| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,386,303 | 0 | A | T | 17.2% | 679.5 / 126.8 | 249 | I1105I (ATT→ATA) | yhdP | DUF3971‑AsmA2 domains protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (116/90); new base T (27/16); total (143/106) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
TGGAGTCAAAATAGAACCCTTCGCCAAAAGTGTCTCTGAAATCAAAACGCAGCTTACGCATCAGGGCATCTACGCTCAATAAGCGCAGCAATTGCCCGGCATGTCCGGTATTGATTTCGGTAATTTCGCCTTTACCCAGTTGAGTATGAATGATGCCATTCAACGTCGCTTCATCTGGCTGCCAGGGTGCTTTGCGCCAGTGTAAATCGTAATCCACATTAAATGACGACTGGCGTATGGGCGTCGTGACACCAAAAAATTCTGCGGCGGCATCAATTTTCTGCCCGCGCAGTTTTC > CP009273/3386155‑3386451 | tGGAGTCAAAATAGAACCCTTCGCCAAAAGTGTCTCTGAAATCAAAACGCAGCTTACGCATCAGGGCATCTACGCTCAATAAGCGCAGCAATTGCCCGGCATGTCCGGTATTGATTTCGGTAATTTCGCCTTTACCCAGTTGAGTatgaa > 1:2428411/1‑150 (MQ=255) gTCAAAATAGAACCCTTCGCCAAAAGTGTCTCTGAAATCAAAACGCAGCTTACGCATCAGGGCATCTACGCTCAATAAGCGCAGCAATTGCCCGGCATGTCCGGTATTGATTTCGGTAATTTCGCCTTTACCCAGTTGAGTATGAatgat > 1:1091602/1‑150 (MQ=255) gTCAAAATAGAACCCTTCGCCAAAAGTGTCTCTGAAATCAAAACGCAGCTTACGCATCAGGGCATCTACGCTCAATAAGCGCAGCAATTGCCCGGCATGTCCGGTATTGATTTCGGTAATTTCGCCTTTACCCAGTTGAGTATGAatgat < 2:2443600/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |