAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGttt < 1:1593468/150‑1 (MQ=255) gTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACa > 2:3484253/1‑150 (MQ=255) tattaAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATACCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGa > 2:3161451/1‑150 (MQ=255) | ATCGGCAATTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGA > CP009273/1624967‑1625265 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |