Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,632,012 | C→A | 37.0% | intergenic (‑1/+10) | bamB ← / ← yfgM | BamABCDE complex OM biogenesis lipoprotein/putative anti‑RcsB factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,632,012 | 0 | C | A | 37.0% | 438.2 / 310.1 | 301 | intergenic (‑1/+10) | bamB/yfgM | BamABCDE complex OM biogenesis lipoprotein/putative anti‑RcsB factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (75/114); new base A (55/57); total (130/171) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.19e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 307 total aligned reads displayed.
GTGCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTCGG > CP009273/2631863‑2632161 | gCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCgg < 2:3557437/150‑1 (MQ=255) cACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTcc < 1:4058695/150‑1 (MQ=255) aCGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTccc < 1:4217200/150‑1 (MQ=255) cGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCct < 1:3043972/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCctc < 2:2306182/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCctc < 1:4778713/150‑1 (MQ=255) ccGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCctct > 2:1264480/1‑150 (MQ=255) gTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCa < 2:848906/150‑1 (MQ=255) gTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCa < 1:379358/150‑1 (MQ=255) gTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCa < 2:4252735/150‑1 (MQ=255) tGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAg < 1:3620422/150‑1 (MQ=255) gTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGAt < 1:558678/150‑1 (MQ=255) gTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGAt < 2:3314539/150‑1 (MQ=255) gTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGAt < 2:2788876/150‑1 (MQ=255) tCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATg < 1:238059/150‑1 (MQ=255) ggCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGa < 2:2715112/150‑1 (MQ=255) ggCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGa < 2:2029226/150‑1 (MQ=255) gTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACaa > 1:439016/1‑150 (MQ=255) gTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTaa < 1:2036696/150‑1 (MQ=255) cAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTc > 1:464281/1‑150 (MQ=255) aaCGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCa < 1:536314/150‑1 (MQ=255) cGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCAGAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATc < 1:1370020/150‑1 (MQ=255) ggTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCt < 2:1873940/150‑1 (MQ=255) cAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcatca > 2:4424254/1‑150 (MQ=255) cAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcatca < 1:4422588/150‑1 (MQ=255) aaTGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGcatcat < 1:4683139/150‑1 (MQ=255) gggACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCAGTTCg > 2:1917306/1‑150 (MQ=255) gACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCt < 1:1264480/150‑1 (MQ=255) gACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCt > 2:3657757/1‑150 (MQ=255) cATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCa < 1:2238913/150‑1 (MQ=255) aTCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAg > 2:2693328/1‑150 (MQ=255) tCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGt < 1:2450590/150‑1 (MQ=255) cTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTg > 2:2571595/1‑150 (MQ=255) tACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCg > 2:2207139/1‑150 (MQ=255) aCCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCgg > 2:2630069/1‑150 (MQ=255) caTCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTa < 2:1495201/150‑1 (MQ=255) caTCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTa > 1:74412/1‑150 (MQ=255) caTCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTa < 2:4342724/150‑1 (MQ=255) tcttctTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAAc < 2:5796/150‑1 (MQ=255) cttcGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCg < 1:6954/150‑1 (MQ=255) cttcGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCg > 1:840684/1‑150 (MQ=255) tcGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCt > 1:3222231/1‑150 (MQ=255) cGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCtt < 2:459976/150‑1 (MQ=255) cGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCtt > 2:2891808/1‑150 (MQ=255) aaCAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGcc > 2:4473420/1‑150 (MQ=255) aCAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTTCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCt < 1:129764/150‑1 (MQ=255) aCAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCt > 2:1028309/1‑150 (MQ=255) gCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCt < 1:3427987/150‑1 (MQ=255) gAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTc < 2:3575386/150‑1 (MQ=255) aaCAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTcc < 2:3864243/150‑1 (MQ=255) aCAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTccc > 2:172922/1‑150 (MQ=255) aCAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTccc < 1:2630149/150‑1 (MQ=255) aCAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTccc < 1:2167112/150‑1 (MQ=255) aCAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTccc < 2:1344158/150‑1 (MQ=255) aGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCAt < 2:4203655/150‑1 (MQ=255) gCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCAc < 1:133687/150‑1 (MQ=255) gCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCAc < 1:1934202/150‑1 (MQ=255) cTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACt > 1:1680794/1‑150 (MQ=255) ttAAAAGGGTAACTGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTa < 2:4141491/150‑1 (MQ=255) ttAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTa < 1:3082065/150‑1 (MQ=255) aaaaGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTGTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTAcg < 1:1058987/150‑1 (MQ=255) aaaGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTAcgc > 2:1764521/1‑150 (MQ=255) gTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCAcc > 1:2820143/1‑150 (MQ=255) aaCGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCtt > 1:3169339/1‑150 (MQ=255) aaCGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCtt > 1:2706851/1‑150 (MQ=255) aaCGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCtt < 2:468389/150‑1 (MQ=255) aaCGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCtt < 1:63515/150‑1 (MQ=255) cGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGc > 1:1525567/1‑150 (MQ=255) ggAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCt > 1:3257032/1‑150 (MQ=255) gAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCtt < 2:4512673/150‑1 (MQ=255) aaaGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTa > 2:1132234/1‑150 (MQ=255) aaGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTAt < 2:2978302/150‑1 (MQ=255) aGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATc < 2:3293888/150‑1 (MQ=255) aGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATc < 2:3141130/150‑1 (MQ=255) cAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCAc > 2:2634710/1‑150 (MQ=255) cAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCAc > 2:1070932/1‑150 (MQ=255) aGTCCTGGCAGTAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCAcc > 2:3701084/1‑150 (MQ=255) aGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCAcc < 1:1648949/150‑1 (MQ=255) aGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCAcc > 1:3336582/1‑150 (MQ=255) ccTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCttt > 2:207764/1‑150 (MQ=255) ccTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCttt < 2:2798659/150‑1 (MQ=255) ccTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCttt < 2:3222231/150‑1 (MQ=255) ccTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCttt < 2:347931/150‑1 (MQ=255) ggCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCt > 1:1814439/1‑150 (MQ=255) ggCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCt < 2:2502823/150‑1 (MQ=255) cagcagTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCa < 1:2031855/150‑1 (MQ=255) cagcagTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCa < 2:4368161/150‑1 (MQ=255) agcagTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAg > 1:4566459/1‑150 (MQ=255) agcagTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAg < 2:4758795/150‑1 (MQ=255) gcagTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGc > 1:425591/1‑150 (MQ=255) cagTAATTTACGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCa > 1:3668884/1‑150 (MQ=255) agTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCaa < 2:1208587/150‑1 (MQ=255) agTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCaa > 2:679101/1‑150 (MQ=255) agTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCaa > 2:79889/1‑150 (MQ=255) cGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTcacc < 2:2433778/150‑1 (MQ=255) cGCAATTGCATAGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTcacc > 1:2608888/1‑150 (MQ=255) aaTTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACg > 2:423218/1‑150 (MQ=255) tGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAg < 2:1097556/150‑1 (MQ=255) aTCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTc < 2:3074540/150‑1 (MQ=255) cGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTCgg > 2:4088733/1‑150 (MQ=255) | GTGCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCACGCCTGCTTCCCATGCACTACGCGCACCTTGCTTATCACCTTTGCTCAGCAATGCTTCACCACGCAGGTCGG > CP009273/2631863‑2632161 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |