| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,463,920 | C→A | 13.0% | D437E (GAC→GAA) | gtrS → | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,463,920 | 0 | C | A | 13.0% | 321.6 / 4.7 | 110 | D437E (GAC→GAA) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/53); new base A (12/7); total (50/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTT > CP009273/2463773‑2464069 | aaTATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAAATCAAAGAAATAAAGaaaaaaa > 2:3555879/1‑147 (MQ=255) aaTATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAAAAAATAAAATAAATAAAAACaaaaa > 2:3555652/1‑147 (MQ=255) aaTTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTaa < 1:3727048/150‑1 (MQ=255) aTTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTaaa < 2:4384528/150‑1 (MQ=255) tATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGATATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTTATTTATAAAATAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGATTTaaaaaac > 1:4264164/1‑146 (MQ=255) tATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTGTTTTTAATTTTTAAAATAAAAAAAAAAAATAAAAACAAAAGCGATGTAAAGCAc > 2:2040012/1‑150 (MQ=255) tgtgTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTGTTTTTTATTTATAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGAAGTAAAGCaaaa > 1:2151977/1‑147 (MQ=255) tCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGtt < 2:1118531/150‑1 (MQ=255) cATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGttt < 1:4455878/150‑1 (MQ=255) cATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGttt < 1:4455974/150‑1 (MQ=255) cATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGttt < 1:817429/150‑1 (MQ=255) cATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGttt < 1:816005/150‑1 (MQ=255) cATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGttt < 1:2900399/150‑1 (MQ=255) cATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGttt < 1:509337/150‑1 (MQ=255) cGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTAAACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAAAAAAGAAAAAATCGATGTAAATAAC‑TAATTTTAAATTga > 2:1562580/1‑149 (MQ=255) gAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCGATTTAAAGCAC‑AAAATTTAAATTtcgcgc > 2:3096691/1‑150 (MQ=255) aaGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTTATTTATAAAAAAAATAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAGATGTAAAAAACAAAAATTTAAATT‑CGCGcc > 2:1593930/1‑150 (MQ=255) ggATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAAATTATAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGATTTAAAACAC‑AAAATTTAAATTTAGCGccca > 2:3665515/1‑148 (MQ=255) gATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAAt < 1:2550157/150‑1 (MQ=255) gagaTTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAATAAAAAAAAAATCGATGTAAAGCAC‑GAATTTTAAATTTCGCGCCAATCAAGgc > 2:1177430/1‑150 (MQ=255) aagtaTTTATTTGGAATTTATTTTTCGTTCGACATTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAATTAATTCAAATAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCt < 2:3365638/150‑1 (MQ=255) caTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCtata < 2:1860235/150‑1 (MQ=255) caTTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGAAAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAACTTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCtata < 2:1860248/150‑1 (MQ=255) tttGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAAAAAATAAAAAAAAACAAAAAAAAAACCATGTAAATCAC‑AAAGTTTAAATTTCGCGCCAAACAATGCGCGCACAACCAataaaaaaa > 2:3081514/1‑145 (MQ=255) ttGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTGTTTTTTATTTTTAAAATAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGTAAAGAAC‑AAAGATTAAATTTCTCGCCAAAAAATGCGCGCACACGCTataaaaaaaa > 2:1223414/1‑144 (MQ=255) tGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTTATTTATAAAATAATTAAAAGAAATAAAAAAAATAGCGATGTAAATCAA‑AAAGTTTTAATTTAGCGCCAATCATAGCGCCCAAAACCTATAAAACCaaa > 2:4141258/1‑149 (MQ=255) gattGTATTTTTCGTTCTACCTTTGCTTATACATAACTGTCTTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCt < 1:1111178/147‑1 (MQ=255) gAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCTTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAATTTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCt < 1:1571132/150‑1 (MQ=255) gAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCt < 1:1571129/150‑1 (MQ=255) tatttATTTTTGGTTCGACCTTTTCTTATACATAACATTCTTTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAAGAAATCAAGACAATAGCTATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCTTGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTa < 1:1677638/146‑1 (MQ=255) ttATTTTTCGTTCGCCCTTTGCTTATAAATACCAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATAAAAATAAAACAAGACATTCGCGATGTAAAGCAA‑TAATTTTAATTTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAtt < 1:4603994/149‑1 (MQ=255) gTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCTTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAAtt < 2:3208889/150‑1 (MQ=255) ttttCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCTTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACGATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTtctc < 1:3541400/150‑1 (MQ=255) ttcgACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTctcctcctc < 1:3069598/150‑1 (MQ=255) aCCTTTGCTTATAAATAACTGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAATAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTag < 1:4192412/150‑1 (MQ=255) aCCTTTGCTAATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTAGAAAATAATTCAAAGAAAACAAGACAATCGCGATGTAAAGCAC‑TAATTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTag < 1:4192413/150‑1 (MQ=255) ataCATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACtata < 2:3961427/150‑1 (MQ=255) cATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATAtct < 2:3070335/150‑1 (MQ=255) acttttttttttttAATTTATAAAATAATTAAAATAAATCAAGAAATTAGCTATTTAAATAAA‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCAGGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTg < 1:508910/143‑1 (MQ=255) aatttcttttttttAATTTATAAAATAATTAAAATAAATCAATACAATAGCGATTTAAAGCAA‑TAATTTTAAATTGCGCGCCAATCTTGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTg < 1:1268726/143‑1 (MQ=255) aCAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTg < 2:4061975/150‑1 (MQ=255) aCAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTg < 2:4061837/150‑1 (MQ=255) aGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAATAAATAAAGAAAAAAGCGATTTAAATCAC‑TAATTTTAAATTTAGCGCCAATCATTGCGCGCACAATCAATAATAACAAACTAAATTATCCTCATCATATTGTGTCTATAtatcattgt > 2:4482243/1‑145 (MQ=255) gTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTAAAATAAATAAAGACAATAGAGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTTCGCGCCCCTCATTGCGCGCACAAGCTATAAAACCAACCAAATTTATCCTCCTCTTAGATTGACTATATATCAAGATa > 1:1039176/1‑150 (MQ=255) tttttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTg > 2:151738/1‑150 (MQ=255) tttttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTg > 2:3502972/1‑150 (MQ=255) tttttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTg > 2:2544919/1‑150 (MQ=255) tttttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTg < 1:3555652/150‑1 (MQ=255) tttttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTg < 1:3555879/150‑1 (MQ=255) tttAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCg < 2:497843/150‑1 (MQ=255) tttATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTAtt < 2:2722138/150‑1 (MQ=255) tttATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTAtt < 2:2723268/150‑1 (MQ=255) ttATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTg > 2:411163/1‑150 (MQ=255) ttATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTg > 2:411552/1‑150 (MQ=255) tataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGa > 2:373707/1‑150 (MQ=255) tataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATATCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGa > 2:206056/1‑150 (MQ=255) ataAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGAc < 1:3116445/150‑1 (MQ=255) aaaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTa < 2:4365216/150‑1 (MQ=255) aaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTAt > 2:3097590/1‑150 (MQ=255) aaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTAt < 2:2733968/150‑1 (MQ=255) aaaTAATTAAAATAAATCAAGACAATAGCTATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTAt < 1:4702344/150‑1 (MQ=255) ataatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCACTCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCa > 1:2212388/1‑150 (MQ=255) ataatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCa < 1:3081514/150‑1 (MQ=255) aatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCaaa < 2:3404193/150‑1 (MQ=255) atTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAAt > 2:2936684/1‑150 (MQ=255) ttaaaataaatCAATAAAATAGCTATTTAAAGCAA‑TAATTTTAAATTGCGCGCCAATATTGGCGCCCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATg < 1:435767/147‑1 (MQ=255) ttCAAATAAATCAATACAATAGCGATTTAAAGCAC‑TAATTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATg < 1:2076309/150‑1 (MQ=255) ttCAAATAAATCAAGACAATAGCTATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATg < 1:436102/150‑1 (MQ=255) ttCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATg > 1:4692045/1‑150 (MQ=255) ttCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATg > 1:2294443/1‑150 (MQ=255) tCAAAGAAATCAAGACAATAGCTATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGc < 1:3444367/150‑1 (MQ=255) tCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGc < 1:3443833/150‑1 (MQ=255) tCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGc > 1:3558764/1‑150 (MQ=255) cAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGcc > 1:4508075/1‑150 (MQ=255) aaaGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGccc > 2:743855/1‑150 (MQ=255) aaaGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGccc > 1:2104930/1‑150 (MQ=255) ataaaTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAATTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTg < 1:1302124/148‑1 (MQ=255) aGAAATCAATAAATTAGCTTTGAAAAGAAC‑TATTTTTAATTTGCGCGCCAATCTTGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTg < 1:824258/150‑1 (MQ=255) aaaTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAt > 2:4793079/1‑150 (MQ=255) aaaTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAt > 1:2432330/1‑150 (MQ=255) aaaTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAt > 1:2836830/1‑150 (MQ=255) aaTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAtt > 1:1175607/1‑150 (MQ=255) aaTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAtt < 2:3692471/150‑1 (MQ=255) aaTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAtt < 2:4137080/150‑1 (MQ=255) aaTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAtt > 1:2980833/1‑150 (MQ=255) aaTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAtt > 1:3244544/1‑150 (MQ=255) aaTCAAGACAATAGCGATGGAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAtt < 1:1920526/150‑1 (MQ=255) aaTCAAGAAAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAtt < 1:3453816/150‑1 (MQ=255) aaTCAAGAAAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAtt < 2:3692375/150‑1 (MQ=255) aTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCGTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCTGTATTGTCTATCTAATGCCCTGATTc > 1:3595788/1‑150 (MQ=255) aTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTc > 2:400629/1‑150 (MQ=255) aTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAAGTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTc < 2:3584301/150‑1 (MQ=255) tCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATTCCCTGATTCg > 2:1581231/1‑150 (MQ=255) tCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCg > 2:1581268/1‑150 (MQ=255) tCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCg > 2:1581381/1‑150 (MQ=255) aaGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCgtt > 1:3748397/1‑150 (MQ=255) aaGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCgtt > 2:4552481/1‑150 (MQ=255) gACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCgttgt > 2:2812709/1‑150 (MQ=255) aCAATAGCGATGTACAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCgttgtt < 1:3124841/150‑1 (MQ=255) cAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGttt > 1:681318/1‑150 (MQ=255) | TGGAATATCTCAATTTTATGTGTCATTTTTCGGGGAAGGATATAGAGATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCAC‑TAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTT > CP009273/2463773‑2464069 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |