| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,442,770 | 0 | A | C | 9.8% | 614.9 / 56.5 | 217 | D253E (GAT→GAG) | yfcO | DUF2544 family putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (87/107); new base C (8/14); total (95/122) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.03e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
CGGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAACACGCACGACCATATCGTGTAACTGTTTGTCCGTTATAGGGTGTCGATTTGGCGTGACCGAGACTTCCGCCTTGTCACATCCCGACGCGGTAAAAGTTATCATCTGTGCAACCCAGCGGCAGTAACCACCTGTTTCATTCATCTG > CP009273/2442623‑2442919 | cgGAGTTGCCCTGAGGTGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCTTGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGTGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATc < 1:1287071/150‑1 (MQ=255)cgGAGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATc < 2:2870384/150‑1 (MQ=255) aGTTGCCCTGAGGAGTTGAGCGCGTTGCGCCAGGTACGGGTAATGGCAGGGGCGAATGCCCCTGCCTGGTGTATCTAAGGGCTACAACTCATTCAGTATGTACTGGAACCGGCAAGTAGAATCGATTGGCTGCATACTGCTGGTATCAac < 1:3346526/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |