Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 92,294 | C→A | 24.7% | R386R (CGC→CGA) | murF → | UDP‑N‑acetylmuramoyl‑tripeptide:D‑alanyl‑D‑ alanine ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 92,294 | 0 | C | A | 24.7% | 866.1 / 246.5 | 364 | R386R (CGC→CGA) | murF | UDP‑N‑acetylmuramoyl‑tripeptide:D‑alanyl‑D‑ alanine ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (109/165); new base A (39/51); total (148/216) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.21e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.57e-01 |
Only 100 of 367 total aligned reads displayed.
TCGGTTCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTAAGCGTGGGTAAACAAAGCCATGCTATCAGCACCGCCAGCGGCGTTGGCGAACATTTTGCTGATAAAACTGCGTTAATTACGCGTCTTAAATTACTGATTGCTGAGCAACAGGTAATTACGATTTTAGTTAAGGGTTCACGTA > CP009273/92146‑92442 | ttCAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGAGTGtt > 2:1307974/1‑150 (MQ=255) cAATGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTaa > 2:387188/1‑150 (MQ=255) aaTGACTGCAGCAGTCCAGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGAGTGTTAAg > 2:4752192/1‑150 (MQ=255) 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aGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGAGTGTTAAGCGTGGGTAAACAAAGcc > 2:1524283/1‑150 (MQ=255) aGGTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGAGTGTTAAGCGTGGGTAAACAAAGcc < 2:913448/150‑1 (MQ=255) ggTACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTAAGCGTGGGTAAACAAAGCCa < 1:3981124/150‑1 (MQ=255) tACTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTAAGCGTGGGTAAACAAAGCCATg < 2:3758787/150‑1 (MQ=255) aCTGGCTGAAATGCCGGGCTACCGCGTGCTGGTGGTGGGCGATATGGCGGAACTGGGCGCTGAAAGCGAAGCCTGCCATGTACAGGTGGGCGAGGCGGCAAAAGCTGCTGGTATTGACCGCGTGTTAAGCGTGGGTAAACAAAGCCATGc < 2:4070731/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |