| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,225,190 | C→T | 87.6% | G231G (GGC→GGT) | yohK → | LrgB family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,225,190 | 0 | C | T | 87.6% | 675.3 / 76.1 | 234 | G231G (GGC→GGT) | yohK | LrgB family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (15/14); new base T (90/115); total (105/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.34e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
ACTGCCTCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCATGCATCCACGTTTT > CP009273/2225044‑2225337 | aCTGCCTCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTaa > 2:1834190/1‑150 (MQ=255)aCTGCCTCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTaa > 2:1834224/1‑150 (MQ=255) gCCTCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAAt > 1:308380/1‑150 (MQ=255) ccTCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAAtt < 1:2578980/150‑1 (MQ=255) ccTCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAAtt > 2:353371/1‑150 (MQ=255) ccTCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAAtt < 1:3139309/150‑1 (MQ=255) cTCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAAttt < 2:2745515/150‑1 (MQ=255) tCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTg < 2:4779261/150‑1 (MQ=255) cACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGa > 2:4297390/1‑150 (MQ=255) cACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGa > 2:1416519/1‑150 (MQ=255) aCGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGAGTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGAt > 1:3219895/1‑150 (MQ=255) cccTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAAGGGGTTAAAATTTGCGATGCg > 1:3866677/1‑150 (MQ=255) ccTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGt > 1:4132928/1‑150 (MQ=255) tCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTcg > 2:2269892/1‑150 (MQ=255) cGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTcgc < 1:1847655/150‑1 (MQ=255) cGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTcgc < 2:1325479/150‑1 (MQ=255) ggTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTcgcg > 1:2050952/1‑150 (MQ=255) ggTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTcgcg > 2:2798416/1‑150 (MQ=255) ggTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTcgcg < 2:4187557/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCAttt < 1:1197732/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCAttt < 1:363679/150‑1 (MQ=255) cgcCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGatgtat > 2:4578418/1‑150 (MQ=255) cgcCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGatgtat > 2:1322748/1‑150 (MQ=255) cgcCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGatgtat > 1:228849/1‑150 (MQ=255) aGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTc < 2:386372/150‑1 (MQ=255) gCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCa > 1:2426547/1‑150 (MQ=255) gCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCa < 2:4009236/150‑1 (MQ=255) gCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCa < 2:2207215/150‑1 (MQ=255) gCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCa < 2:528070/150‑1 (MQ=255) ggATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCAcgc > 2:3845413/1‑150 (MQ=255) ggATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCAcgc > 2:2358126/1‑150 (MQ=255) gATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCAcgcg < 1:4607254/150‑1 (MQ=255) gATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCAcgcg < 1:2949864/150‑1 (MQ=255) ttATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGtt < 1:2744856/150‑1 (MQ=255) ttATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGtt > 1:2640825/1‑150 (MQ=255) ttATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGtt < 1:4240360/150‑1 (MQ=255) aTCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGc > 2:2971712/1‑150 (MQ=255) aTCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGc < 2:3762421/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCAt > 1:1727193/1‑150 (MQ=255) cAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCAt > 2:2138095/1‑150 (MQ=255) cAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCAt > 1:3131292/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCAtaat < 1:4663680/150‑1 (MQ=255) aaGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCAtaatt < 1:1834224/150‑1 (MQ=255) aaGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCAtaatt < 1:4026066/150‑1 (MQ=255) aGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCAtaatta < 1:591414/150‑1 (MQ=255) aGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCAtaatta < 2:1635292/150‑1 (MQ=255) ggTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCAtaattaa < 1:62863/150‑1 (MQ=255) ggTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCAtaattaa > 1:3804706/1‑150 (MQ=255) tGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATg > 2:3539350/1‑150 (MQ=255) tGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATg > 2:1405629/1‑150 (MQ=255) cATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATgag > 1:2884447/1‑150 (MQ=255) tAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTc < 1:1029802/150‑1 (MQ=255) aGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCa < 2:3094311/150‑1 (MQ=255) aGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCa > 2:2194210/1‑150 (MQ=255) gTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAg > 2:2402050/1‑150 (MQ=255) gCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATca < 2:1347057/150‑1 (MQ=255) aGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACAGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACat < 1:3471880/150‑1 (MQ=255) tGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATaaa > 2:439884/1‑150 (MQ=255) tgtTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGcc < 1:3767355/150‑1 (MQ=255) tGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATTACATATAAAGCCACAAc < 2:2817078/150‑1 (MQ=255) gCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACg < 1:724493/150‑1 (MQ=255) cGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACgg > 2:4592110/1‑150 (MQ=255) gggATAATTACTTCGCTGATCGCTCCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCTTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACggg < 1:1891880/150‑1 (MQ=255) gggATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACggg > 1:1417622/1‑150 (MQ=255) ggATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGt < 1:4277857/150‑1 (MQ=255) ggATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGt < 2:4063320/150‑1 (MQ=255) aTAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGCTTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTc < 1:3336097/150‑1 (MQ=255) tAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCg < 1:2364839/150‑1 (MQ=255) aTTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTa < 1:1650110/150‑1 (MQ=255) ttACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTaa < 2:3341908/150‑1 (MQ=255) aCTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAAc > 1:1353643/1‑150 (MQ=255) cTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACt < 2:2425914/150‑1 (MQ=255) gtCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTg < 2:290640/149‑1 (MQ=255) cGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGtt < 1:3345184/150‑1 (MQ=255) gCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTa > 2:2319248/1‑150 (MQ=255) gCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTa > 1:4728900/1‑150 (MQ=255) tGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTCAACTGTTATc > 2:2500377/1‑150 (MQ=255) cGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCAt < 2:630630/150‑1 (MQ=255) cACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTa > 2:4716367/1‑150 (MQ=255) aCCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTAc > 2:2653179/1‑150 (MQ=255) cGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACAt > 2:3065705/1‑150 (MQ=255) cGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACAt > 2:1845498/1‑150 (MQ=255) gTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATg > 1:3447465/1‑150 (MQ=255) gTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATg > 1:3597844/1‑150 (MQ=255) ttttCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTAt < 1:3082983/150‑1 (MQ=255) tttCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGAATCAGATCACATATAAAGCCACAACTCGTTCTTAAACTGATATACCATTAAATGATTATg > 2:2084121/1‑150 (MQ=255) cccGATTATTCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAgg > 2:2017319/1‑150 (MQ=255) attattCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAAc < 2:2880693/150‑1 (MQ=255) ttattCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACg < 2:1964101/150‑1 (MQ=255) tattCTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGc > 2:1196719/1‑150 (MQ=255) tCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCAt < 2:3646576/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATTACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCATg < 1:1322755/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCATg > 1:1798245/1‑150 (MQ=255) tGGCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATTACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCATGc > 1:1287942/1‑150 (MQ=255) tGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCATGc > 2:4121921/1‑150 (MQ=255) gCAGTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCATGCAt < 1:4146764/150‑1 (MQ=255) gTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCATGCATCCa < 1:231631/150‑1 (MQ=255) gTAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCATGCATCCa < 2:1125493/150‑1 (MQ=255) tAATGGGTTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATTACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCATGCATCCAc > 2:642714/1‑150 (MQ=255) tGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCATGCATCCACGtt > 1:4687896/1‑150 (MQ=255) | ACTGCCTCGCACGCCCTCGGTACGGCGCGCTGCGCCGAGCTGGATTATCAGGAAGGTGCATTTAGTTCGCTAGCGCTGGTGTTATGCGGGATAATTACTTCGCTGATCGCACCGTTCCTTTTCCCGATTATTCTGGCAGTAATGGGCTAAAATTTGCGATGCGTCGCGCATTTTTGATGTATGTTTCACGCGTTGCATAATTAATGAGATTCAGATCACATATAAAGCCACAACGGGTTCGTAAACTGTTATCCCATTACATGATTATGAGGCAACGCCATGCATCCACGTTTT > CP009273/2225044‑2225337 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |