| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 4,481,249 | 0 | A | T | 21.3% | 540.1 / 145.7 | 230 | V365E (GTG→GAG) | idnT | L‑idonate and D‑gluconate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (83/98); new base T (25/24); total (108/122) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
TACGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAACACCACACCCGCGGTGGTAATGGCCGCGACGGTGGCAGAGCCCAGAGCGATACGCAACAGCGCCGCAACAGTCCAGCACATCAATAACGGCGAAAGTGTAGTTCCGGTCATTAAGTGTGAAATATAGTGCCCGACACCGCTATCTACTAAT > CP009273/4481100‑4481398 | tACGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAACTAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAaca < 2:3061311/150‑1 (MQ=255)tACGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTAAGTGTGACGCGATCACGCAGCCCGCACCGGGTGCCAGTAACAATAAAGCGGGGTCGGCCAGGGTAAAGTTGATAATCGGCAaca > 1:3575830/1‑150 (MQ=255) cGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAACTAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAacacc < 1:3519377/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |