Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 800,779 | G→T | 100% | E607D (GAG→GAT) | ybhJ → | putative hydratase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 800,779 | 0 | G | T | 95.9% | 974.1 / 27.0 | 296 | E607D (GAG→GAT) | ybhJ | putative hydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/9); new base T (147/137); total (150/146) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.23e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.73e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
CGGTGAAACCTCTTCTTATCGTTCAAATCCGATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGAGGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGTGTGATTGGCGGTCTG > CP009273/800632‑800926 | cGGTGAAACCTCTTCTTATCGTTCAAATCCGATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGAGgt < 2:3032261/150‑1 (MQ=255) gAAACCTCTTCTTATCGTTCAAATCCGATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGttt < 2:3762412/150‑1 (MQ=255) aaaCCTCTTCTTATCGTTCAAATCCGATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGACTGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTg > 2:2572284/1‑150 (MQ=255) aCCTCTTCTTTTCGTACAAATCCGTTTGGTGTGGGGTAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTTTGTTAGCTGATTTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTgcg < 1:1353234/150‑1 (MQ=255) ctctTCTTATCGTTCAAATCCGATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTgcgcg > 2:205942/1‑150 (MQ=255) ctctTCTTATCGTTCAAATCCGATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTgcgcg > 1:2800062/1‑150 (MQ=255) ctctTCTTATCGTTAAAATCGGTTTGGTGTGGCGGATTTTACCCGGTCGCGCCGCGATCCGGTTTATGTTAGAATAATTAACGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTgcgcg < 1:927862/150‑1 (MQ=255) cttcttATCGTTCAAATCCGATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCa > 1:675964/1‑150 (MQ=255) cttATCGTTCAAATCCGATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTa > 1:4685928/1‑150 (MQ=255) tCGTTCAAATCCGATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCa > 1:1035158/1‑150 (MQ=255) gTTCAAATCCGATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGAGGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGa > 2:2571068/1‑150 (MQ=255) tCAAATCCGTTTGGTGTGGGGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGTTCCGGGTTTTGTTCGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGAtt < 1:3481243/150‑1 (MQ=255) aaTCCGATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCt > 2:2538990/1‑150 (MQ=255) ccgttgggTGTGGGGGTGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGTTTTTGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGt < 2:3790483/144‑1 (MQ=255) cGATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTc > 2:1702740/1‑150 (MQ=255) gATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCa > 1:4078127/1‑150 (MQ=255) gATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCa > 1:3632421/1‑150 (MQ=255) gATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGGTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCa > 1:315319/1‑150 (MQ=255) agtGGTCGGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGTTTATGTTAGCAGAAGTAACGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAg < 2:4603113/148‑1 (MQ=255) ggCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCatat > 2:422121/1‑150 (MQ=255) ttgTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTTTTTTAGCAGAATTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGAt < 1:3466125/148‑1 (MQ=255) gAGTTTACCCGGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGAt < 2:3905614/150‑1 (MQ=255) aGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATc > 2:1559601/1‑150 (MQ=255) tttACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCg > 1:789668/1‑150 (MQ=255) tttACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCg > 1:2134429/1‑150 (MQ=255) ttACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGc > 2:3133998/1‑150 (MQ=255) tACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCt > 2:691525/1‑150 (MQ=255) tACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCt > 1:3778715/1‑150 (MQ=255) aCCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTg > 1:2305884/1‑150 (MQ=255) aCCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTg > 1:3205298/1‑150 (MQ=255) ccTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCa > 1:1201860/1‑150 (MQ=255) cTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCaa < 2:3247736/150‑1 (MQ=255) tctcGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACt > 2:429774/1‑150 (MQ=255) ctcGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTg > 1:3381230/1‑150 (MQ=255) tcGCCGCGATCCCGGTTATGTTCGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGa < 2:495554/150‑1 (MQ=255) tcGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGa > 1:3950645/1‑150 (MQ=255) cgcgATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAAtt > 1:4334249/1‑150 (MQ=255) cgcgATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAAtt > 1:2457501/1‑150 (MQ=255) cgcgATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAAtt > 1:64011/1‑150 (MQ=255) gATCCCGGTTATGTTCGCAGAAGTAACGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGgc < 2:838535/150‑1 (MQ=255) ggtttttGTTAGCATAATTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGAGGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCAt < 1:1409633/144‑1 (MQ=255) gggTTTTGTTAGCCTAATTACAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCAt < 1:2007569/149‑1 (MQ=255) ggTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATg > 2:197445/1‑150 (MQ=255) tATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTc > 2:3511781/1‑150 (MQ=255) aTGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCt > 1:1435715/1‑150 (MQ=255) tGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTa > 2:1805347/1‑150 (MQ=255) tgCAGAAGTAACGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCg < 2:1648567/149‑1 (MQ=255) aGCAGAATTAACGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCg < 1:153160/150‑1 (MQ=255) aGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCg < 2:4556372/150‑1 (MQ=255) aGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCg < 2:329701/150‑1 (MQ=255) cAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGt > 2:2978006/1‑150 (MQ=255) cAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGt < 2:2140918/150‑1 (MQ=255) aGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTg < 2:1044543/150‑1 (MQ=255) gAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGTAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGa > 1:597046/1‑150 (MQ=255) tAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAAcc > 2:2806769/1‑150 (MQ=255) aaaGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCa > 1:1364303/1‑150 (MQ=255) gACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGa > 1:2858235/1‑150 (MQ=255) gACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGa > 1:4109653/1‑150 (MQ=255) ctgctgAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATg < 1:682158/150‑1 (MQ=255) ctgAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGtt > 2:948761/1‑150 (MQ=255) ctgAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGtt < 1:1714989/150‑1 (MQ=255) ctgAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGtt > 1:4276410/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCt < 1:1115193/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCt < 1:2060583/150‑1 (MQ=255) aGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTg > 2:4721553/1‑150 (MQ=255) aGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTg > 2:4004844/1‑150 (MQ=255) gCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTgc < 1:1014757/150‑1 (MQ=255) gCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTgc < 1:2548287/150‑1 (MQ=255) 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aaaTCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGa > 2:615793/1‑150 (MQ=255) aaaTCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGa > 1:2670725/1‑150 (MQ=255) aaTCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTACGCAGAGTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGaa < 1:3900/150‑1 (MQ=255) aaTCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGaa > 1:835004/1‑150 (MQ=255) cAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAg > 1:4529983/1‑150 (MQ=255) cAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAg > 1:1872679/1‑150 (MQ=255) cAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAg > 2:2700066/1‑150 (MQ=255) aGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAgg > 1:522609/1‑150 (MQ=255) gTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAggcgg > 2:624575/1‑150 (MQ=255) cGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCt > 2:1497644/1‑150 (MQ=255) ggggTATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTg < 1:1624380/150‑1 (MQ=255) gAATGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCa < 1:3039334/150‑1 (MQ=255) aaTGTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAg > 1:4439007/1‑150 (MQ=255) gTCAGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCgt > 2:2883347/1‑150 (MQ=255) aGCGAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGtgtg > 2:1614498/1‑150 (MQ=255) gCGAGCTGACAGATGTGTGTGCGCGCATTAAGCAGATTGCGGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGTGTGa < 1:4545874/150‑1 (MQ=255) gAGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGTGTGAtt < 2:3950645/150‑1 (MQ=255) aGCTGACAGATGTGTTTGCGCGCAGTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGTGTGATTg < 2:1200582/150‑1 (MQ=255) gCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGTGTGATTgg < 2:3988473/150‑1 (MQ=255) gCTGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGTGTGATTgg < 1:4000514/150‑1 (MQ=255) tGACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGTGTGATTGGCg < 2:789668/150‑1 (MQ=255) gACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGTGTGATTGGCgg > 2:4400615/1‑150 (MQ=255) gACAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGTGTGATTGGCgg > 1:217407/1‑150 (MQ=255) gACAGAGGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGTGTGATTGGCgg < 2:1287040/150‑1 (MQ=255) aCAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGTGTGATTGGCGGt > 2:3404935/1‑150 (MQ=255) aCAGATGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGTGTGATTGGCGGt < 2:1843792/150‑1 (MQ=255) gagGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGTGTGATTGGCGGTCTg < 1:2571068/150‑1 (MQ=255) | CGGTGAAACCTCTTCTTATCGTTCAAATCCGATTGGTCTGGCGGAGTTTACCCTGTCTCGCCGCGATCCCGGTTATGTTAGCAGAAGTAAAGCGACTGCTGAGCTGGAAAATCAGCGTCTGGCGGGGAATGTCAGCGAGCTGACAGAGGTGTTTGCGCGCATTAAGCAGATTGCTGGTCAGGAGCATATTGATCCGCTGCAAACTGAAATTGGCAGCATGGTCTATGCGGTGAAACCAGGCGATGGTTCTGCGCGTGAACAGGCGGCGAGCTGCCAGCGTGTGATTGGCGGTCTG > CP009273/800632‑800926 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |