| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,144,474 | C→A | 93.3% | intergenic (‑8/‑192) | yegI ← / → yegJ | protein kinase‑related putative non‑specific DNA‑binding protein/uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,144,474 | 0 | C | A | 93.3% | 517.4 / 27.2 | 165 | intergenic (‑8/‑192) | yegI/yegJ | protein kinase‑related putative non‑specific DNA‑binding protein/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/7); new base A (65/89); total (69/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 | |||||||||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
GTGGCGGCGTGTGATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCC > CP009273/2144325‑2144620 | gTGGCGGCGTGTGATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTc < 2:1221126/150‑1 (MQ=255) ggcggcGTGTGATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTagc < 2:1834656/150‑1 (MQ=255) gcggcgTGTGATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTagcg > 1:206803/1‑150 (MQ=255) ggcgTGTGATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCggg > 2:4700301/1‑150 (MQ=255) cgTGTGATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTa < 1:1189660/150‑1 (MQ=255) tgATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGtta > 2:3648576/1‑150 (MQ=255) aTAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGttata > 1:4723038/1‑150 (MQ=255) aaaTCCTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGttatatt < 1:1996840/150‑1 (MQ=255) aaTCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGttatatta < 2:4241039/150‑1 (MQ=255) aTCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGttatattat > 2:4231658/1‑150 (MQ=255) aTCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGttatattat > 1:288617/1‑150 (MQ=255) tCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGttatattata < 2:2749114/150‑1 (MQ=255) tCTTGGCGACGCGATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGttatattata < 1:1412329/150‑1 (MQ=255) tGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCTATATCATAAACCGCTCCTTCACCTCCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATAttt < 2:2855296/150‑1 (MQ=255) tGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATAttt < 1:3270049/150‑1 (MQ=255) tGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATAttt > 1:2962229/1‑150 (MQ=255) tGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATAttt > 2:4331771/1‑150 (MQ=255) ggCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTc < 1:3392313/150‑1 (MQ=255) cGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCaa > 2:4402137/1‑150 (MQ=255) cGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCaa > 1:4726108/1‑150 (MQ=255) cGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCaa > 2:1998693/1‑150 (MQ=255) cGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGa < 2:2894488/150‑1 (MQ=255) tATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGaata > 2:897335/1‑150 (MQ=255) tATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGaata > 2:1864155/1‑150 (MQ=255) cGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAataata < 2:3711302/150‑1 (MQ=255) taCAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAAtaataa < 1:2424950/149‑1 (MQ=255) aCAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATaac < 2:1629130/150‑1 (MQ=255) cAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATaaca < 2:1230515/150‑1 (MQ=255) cAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATaaca < 2:1396386/150‑1 (MQ=255) aaCTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATaacaac > 1:4230164/1‑150 (MQ=255) ctcctcGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTa < 1:4069453/150‑1 (MQ=255) ctcctcGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTa > 2:2430825/1‑150 (MQ=255) ctcctcGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACGTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTa > 1:4494602/1‑150 (MQ=255) tcctcGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTaa < 1:365725/150‑1 (MQ=255) cGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCAt > 1:3945767/1‑150 (MQ=255) cGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCAt < 2:3939777/150‑1 (MQ=255) gATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCAtt > 1:110541/1‑150 (MQ=255) gATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCAtt > 1:3494879/1‑150 (MQ=255) gATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCAtt > 1:809966/1‑150 (MQ=255) gATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCAtt < 2:629718/150‑1 (MQ=255) tatCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTaa > 2:811128/1‑150 (MQ=255) tCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTaaaa < 1:1974701/150‑1 (MQ=255) cATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAat > 2:4256387/1‑150 (MQ=255) aCCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTAttt > 1:1483093/1‑150 (MQ=255) gcgcCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCta < 2:2618310/150‑1 (MQ=255) cgcCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCtat < 1:1760686/150‑1 (MQ=255) cgcCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCtat < 1:1760750/150‑1 (MQ=255) gcCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAGTGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCtata < 2:2798832/150‑1 (MQ=255) gcCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCtata < 2:2798762/150‑1 (MQ=255) cTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACATTTATAATTTTTTTCAAAATATTTAGCGGGTAGGTATAATATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATg > 1:3890701/1‑150 (MQ=255) accaccTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTATATATGGGGa > 1:2409378/1‑150 (MQ=255) caccTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATTAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGaaa < 2:2857881/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCa < 2:530476/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCa < 2:1071271/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTATATATGGGGAAAACCCACTCa > 2:3413671/1‑150 (MQ=255) ttCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGaa > 1:1474227/1‑150 (MQ=255) ttCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGaa > 2:1870296/1‑150 (MQ=255) tCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTATTTATATTATATTTAAATGAATAATAAAAACTAAACATTAAAATTATTTATATATTGGGAAAACCCACTCAAGAAt > 1:19146/1‑150 (MQ=255) tCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAAt < 1:4004943/150‑1 (MQ=255) cACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATa > 2:4078587/1‑150 (MQ=255) gCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATaaaaa > 2:2737408/1‑150 (MQ=255) gCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATaaaaa < 1:3593726/150‑1 (MQ=255) ccAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAAt < 1:1252373/150‑1 (MQ=255) aaGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGa < 2:3232725/150‑1 (MQ=255) agTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATaa > 2:703084/1‑150 (MQ=255) gTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAAt < 2:1473508/150‑1 (MQ=255) tGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATg < 2:766415/150‑1 (MQ=255) tGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATg > 2:4743883/1‑150 (MQ=255) tCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCaa < 2:2357824/150‑1 (MQ=255) tCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCaa < 2:2357677/150‑1 (MQ=255) tCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCaa < 2:2319181/150‑1 (MQ=255) aaTTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAtt < 2:952997/150‑1 (MQ=255) aaTTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAAtt < 1:3362406/150‑1 (MQ=255) cACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTAt < 1:10007/150‑1 (MQ=255) aCCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATc < 1:4609243/150‑1 (MQ=255) aCCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATc > 2:4008010/1‑150 (MQ=255) gATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATAc < 2:1983667/150‑1 (MQ=255) gTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATAcaat < 1:4407271/150‑1 (MQ=255) aaaTACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATAcaattc > 2:185873/1‑150 (MQ=255) aaTACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATAcaattca > 1:1017541/1‑150 (MQ=255) aTACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATAcaattcaa < 2:4230164/150‑1 (MQ=255) aCTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATAcaattcaatt < 1:4402137/150‑1 (MQ=255) ttttATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTc > 2:3579394/1‑150 (MQ=255) ttATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCgg > 2:1725802/1‑150 (MQ=255) ttATATTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCgg > 2:1725790/1‑150 (MQ=255) tataTTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTATATATGGGGAAAAACCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATAAAATTTCGGc > 1:4575029/1‑150 (MQ=255) atatTTGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGcc > 2:4761559/1‑150 (MQ=255) ttGTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGAt < 1:2233742/150‑1 (MQ=255) tGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATa < 1:2692679/150‑1 (MQ=255) tGTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATa < 1:4720871/150‑1 (MQ=255) gTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATaa < 2:628444/150‑1 (MQ=255) gTTTTCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATaa < 2:627818/150‑1 (MQ=255) ttCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGa > 2:3771410/1‑150 (MQ=255) tCATAATATTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGAt > 2:1277147/1‑150 (MQ=255) ataataTTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACACTTCAATTTCGGCCTGATAATGATTa > 1:4506065/1‑150 (MQ=255) taataTTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTaa < 2:2229638/150‑1 (MQ=255) aataTTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAAc < 1:876803/150‑1 (MQ=255) aataTTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAAc < 1:1671148/150‑1 (MQ=255) atatTTAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACt < 2:3947399/150‑1 (MQ=255) tttAGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTcc < 1:834914/150‑1 (MQ=255) | GTGGCGGCGTGTGATAAATCTTGGCGACGCTATCGACAAACTCCTCGATATCATAAACCGCGCCTTCACCACCTTTGCCCAGTTCACGGCCAAGAGTGGTCAATTCACCTGTCGATGTAAATACTTTTATATTTGTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCC > CP009273/2144325‑2144620 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |