New junction evidence | |||||||||||
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? | CP009273 | = 3795905 | 181 (0.670) | coding (514/1020 nt) | waaR | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑ alpha‑1,3‑D‑galactosyltransferase |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
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cattAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCa < 1:772814/148‑1 (MQ=255) cTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCa < 1:1011625/150‑1 (MQ=255) tttAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAg > 1:609746/1‑150 (MQ=255) tttAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAg < 1:4192628/150‑1 (MQ=255) gCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATaa < 2:1645702/150‑1 (MQ=255) aaTTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCCTTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAg < 2:4281206/150‑1 (MQ=255) cgcaccttccCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACt > 1:1886640‑M2/11‑150 (MQ=255) ccGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACtt < 2:2607488/150‑1 (MQ=255) aaCACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAgg > 1:3401666/1‑150 (MQ=255) acacCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGgc > 2:3404447/1‑150 (MQ=255) acacCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGgc > 1:3473511/1‑150 (MQ=255) cacCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagattttcttg < 1:1705054‑M2/150‑144 (MQ=255) acCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagattttcttgt < 1:2480055‑M2/150‑145 (MQ=255) acCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagatattcttgt < 1:1041968‑M2/150‑145 (MQ=255) acCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGCCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGgcgc < 1:2307972/150‑1 (MQ=255) cTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGGCGCCt > 2:1629423/1‑150 (MQ=255) cTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGGCGCCt > 2:4034028/1‑150 (MQ=255) tAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGGCGCCtt < 1:1029940/150‑1 (MQ=255) tAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGGCGCCtt > 2:1596439/1‑150 (MQ=255) caCGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCCTTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGGCGCCtta < 2:3717949/149‑1 (MQ=255) aaCGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGGCGCCtta > 2:3926476/1‑150 (MQ=255) aaCGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGGCGCCtta < 2:3717575/150‑1 (MQ=255) | ATCAGGATGTGTTATTTTTTTGATTATTTCTGGCTCATTTAGCATTGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAATAGTCCCCTGACAAATGATATCTGCATCCAGATAAAGGACTTTAGGCGCCTTAT > CP009273/3795759‑3796054 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |