Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,998,903 | C→A | 6.1% | L228I (CTC→ATC) | pldA → | outer membrane phospholipase A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,998,903 | 0 | C | A | 6.1% | 1085.6 / 31.7 | 280 | L228I (CTC→ATC) | pldA | outer membrane phospholipase A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (143/120); new base A (12/5); total (155/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.18e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.71e-01 |
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
TTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTCAACCAGACC > CP009273/3998754‑3999052 | tttATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATAACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGc < 2:229083/150‑1 (MQ=255) ttATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCt < 1:879737/150‑1 (MQ=255) tataCTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTc < 2:2443677/150‑1 (MQ=255) ataCTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCa > 2:654828/1‑150 (MQ=255) ataCTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCa > 2:4290459/1‑150 (MQ=255) tCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGc > 1:3878640/1‑150 (MQ=255) cTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGaaa > 1:429309/1‑150 (MQ=255) cTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGATCAGTGCGaaa > 1:398800/1‑150 (MQ=255) tGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGAc > 2:1250070/1‑150 (MQ=255) cAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGt > 1:750090/1‑150 (MQ=255) aGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTa > 1:183581/1‑150 (MQ=255) aaaCGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACaa < 2:2480612/150‑1 (MQ=255) ggTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTgg < 2:1628570/150‑1 (MQ=255) aaCTTGCTGGTAGAAGTGAAGCAGTGGTATGTTGTGGGTAATACTGACGATAACCCTGATATCAACATATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCTGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAac < 1:3515654/150‑1 (MQ=255) aaCTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAac < 2:2389619/150‑1 (MQ=255) aCTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAaca < 2:3894331/150‑1 (MQ=255) ctggTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGc > 1:226302/1‑150 (MQ=255) gTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTAc > 2:3321371/1‑150 (MQ=255) gTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTAc < 1:2583689/150‑1 (MQ=255) tAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTAcg > 1:2129070/1‑150 (MQ=255) aGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTAcgg > 2:2367217/1‑150 (MQ=255) aaGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTAcggcg < 2:4052710/150‑1 (MQ=255) aaGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTAcggcg < 2:2563060/150‑1 (MQ=255) aaGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTAcggcg > 1:3656148/1‑150 (MQ=255) gTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACggcggc < 1:96031/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGgcgc > 2:2567664/1‑150 (MQ=255) aaGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGcgcg < 2:280222/150‑1 (MQ=255) ccGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGATCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAg > 2:1679125/1‑150 (MQ=255) cGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGt > 1:1830495/1‑150 (MQ=255) gTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGtt < 2:2259354/150‑1 (MQ=255) ggTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAg < 2:2033265/150‑1 (MQ=255) ggTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTAACAGCTTAAAATCTGATATAACATCGGTGATGAGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAg > 1:910195/1‑150 (MQ=255) gTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAgg > 1:2759904/1‑150 (MQ=255) aTGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCt > 1:4137525/1‑150 (MQ=255) tggtggGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTaa < 1:3624522/150‑1 (MQ=255) gtggGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGt > 1:3612270/1‑150 (MQ=255) tggGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGtt < 2:1410831/150‑1 (MQ=255) tggGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGtt < 1:849827/150‑1 (MQ=255) tggGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGtt < 2:2611552/150‑1 (MQ=255) gggTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTa < 2:76608/150‑1 (MQ=255) ggTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTAc > 2:1514814/1‑150 (MQ=255) gTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTAcc < 2:2781909/150‑1 (MQ=255) tAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTAccc < 2:1558804/150‑1 (MQ=255) aaTACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCg > 2:2383956/1‑150 (MQ=255) aCTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATc > 1:788026/1‑150 (MQ=255) tGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCAc > 2:3614629/1‑150 (MQ=255) cGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCaa > 1:1139582/1‑150 (MQ=255) aTAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAAc < 2:3055015/150‑1 (MQ=255) tAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGATCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACa < 1:518291/150‑1 (MQ=255) cccGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACAtgt < 1:3924187/150‑1 (MQ=255) cccGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACAtgt < 1:477200/150‑1 (MQ=255) ggATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTgcg < 1:2295754/150‑1 (MQ=255) ggATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTgcg < 1:1606698/150‑1 (MQ=255) tatCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCt > 2:3767046/1‑150 (MQ=255) atCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCtt < 2:266262/150‑1 (MQ=255) tCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCttt > 2:1866482/1‑150 (MQ=255) tCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCttt > 2:3451529/1‑150 (MQ=255) tCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCttt < 1:2071830/150‑1 (MQ=255) aCCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTtat < 1:3335073/150‑1 (MQ=255) aaaTATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACt < 1:1174219/150‑1 (MQ=255) aaaTATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACt < 1:2799692/150‑1 (MQ=255) aaaTATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACAAAACATGTGCGCCTTTATACt > 2:324122/1‑150 (MQ=255) tatatGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGATCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAg > 2:2336349/1‑150 (MQ=255) atatGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAgg < 1:126203/150‑1 (MQ=255) atatGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAgg < 1:2595865/150‑1 (MQ=255) tatGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGt < 2:2133061/150‑1 (MQ=255) atGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGtt > 1:2392107/1‑150 (MQ=255) tGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGttt < 1:4321435/150‑1 (MQ=255) gggTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTa > 1:1777844/1‑150 (MQ=255) ggTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTAc > 1:1718855/1‑150 (MQ=255) gTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACa < 1:3123478/150‑1 (MQ=255) ttACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAg < 2:1898118/150‑1 (MQ=255) ttACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAg > 1:2175083/1‑150 (MQ=255) actacCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCg < 1:2644019/150‑1 (MQ=255) acCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCt > 2:4137534/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTa < 2:3134314/150‑1 (MQ=255) ccAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTa < 1:3695775/150‑1 (MQ=255) cAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTAt < 2:1034723/150‑1 (MQ=255) cAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTAt > 2:500914/1‑150 (MQ=255) cAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTAt > 1:1090052/1‑150 (MQ=255) aGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATg > 1:2871232/1‑150 (MQ=255) gCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGATCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATgg > 1:67146/1‑150 (MQ=255) aaaaTCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGaa > 2:601089/1‑150 (MQ=255) aaTCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATc < 1:2405092/150‑1 (MQ=255) cTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCAt > 1:492995/1‑150 (MQ=255) aTCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATTGCTCATCg < 1:2983758/150‑1 (MQ=255) aTCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCg < 1:2462326/150‑1 (MQ=255) cACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGAc > 1:4247734/1‑150 (MQ=255) cACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGAc > 1:2932255/1‑150 (MQ=255) cACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGAc > 2:4149751/1‑150 (MQ=255) cACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGAc < 1:3561227/150‑1 (MQ=255) aCCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACt < 1:776729/150‑1 (MQ=255) cTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACtat < 2:51091/150‑1 (MQ=255) ggTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAAc > 2:3006507/1‑150 (MQ=255) ggTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAAc > 2:1840148/1‑150 (MQ=255) gATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTc < 1:2374045/150‑1 (MQ=255) gCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTCAAc < 2:226302/150‑1 (MQ=255) cGGTGCTCAGTGAGAAAGGACAGTTCAACTGGAACTCCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGTTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTCAAcc < 2:3967057/150‑1 (MQ=255) gTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTCAACCAg > 1:1768688/1‑150 (MQ=255) cTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTCAACCAGAcc > 1:3994425/1‑150 (MQ=255) | TTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTCAACCAGACC > CP009273/3998754‑3999052 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |