| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 3,785,915 | G→T | 94.6% | intergenic (‑4/+271) | kbl ← / ← yibB | glycine C‑acetyltransferase/YibB family protein, function unknown |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,785,915 | 0 | G | T | 94.6% | 851.2 / 34.0 | 260 | intergenic (‑4/+271) | kbl/yibB | glycine C‑acetyltransferase/YibB family protein, function unknown |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (6/8); new base T (101/145); total (107/153) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
GCACAAAAGTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCGATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCTGCAAAATTCAGGATAAATAACGTGTAACTTGATGTCTCTCAACACCTACAGATAGTAGAAAAACTGTAC > CP009273/3785766‑3786061 | caAAAGTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTAtt < 1:3018368/150‑1 (MQ=255) caAAAGTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTAtt > 1:241803/1‑150 (MQ=255) aaaaGTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCTATtc > 2:3728374/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |