| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,979,691 | C→A | 7.4% | intergenic (‑82/‑715) | araF ← / → ftnB | L‑arabinose transporter subunit/ferritin B, putative ferrous iron reservoir |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,979,691 | 0 | C | A | 7.4% | 678.8 / 3.3 | 206 | intergenic (‑82/‑715) | araF/ftnB | L‑arabinose transporter subunit/ferritin B, putative ferrous iron reservoir |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (60/118); new base A (26/2); total (86/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.82e-09 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |