| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,102,205 | C→A | 10.8% | V287V (GTG→GTT) | wzxB ← | putative polisoprenol‑linked O‑antigen transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,102,205 | 0 | C | A | 10.8% | 483.3 / 31.0 | 140 | V287V (GTG→GTT) | wzxB | putative polisoprenol‑linked O‑antigen transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (63/60); new base A (10/5); total (73/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
AGAGGCGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAG > CP009273/2102056‑2102354 | agagGCTATATAATCATTATCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATc < 2:4653843/150‑1 (MQ=255)agagGCGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATc > 1:789464/1‑150 (MQ=255)agagGCGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTAGTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATc > 1:788719/1‑150 (MQ=255) agGCGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATcac > 1:3348291/1‑150 (MQ=255) gATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACAccc > 1:513627/1‑150 (MQ=255) atatAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCt < 2:1938265/150‑1 (MQ=255) atatAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACACt > 2:3027323/1‑150 (MQ=255) taATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTca > 2:3964927/1‑150 (MQ=255) aTCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTcaca > 1:2285924/1‑150 (MQ=255) aTTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGa < 1:236509/150‑1 (MQ=255) ttAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGAt > 1:1623324/1‑150 (MQ=255) ttAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGAt > 1:1623205/1‑150 (MQ=255) gCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTaa < 2:3226734/150‑1 (MQ=255) acaATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGa > 2:1780236/1‑150 (MQ=255) aTCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACa < 2:3316000/150‑1 (MQ=255) aTCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACa > 1:3132284/1‑150 (MQ=255) cTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCg > 1:2095136/1‑150 (MQ=255) tGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGt < 1:3431279/150‑1 (MQ=255) cATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTAc < 2:2956147/150‑1 (MQ=255) aTTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACt > 2:436599/1‑150 (MQ=255) tATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTg > 1:956602/1‑150 (MQ=255) tATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTg < 1:233770/150‑1 (MQ=255) atatCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGTGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGatat < 1:3594191/150‑1 (MQ=255) tCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCt > 1:1172115/1‑150 (MQ=255) ccGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTg < 2:669281/150‑1 (MQ=255) ccTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGtat > 2:4207875/1‑150 (MQ=255) cTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGtata > 1:1069001/1‑150 (MQ=255) cTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGtata < 2:4409874/150‑1 (MQ=255) cTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGtata > 1:427525/1‑150 (MQ=255) taCTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTg < 1:3900672/150‑1 (MQ=255) aCTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGc > 1:1427974/1‑150 (MQ=255) ttATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCtt < 2:3668757/150‑1 (MQ=255) ttATTTTTACTAGTATAGATGCACACAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAATCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACAAGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCtt > 2:1788396/1‑150 (MQ=255) tATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTg > 2:1029034/1‑150 (MQ=255) ttttACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGt < 1:3613117/150‑1 (MQ=255) ttACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACTAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGa > 1:4235044/1‑150 (MQ=255) ttACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGa > 1:4244858/1‑150 (MQ=255) tACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGAt < 1:3641697/150‑1 (MQ=255) aCTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATa > 2:1952567/1‑150 (MQ=255) aCTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATa > 2:1355537/1‑150 (MQ=255) tAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAgg < 2:2387872/150‑1 (MQ=255) aGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGa > 2:4340584/1‑150 (MQ=255) taGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATTACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTa < 2:3464977/150‑1 (MQ=255) taGATGCACCCAAGAGCAGAAATAATGAAAAAGCACCACCACTCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATTACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTa < 2:3464091/150‑1 (MQ=255) gCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGc < 1:1265590/150‑1 (MQ=255) cACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGcc > 1:3145091/1‑150 (MQ=255) ccAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCtt < 2:4223464/150‑1 (MQ=255) cAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCCAGCAGGTCACTGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTg < 2:2568459/150‑1 (MQ=255) aaGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGa < 2:513627/150‑1 (MQ=255) cgagCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGaa > 2:3181632/2‑150 (MQ=255) agagCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGaa < 2:1509200/150‑1 (MQ=255) agCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAgc > 1:283600/1‑150 (MQ=255) agCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAgc > 1:285890/1‑150 (MQ=255) gAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTCTATTGCGTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGt > 2:4142398/1‑150 (MQ=255) gAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGt > 2:4142494/1‑150 (MQ=255) ttAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTc < 2:789464/150‑1 (MQ=255) tAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCt < 2:3463764/150‑1 (MQ=255) tAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCt > 2:3666362/1‑150 (MQ=255) aTGAAAAATCACCACCAATCAAACTCAAGCACGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTTATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTta < 2:811688/150‑1 (MQ=255) aTGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTta < 2:12054/150‑1 (MQ=255) gAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTtata < 2:2578258/150‑1 (MQ=255) aaGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTAt < 2:1623324/150‑1 (MQ=255) aaGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTAt > 1:3810878/1‑150 (MQ=255) gCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTg < 2:884239/150‑1 (MQ=255) gCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTg < 2:884173/150‑1 (MQ=255) ccaATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCa < 2:3132284/150‑1 (MQ=255) caATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCag > 2:4634663/1‑149 (MQ=255) caATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCAt > 2:4634512/1‑150 (MQ=255) caATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCAt > 1:4119174/1‑150 (MQ=255) caATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCAt > 2:530567/1‑150 (MQ=255) aaTCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCAtt < 1:3964927/150‑1 (MQ=255) tCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTaa < 1:619473/150‑1 (MQ=255) aaCTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAAt > 1:4512446/1‑150 (MQ=255) tCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTcc < 2:2875801/150‑1 (MQ=255) aGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTa < 2:2285924/150‑1 (MQ=255) aGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTa < 2:762094/150‑1 (MQ=255) cAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACg > 1:4129719/1‑150 (MQ=255) cAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACg > 1:1448814/1‑150 (MQ=255) ggTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGa > 2:1087266/1‑150 (MQ=255) gTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGAc < 1:4568500/150‑1 (MQ=255) gTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGAc < 2:2833194/150‑1 (MQ=255) gTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGAc < 1:2676072/150‑1 (MQ=255) tCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACg < 1:928030/150‑1 (MQ=255) cAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGt > 1:2090755/1‑150 (MQ=255) aTGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTg > 1:2784826/1‑150 (MQ=255) aTGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTg < 1:3027328/150‑1 (MQ=255) aTGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTg < 1:3027323/150‑1 (MQ=255) ttttttAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTcc < 1:1780236/150‑1 (MQ=255) ttttAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAg < 1:2087158/150‑1 (MQ=255) taattaaAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGata < 2:1632149/150‑1 (MQ=255) taattaaAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGata > 1:4258892/1‑150 (MQ=255) taattaaAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGata < 1:3574059/150‑1 (MQ=255) aattaaAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGatat > 2:3796776/1‑150 (MQ=255) ttaaAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATaa > 2:1218557/1‑150 (MQ=255) taaAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATaaa < 2:1246793/150‑1 (MQ=255) aTCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATccc > 1:3664257/1‑150 (MQ=255) aTCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATccc > 1:3664362/1‑150 (MQ=255) tCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCa > 2:2785478/1‑150 (MQ=255) cacaCCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAg < 2:2887155/150‑1 (MQ=255) cacaCCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAg > 1:1790917/1‑150 (MQ=255) | AGAGGCGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAG > CP009273/2102056‑2102354 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |