Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,193,516 | T→G | 15.4% | N60H (AAT→CAT) | ymfE ← | e14 prophage; putative inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,193,516 | 0 | T | G | 15.4% | 219.9 / 41.3 | 91 | N60H (AAT→CAT) | ymfE | e14 prophage; putative inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/42); new base G (3/11); total (38/53) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.41e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 |
GTTTTATAATTAGATGCTTATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTCATTATAAT > CP009273/1193375‑1193665 | gTTTTATAATTAGATGCTTATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATGAATAAAGc > 1:125345/1‑150 (MQ=255) ttttATAATTAGATGCTTATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATGAATAAAGct < 2:2489242/150‑1 (MQ=255) ttttATAATTAGATGCTTATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATGAATAAAGct < 2:2771682/150‑1 (MQ=255) tttATAATTAGATGCTTATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGctc > 1:1309600/1‑150 (MQ=255) tttATAATTAGATGCTTATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGctc > 1:2610612/1‑150 (MQ=255) taATTAGATGCTTATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCAt < 2:2402079/150‑1 (MQ=255) taATTAGATGCTTATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCAt < 2:2402083/150‑1 (MQ=255) aaTTAGATGCTTATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATg > 2:3276027/1‑150 (MQ=255) aaTTAGATGCTTATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATGAATAAAGCTCTCATg > 2:216245/1‑150 (MQ=255) gATGCTTATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATGAATAAAGCTCTCATGATCtt < 2:4476936/150‑1 (MQ=255) gATGCTTATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATGAATAAAGCTCTCATGATCtt < 2:4475385/150‑1 (MQ=255) tGCTTATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTa < 1:2058773/150‑1 (MQ=255) tATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATGAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAg > 1:4080822/1‑150 (MQ=255) cccAAAGATTTCGCACCCGTAGTAGTTTTGCTGCTTTTTTTTGTAGGTCTAACGCACCGGTAATTAAATATGCAAAAATCGCTAAAGCACATGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTg < 1:3567190/150‑1 (MQ=255) cccAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTg > 1:1571727/1‑150 (MQ=255) cccAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTg > 2:1083514/1‑150 (MQ=255) cAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTggg > 2:3088196/1‑150 (MQ=255) cAAAGATATCGCACACGAAGTATTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTggg < 2:2134858/150‑1 (MQ=255) aaaGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGa > 2:1579775/1‑150 (MQ=255) aaaGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGa > 2:1579779/1‑150 (MQ=255) aaaGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGa > 2:1580589/1‑150 (MQ=255) aaaGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGa > 1:3403237/1‑150 (MQ=255) aaGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGAc > 2:294573/1‑150 (MQ=255) aaGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGAc < 2:3754799/150‑1 (MQ=255) gATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACAt > 2:4527508/1‑150 (MQ=255) tCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACtt > 1:2386512/1‑150 (MQ=255) cGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACttg > 1:302373/1‑150 (MQ=255) cGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACttg < 1:288250/150‑1 (MQ=255) gCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACttgg < 2:4170197/150‑1 (MQ=255) gCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACttgg < 2:4166494/150‑1 (MQ=255) gCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACttgg < 2:754394/150‑1 (MQ=255) gAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTa < 2:2913374/150‑1 (MQ=255) aaGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATGAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATATGTGGGACATACTTGGTTGGTaa < 1:2101267/150‑1 (MQ=255) agtagtTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAAt < 1:3448683/150‑1 (MQ=255) gtagtTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACACGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATg > 1:4702709/1‑150 (MQ=255) gtagtTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCCTGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATg < 2:716324/150‑1 (MQ=255) gtagtTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATg < 2:716513/150‑1 (MQ=255) tagtTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGt > 2:1334334/1‑150 (MQ=255) gtTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGtta < 2:195241/150‑1 (MQ=255) gtTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGtta < 1:2949278/150‑1 (MQ=255) gtTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGtta < 2:1070431/150‑1 (MQ=255) gtTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGtta < 2:194068/150‑1 (MQ=255) tttGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGttat < 2:1158977/150‑1 (MQ=255) ttGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGttatt < 2:3372646/150‑1 (MQ=255) tGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGttatta < 1:3634645/150‑1 (MQ=255) cTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAg < 2:2543963/150‑1 (MQ=255) tGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAgg > 2:4599898/1‑150 (MQ=255) gCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAggg < 1:3410567/150‑1 (MQ=255) tGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACCTACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGt > 1:3438806/1‑150 (MQ=255) gTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTa < 2:3177397/150‑1 (MQ=255) gTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTa > 1:349253/1‑150 (MQ=255) tGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCg < 1:688281/150‑1 (MQ=255) gTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGt < 1:1616928/150‑1 (MQ=255) tAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTAGTa > 2:4501487/1‑150 (MQ=255) aGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTaa < 1:2534770/150‑1 (MQ=255) aGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTaa < 1:2534754/150‑1 (MQ=255) cTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATaa > 2:3180003/1‑150 (MQ=255) cTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACGTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATaa > 2:3179358/1‑150 (MQ=255) cTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATAATTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATaa < 2:599551/150‑1 (MQ=255) aaCGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACt > 2:4000242/1‑150 (MQ=255) aCGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTa < 2:1309600/150‑1 (MQ=255) gCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGa < 2:4515811/150‑1 (MQ=255) gCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGa < 2:4515993/150‑1 (MQ=255) gCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGa > 1:787551/1‑150 (MQ=255) gCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTCGAAGTAt > 1:3110419/1‑150 (MQ=255) cTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATg > 2:1810069/1‑150 (MQ=255) tAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAata < 2:1571727/150‑1 (MQ=255) atatGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATGAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAatatat < 1:3353760/150‑1 (MQ=255) atatGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATGAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAatatat < 1:957579/150‑1 (MQ=255) cAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCg < 1:2673396/150‑1 (MQ=255) aaTCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTAtt > 1:2465901/1‑150 (MQ=255) aaTCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTAtt > 1:2464795/1‑150 (MQ=255) tCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTa < 1:2136153/150‑1 (MQ=255) cAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGa > 1:993014/1‑150 (MQ=255) gCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGtt > 2:357508/1‑150 (MQ=255) cacaAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTg < 1:2433321/150‑1 (MQ=255) cacaAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTg < 1:397406/150‑1 (MQ=255) cacaAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTg < 1:397110/150‑1 (MQ=255) aaGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCtt > 1:3571247/1‑150 (MQ=255) ggTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTa < 1:294573/150‑1 (MQ=255) gTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTAt > 2:2638315/1‑150 (MQ=255) tAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATGAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATg < 1:2460564/150‑1 (MQ=255) tAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATGAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATg < 1:4754761/150‑1 (MQ=255) tAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATGAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATg < 1:61889/150‑1 (MQ=255) atatACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGaa > 2:195100/1‑150 (MQ=255) tAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACAt < 2:1006839/150‑1 (MQ=255) tAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACAt < 2:4309324/150‑1 (MQ=255) tAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACAt < 2:4307253/150‑1 (MQ=255) cccAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTCAt > 2:2845876/1‑150 (MQ=255) ccAATGAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTCAtt < 1:216245/150‑1 (MQ=255) cAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTCATta > 1:4297141/1‑150 (MQ=255) ttAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTCATTATaa < 1:4599898/150‑1 (MQ=255) taataaAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTCATTATAAt > 2:3576893/1‑150 (MQ=255) taataaAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTCATTATAAt < 1:4503820/150‑1 (MQ=255) | GTTTTATAATTAGATGCTTATCCCAAAGATATCGCACCCGAAGTAGTTTGGCTGCATTGTTATGTAGGTCTAACGCACCGCTAATTAAATATGCAAAAATCGCAAAAGCACAAGGTAATATACCAAAAGATAGTGCCCAATTAATAAAGCTCTCATGATCTTTAATAGGTGGGACATACTTGGTTGGTAATGTTATTAAAGGGATGTATTCGTAAATAACTAGAAGTATGCAATATATTAGCGTATTTAAGAAAGTTGCTTTATGAAGTTTAGGCAACATTTCATTATAAT > CP009273/1193375‑1193665 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |