| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 29,139 | G→T | 91.0% | G256C (GGT→TGT) | dapB → | dihydrodipicolinate reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 29,139 | 0 | G | T | 91.0% | 601.6 / 49.9 | 207 | G256C (GGT→TGT) | dapB | dihydrodipicolinate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (9/10); new base T (56/132); total (65/142) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.26e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
GGTTTTGCCACCGTGCGTGCAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGT > CP009273/28992‑29284 | gTTTTGCCACCGTGCGTGCAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTa < 1:1358117/150‑1 (MQ=255) gTTTTGCCACCGTGCGTGCAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTa > 1:480263/1‑150 (MQ=255) ttttGCCACCGTGCGTGCAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTaa < 1:2919927/150‑1 (MQ=255) ttttGCCACCGTGCGTGCAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTaa < 2:433579/150‑1 (MQ=255) tttGCCACCGTGCGTGCAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATAGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAg > 2:2300722/1‑150 (MQ=255) ttGCCACCGTGCGTGCAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAgg > 1:2735834/1‑150 (MQ=255) ttGCCACCGTGCGTGCAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAgg > 1:4321890/1‑150 (MQ=255) gCCACCGTGCGTGCAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGaa < 2:1270561/150‑1 (MQ=255) gCCACCGTGCGTGCAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTGGTAAGGaa < 2:1980691/150‑1 (MQ=255) cACCGTGCGTGCAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAg < 1:549170/150‑1 (MQ=255) aCCGTGCGTGCAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGc < 2:4070128/150‑1 (MQ=255) aCCGTGCGTGCAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGc < 2:4070451/150‑1 (MQ=255) gtgcgtgcAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGt < 1:3024699/150‑1 (MQ=255) gtgcgtgcAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGt > 1:3013229/1‑150 (MQ=255) gtgcgtgcAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGt > 1:2702333/1‑150 (MQ=255) gcgtgcAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCt < 1:1734059/150‑1 (MQ=255) gcgtgcAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCt < 1:1501957/150‑1 (MQ=255) tgcAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCtttt < 2:3889811/150‑1 (MQ=255) atgTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGa < 2:1613331/148‑1 (MQ=255) ggTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGat < 1:765005/150‑1 (MQ=255) tGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGATATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGAGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGatat < 1:1952946/150‑1 (MQ=255) tGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGatat > 1:340456/1‑150 (MQ=255) tGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGatat > 2:2629881/1‑150 (MQ=255) tGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGatat < 1:3670612/150‑1 (MQ=255) tGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGatat < 1:3668594/150‑1 (MQ=255) tGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGatat < 1:4013949/150‑1 (MQ=255) gACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATg < 2:2161867/150‑1 (MQ=255) aCATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGc > 2:1285485/1‑150 (MQ=255) aCATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGc > 2:2287311/1‑150 (MQ=255) cATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCg < 2:3277582/150‑1 (MQ=255) cGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCgaga < 1:275722/150‑1 (MQ=255) gTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGAt > 2:568744/1‑150 (MQ=255) ttGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATg < 1:2653734/150‑1 (MQ=255) ttGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATg < 1:2652475/150‑1 (MQ=255) ttGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTC‑TTTTGATATGCGAGATGt < 2:3464838/150‑1 (MQ=255) tGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGt < 2:304234/150‑1 (MQ=255) tGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACt < 2:4057332/150‑1 (MQ=255) aCATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGa < 1:1022314/150‑1 (MQ=255) aTACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGAtc > 1:657417/1‑150 (MQ=255) tACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGAtct < 1:2172050/150‑1 (MQ=255) tACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGAtct < 1:406768/150‑1 (MQ=255) tACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGAtct < 2:1217453/150‑1 (MQ=255) aCCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGAtctc < 1:3744759/150‑1 (MQ=255) ccGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCa < 1:3195528/150‑1 (MQ=255) ccGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCa < 2:3245109/150‑1 (MQ=255) gcgATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCaat < 1:3609268/150‑1 (MQ=255) gATGTTTGCCGCTATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGGAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCaataa < 2:3365902/150‑1 (MQ=255) aTGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCaataat < 2:2206132/150‑1 (MQ=255) tttGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTg < 2:4164773/150‑1 (MQ=255) tGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTa < 1:3923495/150‑1 (MQ=255) tGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTa > 1:2009731/1‑150 (MQ=255) gATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACca > 2:866077/1‑150 (MQ=255) gATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACca > 1:1793017/1‑150 (MQ=255) tatTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACcaca < 1:1112015/150‑1 (MQ=255) tatTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACcaca > 2:2367602/1‑150 (MQ=255) ttGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACaaa > 2:3797634/1‑150 (MQ=255) gAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATAtt > 2:3704660/1‑150 (MQ=255) gAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATAtt > 2:386100/1‑150 (MQ=255) gAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATAtt > 1:1556241/1‑150 (MQ=255) aGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATAttt < 2:1514022/150‑1 (MQ=255) cGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGt < 2:3504027/150‑1 (MQ=255) gTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGAGGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGtt > 2:4144792/1‑150 (MQ=255) cTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTAt < 1:1410540/150‑1 (MQ=255) ggAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATgg < 1:3796167/150‑1 (MQ=255) gagaTCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGt < 1:3427043/150‑1 (MQ=255) gagaTCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGt < 1:1172682/150‑1 (MQ=255) aTCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATTTTCTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCa < 2:2398918/150‑1 (MQ=255) cATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATa < 1:3551162/150‑1 (MQ=255) aTAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATaa < 1:990444/150‑1 (MQ=255) tAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAac < 1:1219744/150‑1 (MQ=255) tAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAac < 1:3376305/150‑1 (MQ=255) aaGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAaca > 2:3380840/1‑150 (MQ=255) ggCGTCCAGCCGTATGACATGTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAAcaca < 2:814585/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACattt < 1:1674728/150‑1 (MQ=255) aGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACatttaatt > 1:2135053/1‑150 (MQ=255) cGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTAt > 2:1679915/1‑150 (MQ=255) gTATGACATTTGCTAACGGCGCTGTAAGATCGGCTTTGTGTTTGATTTGTAAGGAAAGCTGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTAtt < 1:1285448/150‑1 (MQ=255) gTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTAtt < 1:2287311/150‑1 (MQ=255) gACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGAGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGAtt < 1:3682388/150‑1 (MQ=255) aTTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGACTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATtata < 2:2469188/150‑1 (MQ=255) tttGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATaa < 1:1659497/150‑1 (MQ=255) gCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAgg < 1:505918/150‑1 (MQ=255) cTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAggg > 1:1386947/1‑150 (MQ=255) cTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAggg > 1:61900/1‑150 (MQ=255) cTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAggg > 1:61976/1‑150 (MQ=255) aCGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCtt < 2:1686130/150‑1 (MQ=255) cgcgGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAAt < 2:357991/150‑1 (MQ=255) cgcgGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAAt < 1:3352406/150‑1 (MQ=255) cgGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAAttt > 1:3850911/1‑150 (MQ=255) tAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTg < 1:2547471/150‑1 (MQ=255) cGGCTTTGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCtt < 2:3644736/150‑1 (MQ=255) ggCTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCttt > 2:2522310/1‑150 (MQ=255) cTTTGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTa > 2:783247/1‑150 (MQ=255) cTTTGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTTCTTGTTCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTa < 2:1395340/150‑1 (MQ=255) tttGTGGTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTAt < 2:3204559/150‑1 (MQ=255) gTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTgg < 1:3271730/150‑1 (MQ=255) gTTGAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTgg < 1:4215521/150‑1 (MQ=255) gAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGgtgt < 1:3206207/150‑1 (MQ=255) gAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGgtgt < 2:3943320/150‑1 (MQ=255) gAGTTGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTGATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGgtgt > 2:1695973/1‑150 (MQ=255) | GGTTTTGCCACCGTGCGTGCAGGTGACATCGTTGGTGAACATACCGCGATGTTTGCCGATATTGGCGAGCGTCTGGAGATCACCCATAAGGCGTCCAGCCGTATGACATTTGCTAACGGCGCGGTAAGATCGGCTTTGTGGTTGAGTGGTAAGGAAAGCGGTCTTTTTGATATGCGAGATGTACTTGATCTCAATAATTTGTAACCACAAAATATTTGTTATGGTGCAAAAATAACACATTTAATTTATTGATTATAAAGGGCTTTAATTTTTGGCCCTTTTATTTTTGGTGT > CP009273/28992‑29284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |