| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,463,906 | C→A | 22.5% | Q433K (CAA→AAA) | gtrS → | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,463,906 | 0 | C | A | 22.5% | 214.0 / 19.0 | 95 | Q433K (CAA→AAA) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (17/53); new base A (17/5); total (37/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.87e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGTAGTATCTCTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCC > CP009273/2463758‑2464055 | tGTAGTATCTCTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCa < 1:3337169/150‑1 (MQ=255) gtagtaTCTCTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCaa < 2:3475807/150‑1 (MQ=255) gtagtaTCTCTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCaa < 2:3475824/150‑1 (MQ=255) tagtaTCTCTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCaaa < 1:1566878/150‑1 (MQ=255) agtaTCTCTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAg < 2:675847/150‑1 (MQ=255) agtaTCTCTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAg < 2:675762/150‑1 (MQ=255) taTCTCTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTAaaaaaa > 1:2318142/1‑150 (MQ=255) taTCTCTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑GTTTTTTATTTTTAAAAATATTTAAATaa > 2:1609288/1‑150 (MQ=255) tctcTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAAt < 1:3058128/150‑1 (MQ=255) ctTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTTATTTATAAAAAAATTaaaaaaaaaaaa > 1:1856866/1‑146 (MQ=255) ctTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑GTTTTTTTTTTATAAAAAAATTTAaaaaaaaaaa > 1:2816289/1‑146 (MQ=255) tttttGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAg < 1:4170324/150‑1 (MQ=255) ttttGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTGTTTTTTAAATT‑TAAAAAAATAaaaaaaaaaaaaaa > 1:4682225/1‑144 (MQ=255) tGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑GTTTTTAATTTATAAAATAAATGAAAGAAAACAAGaaaa > 2:4361244/1‑150 (MQ=255) aaTATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAAATCAAAGAAATAAAGaaaaaaa > 2:3555879/1‑147 (MQ=255) aaTATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAAAAAATAAAATAAATAAAAACaaaaa > 2:3555652/1‑147 (MQ=255) tatCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑GTTTTTAATTTATAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAACaaaaaaa > 1:4445399/1‑145 (MQ=255) aaTTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTaa < 1:3727048/150‑1 (MQ=255) aTTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTaaa < 2:4384528/150‑1 (MQ=255) tATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGATATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTTATTTATAAAATAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGATTTaaaaaac > 1:4264164/1‑146 (MQ=255) tATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑GTTTTTAATTTTTAAAATAAAAAAAAAAAATAAAAACAAAAGCGATGTAAAGCAc > 2:2040012/1‑150 (MQ=255) tgtgTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑GTTTTTTATTTATAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGAAGTAAAGCaaaa > 1:2151977/1‑147 (MQ=255) tCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGtt < 2:836576/150‑1 (MQ=255) tCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGtt < 2:1118531/150‑1 (MQ=255) cATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGttt < 1:2900399/150‑1 (MQ=255) cATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGttt < 1:817429/150‑1 (MQ=255) cATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGttt < 1:816005/150‑1 (MQ=255) cATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGttt < 1:509337/150‑1 (MQ=255) cATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGttt < 1:4455974/150‑1 (MQ=255) cATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGttt < 1:4455878/150‑1 (MQ=255) cGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTAAACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAAAAAAGAAAAAATCGATGTAAATAAC‑TAATTTTAAATTga > 2:1562580/1‑149 (MQ=255) gAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCGATTTAAAGCAC‑AAAATTTAAATTtcgcgc > 2:3096691/1‑150 (MQ=255) aaGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTTATTTATAAAAAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAGATGTAAAAAACAAAAATTTAAATT‑CGCGcc > 2:1593930/1‑150 (MQ=255) aGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCa < 1:3427359/150‑1 (MQ=255) ggATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAAATTATAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGATTTAAAACAC‑AAAATTTAAATTTAGCGccca > 2:3665515/1‑148 (MQ=255) gATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAAt < 1:2550157/150‑1 (MQ=255) gagaTTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAATAAAAAAAAAATCGATGTAAAGCAC‑GAATTTTAAATTTCGCGCCAATCAAGgc > 2:1177430/1‑150 (MQ=255) agaTTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGgcg < 2:3837810/150‑1 (MQ=255) aagtaTTTATTTGGAATTTATTTTTCGTTCGACATTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAATTAATTCAAATAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCt < 2:3365638/150‑1 (MQ=255) caTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCtata < 2:1860235/150‑1 (MQ=255) caTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGAAAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAACTTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCtata < 2:1860248/150‑1 (MQ=255) tttGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAAAAAATAAAAAAAAACAAAAAAAAAACCATGTAAATCAC‑AAAGTTTAAATTTCGCGCCAAACAATGCGCGCACAACCAataaaaaaa > 2:3081514/1‑145 (MQ=255) ttGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑GTTTTTTATTTTTAAAATAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGTAAAGAAC‑AAAGATTAAATTTCTCGCCAAAAAATGCGCGCACACGCTataaaaaaaa > 2:1223414/1‑144 (MQ=255) tGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTTATTTATAAAATAATTAAAAGAAATAAAAAAAATAGCGATGTAAATCAA‑AAAGTTTTAATTTAGCGCCAATCATAGCGCCCAAAACCTATAAAACCaaa > 2:4141258/1‑149 (MQ=255) gattGTATTTTTCGTTCTACCTTTGCTTATACATAACTGTCTT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCt < 1:1111178/147‑1 (MQ=255) gAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCTT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAATTTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCt < 1:1571132/150‑1 (MQ=255) gAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCt < 1:1571129/150‑1 (MQ=255) tatttATTTTTGGTTCGACCTTTTCTTATACATAACATTCTT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAATCAAGACAATAGCTATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCTTGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTa < 1:1677638/146‑1 (MQ=255) aaTGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTTTTTTATAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAACAGCTTTAAAGCAA‑AAAATTTATATTTAGCGCCAAACATGTCGCGCACCACCAATAAAAACAAccaa > 2:1369151/1‑148 (MQ=255) ttATTTTTCGTTCGCCCTTTGCTTATAAATACCAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATAAAAATAAAACAAGACATTCGCGATGTAAAGCAA‑TAATTTTAATTTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAtt < 1:4603994/149‑1 (MQ=255) gTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCTT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAtt < 2:3208889/150‑1 (MQ=255) ttttCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCTT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACGATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTtctc < 1:3541400/150‑1 (MQ=255) ttcgACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTctcctcctc < 1:3069598/150‑1 (MQ=255) aCCTTTGCTTATAAATAACTGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAATAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTag < 1:4192412/150‑1 (MQ=255) aCCTTTGCTAATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTAGAAAATAATTCAAAGAAAACAAGACAATCGCGATGTAAAGCAC‑TAATTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTag < 1:4192413/150‑1 (MQ=255) ttGCTTATACATAACCGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAAGCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTg < 2:1997607/150‑1 (MQ=255) ataCATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACtata < 2:3961427/150‑1 (MQ=255) cATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATAtct < 2:3070335/150‑1 (MQ=255) aaCAGTCTT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATAAAGAAAATCGCTATGTAAAGCAC‑TATGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCt < 1:563345/150‑1 (MQ=255) actttttt‑ttttttAATTTATAAAATAATTAAAATAAATCAAGAAATTAGCTATTTAAATAAA‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCAGGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTg < 1:508910/143‑1 (MQ=255) aatttctt‑ttttttAATTTATAAAATAATTAAAATAAATCAATACAATAGCGATTTAAAGCAA‑TAATTTTAAATTGCGCGCCAATCTTGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTg < 1:1268726/143‑1 (MQ=255) aCAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTg < 2:4061975/150‑1 (MQ=255) aCAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTg < 2:4061837/150‑1 (MQ=255) aGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGAt < 2:3440791/150‑1 (MQ=255) aGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAATAAATAAAGAAAAAAGCGATTTAAATCAC‑TAATTTTAAATTTAGCGCCAATCATTGCGCGCACAATCAATAATAACAAACTAAATTATCCTCATCATATTGTGTCTATAtatcattgt > 2:4482243/1‑145 (MQ=255) gTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAATAAATAAAGACAATAGAGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTTCGCGCCCCTCATTGCGCGCACAAGCTATAAAACCAACCAAATTTATCCTCCTCTTAGATTGACTATATATCAAGATa > 1:1039176/1‑150 (MQ=255) tttttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTg > 2:3502972/1‑150 (MQ=255) tttttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTg < 1:3555879/150‑1 (MQ=255) tttttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTg < 1:3555652/150‑1 (MQ=255) tttttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTg > 2:151738/1‑150 (MQ=255) tttttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTg > 2:2544919/1‑150 (MQ=255) tttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCg < 2:497843/150‑1 (MQ=255) tttATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTAtt < 2:2722138/150‑1 (MQ=255) tttATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTAtt < 2:2723268/150‑1 (MQ=255) ttATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTg > 2:411552/1‑150 (MQ=255) ttATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTg > 2:411163/1‑150 (MQ=255) tataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGa > 2:373707/1‑150 (MQ=255) tataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATATCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGa > 2:206056/1‑150 (MQ=255) ataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGAc < 1:3116445/150‑1 (MQ=255) ataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGAc > 1:3578497/1‑150 (MQ=255) ataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCAGATAGAATTGCGGTATTGAc > 1:2697218/1‑150 (MQ=255) aaaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTa < 2:4365216/150‑1 (MQ=255) aaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTAt > 2:3097590/1‑150 (MQ=255) aaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTAt < 2:2733968/150‑1 (MQ=255) aaaTAATTAAAATAAATCAAGACAATAGCTATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTAt < 1:4702344/150‑1 (MQ=255) ataatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCACTCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCa > 1:2212388/1‑150 (MQ=255) ataatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCa < 1:3081514/150‑1 (MQ=255) aatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCaaa < 2:3404193/150‑1 (MQ=255) atTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAAt > 2:2936684/1‑150 (MQ=255) atTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAAt > 2:2936698/1‑150 (MQ=255) ttCAAATAAATCAATACAATAGCGATTTAAAGCAC‑TAATTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATg < 1:2076309/150‑1 (MQ=255) ttCAAATAAATCAAGACAATAGCTATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATg < 1:436102/150‑1 (MQ=255) ttCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATg > 1:2294443/1‑150 (MQ=255) ttCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATg > 1:4692045/1‑150 (MQ=255) tCAAAGAAATCAAGACAATAGCTATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGc < 1:3444367/150‑1 (MQ=255) tCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGc < 1:3443833/150‑1 (MQ=255) tCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGc > 1:3558764/1‑150 (MQ=255) cAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGcc > 1:4508075/1‑150 (MQ=255) | TGTAGTATCTCTTTTTGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGT‑TTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCC > CP009273/2463758‑2464055 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |