| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,625,116 | T→A | 5.8% | N19Y (AAC→TAC) | ydfI ← | putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,625,116 | 0 | T | A | 5.8% | 597.0 / 16.2 | 172 | N19Y (AAC→TAC) | ydfI | putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (70/92); new base A (8/2); total (78/94) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.45e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
CGGCAATTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGA > CP009273/1624969‑1625265 | cGGCAATTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGttat > 1:920189/1‑150 (MQ=255) ggCAATTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGttatt < 1:4610720/150‑1 (MQ=255) ggCAATTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGttatt < 2:3165701/150‑1 (MQ=255) ggCAATTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGttatt < 1:377194/150‑1 (MQ=255) gCAATTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGttatta > 2:3000769/1‑150 (MQ=255) aaTTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAg > 2:4012526/1‑150 (MQ=255) tttGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGAt < 1:363560/150‑1 (MQ=255) ttGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATc > 2:585746/1‑150 (MQ=255) tGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATCTCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCa < 2:2156089/150‑1 (MQ=255) tGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCa > 2:1649932/1‑150 (MQ=255) gCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCAt > 1:3954976/1‑150 (MQ=255) cTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATa > 1:1721460/1‑150 (MQ=255) tGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATaa > 2:1838857/1‑150 (MQ=255) gTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATaaa > 2:4742238/1‑150 (MQ=255) gTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATaaa < 1:411028/150‑1 (MQ=255) gTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATaaa < 1:411026/150‑1 (MQ=255) gTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATaaa > 2:4742409/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATTTTCCCTAGCAAGAAAATCGGCATACACACCCTGATTCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAAATCTTGGAGCCAGCTTATTAAGATCATAAAc > 1:1369453/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAAc < 1:1836619/150‑1 (MQ=255) cgccgcCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAg > 2:1072304/1‑150 (MQ=255) gccgccGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAgg < 1:3984223/150‑1 (MQ=255) cgccgATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGa < 1:4569031/150‑1 (MQ=255) cgATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAgtg < 2:4517400/150‑1 (MQ=255) gATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGTTGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAgtgt < 1:2479006/150‑1 (MQ=255) gATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAgtgt < 1:2480216/150‑1 (MQ=255) aaGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCt < 1:3157025/150‑1 (MQ=255) ttGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCtttt < 1:1940240/150‑1 (MQ=255) tGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTg < 2:715633/150‑1 (MQ=255) gACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGc > 1:3959176/1‑150 (MQ=255) ccTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTg > 2:2082254/1‑150 (MQ=255) tCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGAt < 2:881613/150‑1 (MQ=255) tCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGAt < 2:2730531/150‑1 (MQ=255) ataataTCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATaa < 1:2818615/150‑1 (MQ=255) aataTCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACa < 2:626196/150‑1 (MQ=255) aataTCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACa < 1:1518962/150‑1 (MQ=255) atCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAat < 2:1958990/150‑1 (MQ=255) ccAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAAAAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAattatt > 2:2007177/1‑150 (MQ=255) cAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTAttt > 1:340465/1‑150 (MQ=255) aGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTAttta > 1:3725051/1‑149 (MQ=255) aGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTc > 2:4222268/1‑150 (MQ=255) aGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTc > 2:4220162/1‑150 (MQ=255) gTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTcc < 1:241568/150‑1 (MQ=255) tGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCaaaa > 2:3763839/1‑150 (MQ=255) tGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATaa < 1:305810/150‑1 (MQ=255) gAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAAc < 2:2907602/150‑1 (MQ=255) ttCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTcc > 2:4024598/1‑150 (MQ=255) tCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCt < 1:121890/150‑1 (MQ=255) tCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCt < 2:942360/150‑1 (MQ=255) tCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCt < 2:103352/150‑1 (MQ=255) tCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCGTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTACt > 2:1654938/1‑150 (MQ=255) ccGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCtt < 1:2150277/150‑1 (MQ=255) aGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTtaaat > 2:2425688/1‑150 (MQ=255) cAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTtaaatat < 2:1833308/150‑1 (MQ=255) cAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTtaaatat < 2:2432983/150‑1 (MQ=255) atatCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTtaaatataaata < 2:698098/150‑1 (MQ=255) tatCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTaaatataaatat > 2:1129637/1‑150 (MQ=255) aTNCACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCCAGc > 1:620875/1‑150 (MQ=255) ccTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGtt < 1:1746050/150‑1 (MQ=255) tGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGtttt < 1:3785069/150‑1 (MQ=255) tGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGtttt > 2:438491/1‑150 (MQ=255) tGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTACCATAACAATTCCTTAAATATAAATATTGCAAGCTATATGtttt > 2:2676892/1‑150 (MQ=255) tGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCAGACACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATGTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGtttt < 1:3785216/150‑1 (MQ=255) aTGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGt < 2:2075180/150‑1 (MQ=255) gcACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTtata > 2:4334268/1‑150 (MQ=255) ggTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGaa > 2:2601309/1‑150 (MQ=255) gTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAAt < 2:3299916/150‑1 (MQ=255) gAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTTTTATATGAATaa > 2:2623904/1‑150 (MQ=255) gAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATaa < 1:4526134/150‑1 (MQ=255) gAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATaa < 1:760239/150‑1 (MQ=255) aTGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGTGAGTGTCGCTTTTGCTGAAAACAAATTATTTCACATAAAAATTACTTAAATATAAATATGGCAATCTATATTTTTTTTTATATGAATaaaaa > 2:471223/1‑150 (MQ=255) gCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAAAAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAAta > 1:1421235/1‑149 (MQ=255) cACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAAAAAATTATTTACCATAAAAAATACTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATca > 2:2095494/1‑149 (MQ=255) cAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTTCTGATAAAAAAATATTTAACATAAAAAATACTTAAATATAAATATTGCAAGCTATATGTTTTTTTATATGAAAAAAAAtaacca > 1:2134029/1‑145 (MQ=255) cAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCct < 2:4628214/150‑1 (MQ=255) ccTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCg < 2:3530434/150‑1 (MQ=255) tAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGt > 2:1876971/1‑150 (MQ=255) tAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTACCAAAACAATTACTTAAATATAAATATTTCAAGCAATATTTTTTGTTATATTTATAAAAATCCCCACTCAGGt > 1:2011452/1‑150 (MQ=255) tAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGt < 1:4746074/150‑1 (MQ=255) caTGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATAGAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTaa < 2:1369453/149‑1 (MQ=255) aTGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCAGAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAag < 1:4262217/150‑1 (MQ=255) cAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTACGGTAAGAGAAg > 1:291114/1‑150 (MQ=255) aaTTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAgg > 2:3663154/1‑150 (MQ=255) aaTTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAgg > 2:4104421/1‑150 (MQ=255) aaTTCTTGGAGCCAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAgg < 1:585746/150‑1 (MQ=255) aTTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAggg > 2:3921543/1‑150 (MQ=255) cTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGAtt < 1:1035797/150‑1 (MQ=255) ttGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTTCTGATAAAAAATTATTTACCAAAACAAATCCATAAATATAAAAATTGCAAGCTATATGTTTTGTTATATTAATAAAAAAACCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTa > 1:2455533/1‑150 (MQ=255) ttGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTa > 1:2777114/1‑150 (MQ=255) ggAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAAGTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAg < 2:186184/150‑1 (MQ=255) aGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAggg < 2:4629145/150‑1 (MQ=255) aGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAggg < 2:2262772/150‑1 (MQ=255) aGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTACTTAAATATAAATATTGCAAGCTATATGTTTTGTTATATTAATAAAAATACCCTATCCGGTAAGAGAAGGGATTAAggg > 2:3731292/1‑150 (MQ=255) cAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTGGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGttt < 2:3333071/150‑1 (MQ=255) cAGGTAATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAAAAAAATATTTCCCAAAAAAATTACTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTTTTATATTAATAAAAATACCCTCAACGGTAAGAGAATGGATTAATGGttt > 1:2824641/1‑150 (MQ=255) aGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTa < 1:2166463/150‑1 (MQ=255) aGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTa < 2:3954977/150‑1 (MQ=255) aGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTACTTAAATATAAATATTGCAAGCTATATGTTTTGTTATATTAATAAAAATACCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTa > 2:3042256/1‑150 (MQ=255) ggTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTAc < 1:1092496/150‑1 (MQ=255) tattaAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGTATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGa > 2:796358/1‑150 (MQ=255) tattaAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTACCATAACAAATCCTTAAAAATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCACTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGa > 1:638116/1‑150 (MQ=255) | CGGCAATTTGCTGTTCGCCGCCGATTAAGTTGACCTCATAATATCCCCAGTCACTGAAATGTTCCGTAGCAAGAATATCGGCATACACACCCTGATGCGCACGGTGAAATGCACCAAAGCCTAAATGAACAATTCTTGGAGCCAGGTTATTAAGATCATAAACAGGGAGTGTCGCTTTTGCTGATAACAAATTATTTCCCATAACAATTCCTTAAATATAAATATGGCAAGCTATATGTTTTGTTATATGAATAAAAATCCCCTCTCCGGTAAGAGAAGGGATTAAGGGTTTACAGA > CP009273/1624969‑1625265 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |