| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 314,027 | C→T | 11.1% | E2K (GAA→AAA) | rclC ← | reactive chlorine species (RCS) stress resistance inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 314,027 | 0 | C | T | 11.1% | 661.2 / 55.5 | 207 | E2K (GAA→AAA) | rclC | reactive chlorine species (RCS) stress resistance inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (76/108); new base T (11/12); total (87/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.07e-01 | |||||||||||
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
TGGACTGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTGATACTGA > CP009273/313878‑314176 | tGGACTGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTc > 1:2366762/1‑150 (MQ=255) aCTGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCAt > 1:474243/1‑150 (MQ=255) tttGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATtgtg < 2:925190/150‑1 (MQ=255) ttGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGa < 2:2074532/150‑1 (MQ=255) gCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAAc < 2:733578/150‑1 (MQ=255) gCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAAc < 2:4063279/150‑1 (MQ=255) cgacgaATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACa > 2:593078/1‑150 (MQ=255) cgacgaATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACa < 2:2988796/150‑1 (MQ=255) cgaATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCCGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATcc < 1:4198832/150‑1 (MQ=255) aaTGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCtt < 2:3805507/150‑1 (MQ=255) aTGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCtta < 2:2024733/150‑1 (MQ=255) tGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttat > 2:795862/1‑150 (MQ=255) ggTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttatt < 2:3466768/150‑1 (MQ=255) gtgtAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttattt < 2:1740281/150‑1 (MQ=255) gtgtAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttattt < 2:904679/150‑1 (MQ=255) tgtAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCttattta > 1:1777240/1‑150 (MQ=255) tgtAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCttattta > 1:3899384/1‑150 (MQ=255) tgtAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCttattta > 1:3898806/1‑150 (MQ=255) tgtAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttattta < 2:1927466/150‑1 (MQ=255) tgtAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttattta < 1:1037972/150‑1 (MQ=255) tGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACaa > 2:4311210/1‑150 (MQ=255) cTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAGCCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATa > 1:3861003/1‑150 (MQ=255) cTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACATAAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGACAGGCCAATATTATCTCCCCGACATAACAGGAGCAGCTCTATTTCCAAGGGGAACATCCTTATTTATACAAtc > 2:2883284/1‑149 (MQ=255) tGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATAc > 1:1012948/1‑150 (MQ=255) tGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATAc < 1:961498/150‑1 (MQ=255) tGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATAc < 2:204859/150‑1 (MQ=255) tGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATAc > 2:187812/1‑150 (MQ=255) gTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATAct < 1:1341837/150‑1 (MQ=255) gTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATAct < 1:2647019/150‑1 (MQ=255) cTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATActgc > 2:1274585/1‑150 (MQ=255) tGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCCGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATActgct < 1:1991449/150‑1 (MQ=255) tGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATActgct < 1:1522220/150‑1 (MQ=255) tGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATActgct < 1:3709707/150‑1 (MQ=255) gCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATActgctg > 1:3200870/1‑150 (MQ=255) ccTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGt < 1:1673145/150‑1 (MQ=255) cTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGtt < 2:2633725/150‑1 (MQ=255) tAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCgg > 2:632224/1‑150 (MQ=255) aaGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGt < 1:252539/150‑1 (MQ=255) aaGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGt > 1:696479/1‑150 (MQ=255) cTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAAttatta < 1:2490986/150‑1 (MQ=255) cTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAAttatta < 1:316336/150‑1 (MQ=255) tttAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATtattat > 2:363510/1‑150 (MQ=255) tttAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATtattat > 2:2718384/1‑150 (MQ=255) tttAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATtattat > 1:974806/1‑150 (MQ=255) taataaCCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCa < 1:2167410/150‑1 (MQ=255) aataaCCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCaa > 1:3950872/1‑150 (MQ=255) ataaCCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAAt > 2:1574362/1‑150 (MQ=255) cAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCAt > 1:4138160/1‑150 (MQ=255) aaTCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATc > 2:2479320/1‑150 (MQ=255) ccACATAAAAACAATTGCAATACTCCGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGAt < 1:4015818/150‑1 (MQ=255) tAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGAc > 1:1418254/1‑150 (MQ=255) tAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGAc > 1:298164/1‑150 (MQ=255) aaaaaCAATTGCAATACTCCGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACt < 1:443520/150‑1 (MQ=255) aaaaaCAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACt > 1:3001594/1‑150 (MQ=255) aaaaCAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACtt > 2:611046/1‑150 (MQ=255) aaaaCAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACtt > 1:675871/1‑150 (MQ=255) aaaCAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACttt > 1:2615565/1‑150 (MQ=255) cAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCa < 1:3130373/150‑1 (MQ=255) cAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCa < 2:541989/150‑1 (MQ=255) cAATTGCAAGACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCa < 2:521990/150‑1 (MQ=255) cAATTGCAAGACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCa < 2:541918/150‑1 (MQ=255) aTTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAgg < 1:3293247/150‑1 (MQ=255) aaTACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGaa < 1:922668/150‑1 (MQ=255) aaTACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGaa < 2:1127135/150‑1 (MQ=255) aaTACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGaa < 2:838797/150‑1 (MQ=255) aCTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCa < 1:3881970/150‑1 (MQ=255) aCTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCa < 1:1815354/150‑1 (MQ=255) cTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCAt < 2:1005784/150‑1 (MQ=255) cAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTCTACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATta < 2:1737334/150‑1 (MQ=255) gAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATAttt > 1:3671525/1‑150 (MQ=255) tCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCt > 2:600314/1‑150 (MQ=255) cAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTg < 1:2015230/150‑1 (MQ=255) cAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTg < 1:2015349/150‑1 (MQ=255) aaTGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTgg > 1:3637201/1‑150 (MQ=255) aaTGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTgg > 1:1444859/1‑150 (MQ=255) aTGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTATGGc > 2:1657163/1‑150 (MQ=255) gTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCta < 1:86701/150‑1 (MQ=255) tCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCtat < 2:1504216/150‑1 (MQ=255) tCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCtat < 1:2239012/150‑1 (MQ=255) tCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCtat < 2:3692227/150‑1 (MQ=255) aGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTatat > 1:3100164/1‑150 (MQ=255) ggCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATc < 1:4341358/150‑1 (MQ=255) gCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCa < 2:2234712/150‑1 (MQ=255) cAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGc > 2:1596758/1‑150 (MQ=255) aTTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCaa > 1:612456/1‑150 (MQ=255) ttATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATgg > 1:1114150/1‑150 (MQ=255) tATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGt < 1:2341292/150‑1 (MQ=255) aTCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTa > 1:1800885/1‑150 (MQ=255) tctcCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTAt < 2:2807127/150‑1 (MQ=255) tcCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTAtcc < 1:128109/150‑1 (MQ=255) tcCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTAtcc > 1:416838/1‑150 (MQ=255) ccccGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTAtcct < 2:1594383/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGTTGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTc < 1:1710730/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTc < 1:2790287/150‑1 (MQ=255) tGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTg < 1:886377/150‑1 (MQ=255) gCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGa < 1:1795749/150‑1 (MQ=255) gCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGa < 1:3982436/150‑1 (MQ=255) gTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCt < 1:940186/150‑1 (MQ=255) tttCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTGATAc > 2:2976504/1‑150 (MQ=255) ccATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTGATACTGa < 2:1142686/150‑1 (MQ=255) | TGGACTGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTGATACTGA > CP009273/313878‑314176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |