| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 816,152 | 0 | C | A | 30.2% | 340.8 / 147.2 | 181 | intergenic (+108/‑97) | ybhL/ybhM | UPF0005 family inner membrane protein/UPF0005 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (55/71); new base A (25/30); total (80/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.71e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
TGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCA > CP009273/816004‑816300 | gTTCCTGATTTTGTTGCGTATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTATTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGTATTTTTTTATTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGt < 1:306144/150‑1 (MQ=255) ccTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGtttt < 2:1445448/150‑1 (MQ=255) ccTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTACACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGtttt < 1:332928/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |