| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,294,769 | C→A | 5.6% | P488P (CCG→CCT) | napA ← | nitrate reductase, periplasmic, large subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,294,769 | 0 | C | A | 5.6% | 1240.6 / 33.3 | 319 | P488P (CCG→CCT) | napA | nitrate reductase, periplasmic, large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (138/163); new base A (9/9); total (147/172) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 338 total aligned reads displayed.
GCGTTACCGTAAGCGCCCTCTTTCTCTACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCAC > CP009273/2294620‑2294917 | gcgttACCGTAAGCGCCCTCTTTCTCTACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTc < 2:3081403/150‑1 (MQ=255) cgttACCGTAAGCGCCCTCTTTCTCTACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTcg > 2:1125139/1‑150 (MQ=255) gttACCGTAAGCGCCCTCTTTCTCTACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCCTTGATGTTcgg > 2:2565792/1‑150 (MQ=255) aCCGTAAGCGCCCTCTTTCTCTACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTcggccc > 2:3941520/1‑150 (MQ=255) tAAGCGCCCTCTTTCTCTACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTcggcccggcc > 2:3362171/1‑150 (MQ=255) tAAGCGCCCTCTTTCTCTACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTcggcccggcc > 1:2439950/1‑150 (MQ=255) cccTCTTTCTCTACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCAtg > 1:295186/1‑150 (MQ=255) ccTCGTTCTCTACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCAtgt < 2:59400/150‑1 (MQ=255) ctctTTCTCTACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCAtgtt < 1:3929884/150‑1 (MQ=255) tctTTCTCTACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCAtgttg > 1:3255223/1‑150 (MQ=255) tttCTCTACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATgttgtt > 2:386368/1‑150 (MQ=255) ctctACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGt < 1:2824664/150‑1 (MQ=255) ctACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTac > 2:1507385/1‑150 (MQ=255) tACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTaca < 1:4537115/150‑1 (MQ=255) cccACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTAcaca > 1:3071376/1‑150 (MQ=255) cccACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTAcaca > 1:2189593/1‑150 (MQ=255) ccACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACAt > 1:550139/1‑150 (MQ=255) ccACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACAt < 1:4320795/150‑1 (MQ=255) aTTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTc < 1:4147710/150‑1 (MQ=255) tGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCa > 2:92055/1‑150 (MQ=255) cGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGt < 1:1891631/150‑1 (MQ=255) cGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAAc > 1:905389/1‑150 (MQ=255) cGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAAc < 1:1041233/150‑1 (MQ=255) cGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTAGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAAc > 2:2220594/1‑150 (MQ=255) ggCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTAGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACa > 1:2085440/1‑150 (MQ=255) aGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTc > 2:1889206/1‑150 (MQ=255) aGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTc > 1:3631373/1‑150 (MQ=255) tCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGtt > 2:1773344/1‑150 (MQ=255) tCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGtt > 2:849131/1‑150 (MQ=255) cAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGttt < 1:4456142/150‑1 (MQ=255) aaGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTg > 1:1829685/1‑150 (MQ=255) gTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACAGTCAGTTTGcc > 1:145101/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCAGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCg > 1:2038268/1‑150 (MQ=255) cggcggCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGt > 2:3829386/1‑150 (MQ=255) ggcggcCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTc > 1:3181867/1‑150 (MQ=255) gcggcCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCt < 2:3652743/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCa < 2:3523837/150‑1 (MQ=255) cAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAg < 1:3357809/150‑1 (MQ=255) aGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAgc < 2:2636705/150‑1 (MQ=255) aGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAgc < 2:1624132/150‑1 (MQ=255) gcACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCa < 2:248793/150‑1 (MQ=255) tgactgTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGt < 2:1757693/150‑1 (MQ=255) gactgTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTc > 1:42515/1‑150 (MQ=255) ctgTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCtt < 1:2569082/150‑1 (MQ=255) ctgTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCtt < 1:2725182/150‑1 (MQ=255) ctgTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCtt < 2:1089460/150‑1 (MQ=255) gTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTtgt < 1:1436473/150‑1 (MQ=255) tCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTtgtg < 2:2072049/150‑1 (MQ=255) ggATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGcc < 1:4443411/150‑1 (MQ=255) ggATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGcc > 2:1351624/1‑150 (MQ=255) aTACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCAc > 2:2796736/1‑150 (MQ=255) aCGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACcg > 1:687122/1‑150 (MQ=255) tCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGc > 2:4556112/1‑150 (MQ=255) cGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCa > 1:1316605/1‑150 (MQ=255) cGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCa > 2:373549/1‑150 (MQ=255) cGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCa < 1:4603657/150‑1 (MQ=255) ggAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATCCGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAg < 1:3552818/150‑1 (MQ=255) ggAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAg < 2:4383878/150‑1 (MQ=255) ggAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAg < 2:1984104/150‑1 (MQ=255) ggAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTAGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAg < 1:3844993/150‑1 (MQ=255) gagaCGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGa < 2:4763052/150‑1 (MQ=255) gaCGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGAcc < 2:4692282/150‑1 (MQ=255) cGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGa < 2:3277129/150‑1 (MQ=255) atgatgAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTAGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGAtt < 2:1233450/150‑1 (MQ=255) gatgaAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGAtttt < 2:3199647/150‑1 (MQ=255) gatgaAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGAtttt < 2:4063511/150‑1 (MQ=255) gatgaAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGAtttt < 2:2802642/150‑1 (MQ=255) tgaAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCg < 2:1792700/150‑1 (MQ=255) aGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCg > 1:504454/1‑150 (MQ=255) aGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCg > 1:1341616/1‑150 (MQ=255) aGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCg > 2:171390/1‑150 (MQ=255) gcgcGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAAt < 2:4292716/150‑1 (MQ=255) gcgcGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAAt > 2:4324932/1‑150 (MQ=255) gcgGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATgg < 2:2091411/150‑1 (MQ=255) gATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGc > 1:578663/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGcc > 2:2996045/1‑150 (MQ=255) tCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCg < 1:235571/150‑1 (MQ=255) cgcCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTc > 1:829773/1‑150 (MQ=255) aGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGa > 1:1388389/1‑150 (MQ=255) cccGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGata < 2:3223085/150‑1 (MQ=255) cGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATAtt > 1:2882027/1‑150 (MQ=255) gCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTcc < 1:1016716/150‑1 (MQ=255) gCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTcc < 1:1764952/150‑1 (MQ=255) cATACGCTCTTCATTGATGTTAGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCa > 1:3654601/1‑150 (MQ=255) tACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCAct > 2:1497692/1‑150 (MQ=255) aCGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCActt > 1:1529702/1‑150 (MQ=255) gCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCActtct < 2:2345487/150‑1 (MQ=255) gCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCActtct < 2:3848167/150‑1 (MQ=255) ctctTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCActtctt < 1:114924/150‑1 (MQ=255) ctctTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCActtctt < 2:777921/150‑1 (MQ=255) ctTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTtcttct > 1:756234/1‑150 (MQ=255) ctTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTtcttct > 2:4614805/1‑150 (MQ=255) ctTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTtcttct > 1:2796330/1‑150 (MQ=255) ttCATTGATGTTAGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTtctc < 2:52066/150‑1 (MQ=255) tCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCg > 2:1013855/1‑150 (MQ=255) ttGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAg < 2:1292366/150‑1 (MQ=255) gATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGat < 2:3631589/150‑1 (MQ=255) aTGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGata < 2:4151318/150‑1 (MQ=255) tGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGatat > 2:2900886/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCa < 1:4352755/150‑1 (MQ=255) | GCGTTACCGTAAGCGCCCTCTTTCTCTACCCACATTGCGGTCGGCAGGATCAAGTCGGCGGCCAGCGCACTGACTGTCGGATACGGATCGGAGACGATGATGAAGTTGCGCGGATCGCGCCAGCCCGGCATACGCTCTTCATTGATGTTCGGCCCGGCCTGCATGTTGTTGGTACACATGGTCCAGTAAACATTCAGTTTGCCGTCTTTCAGCGCACGGTCTTGTGCCACCGCGTGCAGACCGATTTTCGCCGGAATGGTGCCGCTCGGGATATTCCACTTCTTCTCGCAGATATCAC > CP009273/2294620‑2294917 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |