| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 202,839 | G→T | 13.4% | E409D (GAG→GAT) | dnaE → | DNA polymerase III alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 202,839 | 0 | G | T | 13.4% | 1056.4 / 96.2 | 317 | E409D (GAG→GAT) | dnaE | DNA polymerase III alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (122/152); new base T (14/29); total (136/181) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.85e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 334 total aligned reads displayed.
CCAGGCCGTGGCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTACGGCTTTGTCGATCGTAT > CP009273/202690‑202988 | ccAGGCCGTGGCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGgag < 2:3614107/150‑1 (MQ=255)ccAGGCCGTGGCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGgag < 1:4078027/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGTGGCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGgaga < 2:3757882/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGTGGCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGgaga < 2:1455685/150‑1 (MQ=255) aGGCCGTGGCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGaa > 2:3046398/1‑150 (MQ=255) aGGCCGTGGCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGaa > 2:4614427/1‑150 (MQ=255) aGGCCGTGGCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGaa < 1:2156528/150‑1 (MQ=255) ggCCGTGGCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGaaa > 2:1713423/1‑150 (MQ=255) cGTGGCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAAcga < 1:3913758/150‑2 (MQ=255) gTGGCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAAcgcg > 1:4128482/1‑150 (MQ=255) gTGGCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAAcgcg < 2:1764390/150‑1 (MQ=255) gTGGCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAAcgcg < 2:2923087/150‑1 (MQ=255) gCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATc < 2:23133/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAgg < 1:1639085/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTAt < 2:602300/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATc < 2:3789372/150‑1 (MQ=255) ttCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCa > 1:4363403/1‑150 (MQ=255) ttCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCa < 1:457446/150‑1 (MQ=255) tCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCAc < 2:2637173/150‑1 (MQ=255) tCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCAc < 2:2187888/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTa < 2:2355525/150‑1 (MQ=255) gtggCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCg < 1:1363220/150‑1 (MQ=255) gtggCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCg < 1:1072932/150‑1 (MQ=255) ccTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACa > 2:2840764/1‑150 (MQ=255) cTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGATAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACAt < 2:2577940/150‑1 (MQ=255) cTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACAt > 2:1648485/1‑150 (MQ=255) cTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACAt < 1:693196/150‑1 (MQ=255) gcgcTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTAc > 1:2441015/1‑150 (MQ=255) gcgcTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTAc < 1:432412/150‑1 (MQ=255) tGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTc < 2:345888/150‑1 (MQ=255) gAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCg > 1:3149096/1‑150 (MQ=255) aaaaTCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGt < 2:499245/150‑1 (MQ=255) aaaaTCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGt > 1:614623/1‑150 (MQ=255) aaaTCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTg > 1:3364471/1‑150 (MQ=255) tCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCAGGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGATAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATg < 2:4374669/150‑1 (MQ=255) cACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGc > 2:3919533/1‑150 (MQ=255) ccGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGATAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCgg < 1:3708873/150‑1 (MQ=255) ccGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCgg < 2:4137254/150‑1 (MQ=255) ccTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATc < 2:764540/150‑1 (MQ=255) cTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGGTTCCTGAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTTACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCTGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCg < 1:2470347/150‑1 (MQ=255) tCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGc > 1:2226465/1‑150 (MQ=255) tCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTTTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCTATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGat < 2:1013447/150‑1 (MQ=255) cGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGatca < 1:2853532/150‑1 (MQ=255) gCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGatcat < 1:1111829/150‑1 (MQ=255) tGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGAtcatca > 1:4769451/1‑150 (MQ=255) ggAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCAc < 1:1240567/150‑1 (MQ=255) aaTTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCt > 2:4708427/1‑150 (MQ=255) tGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCgg > 2:1078994/1‑150 (MQ=255) aCCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTa < 1:977190/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTa < 2:1129567/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTa < 1:4241265/150‑1 (MQ=255) ctgctgTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACa < 2:1859474/150‑1 (MQ=255) aaCGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGa > 2:568780/1‑150 (MQ=255) aaCGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGa > 2:3321405/1‑150 (MQ=255) aCGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGATAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGaa < 1:3836354/150‑1 (MQ=255) aCGTGTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGaa < 1:2721206/150‑1 (MQ=255) cGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCAACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGaaa < 1:4430012/150‑1 (MQ=255) gTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAg < 1:3054552/150‑1 (MQ=255) tttCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGc < 1:4614427/150‑1 (MQ=255) tttCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGc > 1:400778/1‑150 (MQ=255) ttCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCg < 1:3420242/150‑1 (MQ=255) ttCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCg > 2:1209081/1‑150 (MQ=255) ccTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGt < 1:1547718/150‑1 (MQ=255) ttAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGa < 2:3523965/150‑1 (MQ=255) ttAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGa < 2:873701/150‑1 (MQ=255) tAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGAt < 2:3349702/150‑1 (MQ=255) aCCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATcc < 2:4027916/150‑1 (MQ=255) ggAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGa > 2:4735637/1‑150 (MQ=255) gAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGAc < 1:3725154/150‑1 (MQ=255) gAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGAc < 1:56226/150‑1 (MQ=255) aaCGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACg > 2:743666/1‑150 (MQ=255) aaCGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACg > 1:3876527/1‑150 (MQ=255) gtgtCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAg < 1:2971193/150‑1 (MQ=255) gtCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGc > 1:1833268/1‑150 (MQ=255) ctcCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCcg < 2:1514569/150‑1 (MQ=255) tcCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCcgc > 1:2364017/1‑150 (MQ=255) cATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGt > 2:3880768/1‑150 (MQ=255) cTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGATAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTgg > 2:3490148/1‑150 (MQ=255) tGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGATTCGCGATCAGGTTATCGATCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCTGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCtttg < 2:271769/150‑4 (MQ=255) tGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTggg > 2:311399/1‑150 (MQ=255) tGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTggg > 1:863566/1‑150 (MQ=255) cTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCa > 1:3647520/1‑150 (MQ=255) cTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCa > 1:1017106/1‑150 (MQ=255) tCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATc < 2:1945587/150‑1 (MQ=255) cGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATcc > 1:2554347/1‑150 (MQ=255) aCGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGt > 2:4669733/1‑150 (MQ=255) gTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTAc < 2:3370622/150‑1 (MQ=255) ttGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGTGGCATCCGTACg < 2:2770992/150‑1 (MQ=255) tGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTACgg > 2:3546785/1‑150 (MQ=255) ttCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTACGGCttt > 1:1297243/1‑150 (MQ=255) ttCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTACGGCttt < 1:2890310/150‑1 (MQ=255) tGTATGGATAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGAAGATCATCACCTTCGGTAAAATTGCGGCGAAAGAGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTACGGCTATGTc > 1:512903/1‑150 (MQ=255) tGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTACGGCTTTGTc > 2:1394607/1‑150 (MQ=255) tATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTACGGCTTTGTCGa < 2:2629833/150‑1 (MQ=255) tATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTACGGCTTTGTCGa < 2:939153/150‑1 (MQ=255) ggAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTACGGCTTTGTCGATCg > 1:3469393/1‑150 (MQ=255) gagaAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTACGGCTTTGTCGATCGt < 1:892595/150‑1 (MQ=255) agaAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTACGGCTTTGTCGATCGTa > 1:2004186/1‑150 (MQ=255) agaAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTACGGCTTTGTCGATCGTa < 1:2810737/150‑1 (MQ=255) agaAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTACGGCTTTGTCGATCGTa > 1:3289760/1‑150 (MQ=255) | CCAGGCCGTGGCTCCGGTGCGGGTTCACTGGTGGCCTACGCGCTGAAAATCACCGACCTCGATCCGCTGGAATTTGACCTGCTGTTCGAACGTTTCCTTAACCCGGAACGTGTCTCCATGCCTGACTTCGACGTTGACTTCTGTATGGAGAAACGCGATCAGGTTATCGAGCACGTAGCGGACATGTACGGTCGTGATGCGGTATCGCAGATCATCACCTTCGGTACAATGGCGGCGAAAGCGGTGATCCGCGACGTAGGCCGCGTGCTGGGGCATCCGTACGGCTTTGTCGATCGTAT > CP009273/202690‑202988 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |