| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,999,632 | G→T | 87.3% | intergenic (+73/‑5) | fliT → / → amyA | putative flagellar synthesis and assembly chaperone/cytoplasmic alpha‑amylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,999,632 | 0 | G | T | 87.3% | 730.3 / 101.9 | 276 | intergenic (+73/‑5) | fliT/amyA | putative flagellar synthesis and assembly chaperone/cytoplasmic alpha‑amylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (22/13); new base T (105/136); total (127/149) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
GCAAAAATCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGCCGCCCGCCTATAAAGGCGCAT > CP009273/1999487‑1999781 | cAAAAATCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCgaagaa < 1:1283552/150‑1 (MQ=255) aaaaaTCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAAt < 2:4594897/150‑1 (MQ=255) aaaaaTCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAAt < 2:2001132/150‑1 (MQ=255) aTCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGt < 1:3806275/150‑1 (MQ=255) aTCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGt < 1:1925841/150‑1 (MQ=255) tgtTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATcc > 1:582084/1‑150 (MQ=255) tgtTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATcc < 2:2534671/150‑1 (MQ=255) gtTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATccc < 1:3155707/150‑1 (MQ=255) ttAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCa > 1:1086991/1‑150 (MQ=255) tGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTg < 2:583282/150‑1 (MQ=255) cTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTa > 1:649025/1‑150 (MQ=255) gCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATg < 1:2641214/150‑1 (MQ=255) cGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGt < 2:548965/150‑1 (MQ=255) tCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGtttt < 1:4356852/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTc > 1:2530770/1‑150 (MQ=255) gggCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCAc < 1:507647/150‑1 (MQ=255) ggcggcTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACt < 2:269883/150‑1 (MQ=255) ggcggcTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACt < 2:1097054/150‑1 (MQ=255) cggcTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTgg < 1:1763755/150‑1 (MQ=255) ggcTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGt < 1:399508/150‑1 (MQ=255) tttGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTAtt < 2:735989/150‑1 (MQ=255) tgtgCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTAc > 2:611684/1‑150 (MQ=255) tgCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTAccc < 2:4044664/150‑1 (MQ=255) tGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGa > 2:1941636/1‑150 (MQ=255) gCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAg > 2:528374/1‑150 (MQ=255) cTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAgg < 1:1579255/150‑1 (MQ=255) cGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCgg > 2:1691003/1‑150 (MQ=255) cGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCgg > 2:3964193/1‑150 (MQ=255) cAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTa < 2:1358921/150‑1 (MQ=255) cAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTa < 1:3041745/150‑1 (MQ=255) aGGATAACCTCTTTTGCATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTaa < 1:2694095/150‑1 (MQ=255) gATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGc < 1:2928414/150‑1 (MQ=255) aTAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGct > 1:780579/1‑150 (MQ=255) tAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGctc > 2:3352050/1‑150 (MQ=255) tAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGctc < 1:1605123/150‑1 (MQ=255) aaCCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGctct > 2:1145361/1‑150 (MQ=255) ctctTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGc > 2:2838316/1‑150 (MQ=255) tttGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGa > 2:4138142/1‑150 (MQ=255) tttGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGa < 1:4248153/150‑1 (MQ=255) gAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACt < 2:1047174/150‑1 (MQ=255) gAATCTGAATGAGTAGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACt < 1:2021239/150‑1 (MQ=255) aaTCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTg < 1:4154813/150‑1 (MQ=255) aaTCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTg < 1:3440031/150‑1 (MQ=255) aaTCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTg > 1:3654296/1‑150 (MQ=255) gAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTCAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGACCTGGCCGa > 2:3894891/1‑150 (MQ=255) aaTGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTATAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAg > 2:2931985/1‑150 (MQ=255) aTGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAgc > 2:4389792/1‑150 (MQ=255) tGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAgcg < 1:2342898/150‑1 (MQ=255) cGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCg < 1:1101848/150‑1 (MQ=255) gATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGa > 2:2752387/1‑150 (MQ=255) gATGGCTAGCGAATAATCAGATTACTGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTTAATGGAGTCTAAGATTGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTTTTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGTACTGGCCGAGCGCGCCGa < 2:2584834/150‑1 (MQ=255) gCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGt < 1:960501/150‑1 (MQ=255) gCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGt < 1:3767967/150‑1 (MQ=255) gCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGt < 2:2246387/150‑1 (MQ=255) cTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGtt > 2:4216831/1‑150 (MQ=255) tCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGttt > 2:331662/1‑150 (MQ=255) tgcgAATAATCCGATGACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAAGGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGtttt < 1:821767/149‑1 (MQ=255) cgcgAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGtttt > 1:1923118/1‑150 (MQ=255) gAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAAt > 2:667573/1‑150 (MQ=255) gAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAAt < 1:4084895/150‑1 (MQ=255) aatCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGata > 2:1475856/1‑150 (MQ=255) atCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGatat > 1:2775382/1‑150 (MQ=255) tCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATAtt < 1:3044633/150‑1 (MQ=255) cGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTgg < 2:3158888/150‑1 (MQ=255) aTTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTa > 1:3249672/1‑150 (MQ=255) ttACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTAt < 2:3430961/150‑1 (MQ=255) ttACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTAt < 1:3497172/150‑1 (MQ=255) ttACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTAt < 1:41121/150‑1 (MQ=255) ttACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTAt < 2:1086139/150‑1 (MQ=255) gCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAata < 2:3749655/150‑1 (MQ=255) gCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAata < 2:1081468/150‑1 (MQ=255) cTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAatat < 1:4520261/150‑1 (MQ=255) aCGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATgg < 2:4094806/150‑1 (MQ=255) aCGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATgg > 1:235802/1‑150 (MQ=255) gCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTc > 1:4164600/1‑150 (MQ=255) gCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTc > 2:4127528/1‑150 (MQ=255) gCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTc < 2:2491533/150‑1 (MQ=255) cTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCt < 1:2140815/150‑1 (MQ=255) tAATGTTCCCCTTGATTGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGtt < 2:3265003/150‑1 (MQ=255) tAATGGTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGtt < 2:769101/150‑1 (MQ=255) aTGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTgc < 1:588125/150‑1 (MQ=255) tGTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTgcc < 2:4536623/150‑1 (MQ=255) gTTCCCCTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTgccg > 2:2979224/1‑150 (MQ=255) ccccTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGccgccc < 2:4268922/150‑1 (MQ=255) ccccTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGccgccc > 1:690855/1‑150 (MQ=255) ccccTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGccgccc > 2:4626717/1‑150 (MQ=255) ccccTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGccgccc > 1:1599541/1‑150 (MQ=255) ccccTTGAAGGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGccgccc < 2:3446241/150‑1 (MQ=255) cccTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGccgcccg < 1:843818/150‑1 (MQ=255) accTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGccgcccg > 2:1596/2‑150 (MQ=255) ccTTGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGccgcccgc > 1:2565204/1‑150 (MQ=255) tGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGCCGCCCGCCta < 1:4454781/150‑1 (MQ=255) tGAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGCCGCCCGCCta > 2:2757204/1‑150 (MQ=255) gAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGCCGCCCGCCtat < 2:3518972/150‑1 (MQ=255) gAATGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGCCGCCCGCCtat < 2:440626/150‑1 (MQ=255) aaTGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGCCGCCCGCCtata < 2:4115399/150‑1 (MQ=255) aTGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGCCGCCCGCCTATaa < 1:314445/150‑1 (MQ=255) aTGGAGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGCCGCCCGCCTATaa > 2:1772538/1‑150 (MQ=255) aGTCTAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGCCGCCCGCCTATAAAGgc > 2:4313113/1‑150 (MQ=255) gaagaaTGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGCCGCCCGCCTATAAAGGCGCAt > 2:2290560/1‑150 (MQ=255) | GCAAAAATCGGTGTTAAGTGCCTATGGCGATCAGGGCGGCTTTGTGCTGGCTCCGCAGGATAACCTCTTTTGAATCTGAATGAGTCGATGGCTCGCGAATAATCCGATTACGGCTACGCTTCTAATGTTCCCCTTGAATGGAGTCGAAGAATGCGTAATCCCACGCTGTTACAATGTTTTCACTGGTATTACCCGGAAGGCGGTAAGCTCTGGCCTGAACTGGCCGAGCGCGCCGACGGTTTTAATGATATTGGTATCAATATGGTCTGGTTGCCGCCCGCCTATAAAGGCGCAT > CP009273/1999487‑1999781 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |