| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 976,873 | 0 | C | A | 30.2% | 686.7 / 301.3 | 356 | A124E (GCG→GAG) | ldtD | murein L,D‑transpeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (108/140); new base A (56/52); total (164/192) | |||||||||||
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Only 100 of 359 total aligned reads displayed.
CCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTC > CP009273/976724‑977019 | cgcacgcaAATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCg < 1:392027/150‑1 (MQ=255) cacgcaAATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGAt > 1:4339206/1‑150 (MQ=255) acgcaAATCGAATCTCAAGTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGAtt < 1:3711447/150‑1 (MQ=255) 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ccTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTg > 1:220104/1‑150 (MQ=255) tCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCaa < 2:2315321/150‑1 (MQ=255) aGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAata < 2:3801069/150‑1 (MQ=255) aGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAata > 2:3031948/1‑150 (MQ=255) aGCAACAGCTGGCAGAGGTGGAGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAata > 1:472695/1‑150 (MQ=255) aGCAACAGCTGGCAGAGGTGGAGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAACAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAata > 2:1010929/1‑150 (MQ=255) cAACAGCTGGCAGAGGTGGAGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATAtt < 2:4717820/150‑1 (MQ=255) aaCAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTc > 2:1245846/1‑150 (MQ=255) cAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCg > 1:618272/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCAGAGGTGGAGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCgg < 1:278084/150‑1 (MQ=255) 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gTGGAGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACt > 1:3413059/1‑150 (MQ=255) tGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTc < 2:2388568/150‑1 (MQ=255) | CCGCACGCAAATCGAATCTCAATTACCCGCAGGTTACAAGCCGGTTTATCTTAACCAGCTTCAACTGTTGTATGCCGCACGCGATATGCAACCCATGTGGGAAAACCGTGATGCTGTTAAAGCCTTCCAGCAACAGCTGGCAGAGGTGGCGATTGCCGGTTTCCAGCCGCAGTTTAATAAATGGGTAGAGTTACTGACCGATCCTGGTGTTAACGGGATGGCACGCGACGTGGTGCTCTCTGATGCGATGATGGGCTATCTCCATTTCATTGCAAATATTCCGGTCAAAGGCACTC > CP009273/976724‑977019 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |