| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,806,531 | T→G | 7.9% | L186R (CTG→CGG) | emrB → | multidrug efflux system protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,806,531 | 0 | T | G | 7.9% | 1092.7 / 78.5 | 356 | L186R (CTG→CGG) | emrB | multidrug efflux system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (141/187); new base G (17/11); total (158/198) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.71e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.22e-01 | |||||||||||
Only 100 of 359 total aligned reads displayed.
CTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGAAATTA > CP009273/2806382‑2806677 | cTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACt < 2:2449211/150‑1 (MQ=255) gATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCa < 1:2296055/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAActc > 2:3111379/1‑150 (MQ=255) gcTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAActct < 2:3969221/150‑1 (MQ=255) cTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTg < 1:4309270/150‑1 (MQ=255) cTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTg < 1:3400122/150‑1 (MQ=255) cGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGcgcg > 1:4656156/1‑150 (MQ=255) ggTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTg > 1:4021789/1‑150 (MQ=255) ggTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATACTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTg > 2:599558/1‑150 (MQ=255) gTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGa > 1:3232324/1‑150 (MQ=255) gTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGa > 1:2780193/1‑150 (MQ=255) tCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGaa < 2:440085/150‑1 (MQ=255) tCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGaa < 1:1108502/150‑1 (MQ=255) tGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAAccc > 1:1042151/1‑150 (MQ=255) cGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCa > 1:2655556/1‑150 (MQ=255) cGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACCGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCa < 2:1050296/150‑1 (MQ=255) ggTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCAc < 2:969712/150‑1 (MQ=255) gTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCAcc < 2:1197956/150‑1 (MQ=255) ttGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAAc > 2:1491489/1‑150 (MQ=255) ttGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAAc < 2:3805705/150‑1 (MQ=255) tCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAAcggc < 2:2234710/150‑1 (MQ=255) gcgcCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAAcggcgg < 1:577443/150‑1 (MQ=255) aaTTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGAt > 1:2538077/1‑150 (MQ=255) aTTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGAtt < 2:356006/150‑1 (MQ=255) aTTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGAtt > 2:1995790/1‑150 (MQ=255) cGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGc > 2:1024213/1‑150 (MQ=255) cccGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGt > 2:1793072/1‑150 (MQ=255) ccGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTg < 1:900392/150‑1 (MQ=255) tCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGc > 1:2491077/1‑150 (MQ=255) tCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGc < 2:687988/150‑1 (MQ=255) tCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGc < 1:4050767/150‑1 (MQ=255) tCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTgg > 2:2938055/1‑150 (MQ=255) ggTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCActg > 1:2421218/1‑150 (MQ=255) gTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCActgc > 2:1541683/1‑150 (MQ=255) tataTCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCActgctg < 1:1989360/150‑1 (MQ=255) tataTCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCActgctg < 1:2136457/150‑1 (MQ=255) atatCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTgg < 1:327600/150‑1 (MQ=255) atatCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTgg > 2:4349110/1‑150 (MQ=255) tatCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGt > 1:2265134/1‑150 (MQ=255) tCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTa < 2:2547258/150‑1 (MQ=255) cAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGtt > 2:1349238/1‑148 (MQ=255) cAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGtt > 2:3758068/1‑148 (MQ=255) aGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTAtt < 1:2928761/150‑1 (MQ=255) gCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTg < 2:2072799/150‑1 (MQ=255) cGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTgg < 1:2230849/150‑1 (MQ=255) cGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTgg < 2:202751/150‑1 (MQ=255) tAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTAt > 2:2430606/1‑150 (MQ=255) aaTTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATc < 2:1898504/150‑1 (MQ=255) aaTTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATc < 1:2001680/150‑1 (MQ=255) aTTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCg > 2:2263489/1‑150 (MQ=255) ttACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCgg < 2:537859/150‑1 (MQ=255) ccACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACCCTGCAAACGCTGCGCGGCCGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTCTCGGCAg < 1:1463033/150‑1 (MQ=255) ccACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAg > 2:4672117/1‑150 (MQ=255) aCTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGcc > 1:4160518/1‑150 (MQ=255) gCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGa < 1:1132663/150‑1 (MQ=255) cTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGAt < 1:433340/150‑1 (MQ=255) tGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGAtt > 2:4542783/1‑150 (MQ=255) gATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTAt > 1:1679727/1‑150 (MQ=255) atTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCt > 1:1416138/1‑150 (MQ=255) atTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCt > 1:3733367/1‑150 (MQ=255) atTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCt < 2:3607794/150‑1 (MQ=255) tcatcaACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGAcc < 2:3481113/150‑1 (MQ=255) catcaACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACcg > 1:3989608/1‑150 (MQ=255) catcaACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACcg > 1:97677/1‑150 (MQ=255) tcaACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACcgcg < 1:4555546/150‑1 (MQ=255) tcaACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACcgcg < 1:1318664/150‑1 (MQ=255) aCGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTa < 2:3894997/150‑1 (MQ=255) aCGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATCGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTa < 1:1932832/150‑1 (MQ=255) cGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTaa < 1:4452102/150‑1 (MQ=255) cGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTaa < 2:3728214/150‑1 (MQ=255) tGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAag < 2:3209958/150‑1 (MQ=255) gCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAaga < 1:2081476/150‑1 (MQ=255) gCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGAGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAaga > 1:4437580/1‑150 (MQ=255) ccGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAagag < 2:2843743/150‑1 (MQ=255) cGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGc > 1:1275980/1‑150 (MQ=255) tttGGCGTGGGGGTGGTTTTGATGACACTGCAAACTTTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCTGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTg < 1:3822003/149‑1 (MQ=255) aTTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTg > 2:4645517/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACGGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTg > 2:4165661/1‑150 (MQ=255) ttGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTgg > 1:1086917/1‑150 (MQ=255) tggcgtggcgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACcgcg > 1:3783857/1‑137 (MQ=255) tggcgtggcgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGa > 1:4510339/1‑150 (MQ=255) tggcgtggcgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGa < 1:4385097/150‑1 (MQ=255) ggcgtggcgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGAc > 1:47524/1‑150 (MQ=255) ggcgtggcgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGAc > 1:1902506/1‑150 (MQ=255) gtggcgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTgg < 1:3582704/150‑1 (MQ=255) tggcgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGt < 1:1522371/150‑1 (MQ=255) ggcgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGtt < 2:386358/150‑1 (MQ=255) ggcgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGtt < 2:3309696/150‑1 (MQ=255) gcgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGttt < 2:2390368/150‑1 (MQ=255) gcgGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGttt < 2:4789173/150‑1 (MQ=255) tggtgTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTtcat < 2:2586650/150‑1 (MQ=255) ggtgTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTtcatc > 2:1335144/1‑150 (MQ=255) gatgaCACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGa < 2:3029506/150‑1 (MQ=255) atgaCACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGaa > 1:3952630/1‑150 (MQ=255) atgaCACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGaa > 1:2374541/1‑150 (MQ=255) tgaCACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGaaa < 1:2742253/150‑1 (MQ=255) acacTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGAAAtt < 2:2640251/150‑1 (MQ=255) acacTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATAGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGAAAtt > 1:3099103/1‑150 (MQ=255) cacTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGAAATTa > 1:2990806/1‑150 (MQ=255) cacTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGAAATTa < 2:3395083/150‑1 (MQ=255) | CTCGATCGCGCTGGCGTTGTGGTCGATGACGGTGATTGTCGCGCCAATTTGCGGCCCGATCCTCGGCGGTTATATCAGCGATAATTACCACTGGGGCTGGATATTCTTCATCAACGTGCCGATTGGCGTGGCGGTGGTGTTGATGACACTGCAAACTCTGCGCGGACGTGAAACCCGCACCGAACGGCGGCGGATTGATGCCGTGGGGCTGGCACTGCTGGTTATTGGTATCGGCAGCCTGCAGATTATGCTCGACCGCGGTAAAGAGCTGGACTGGTTTTCATCACAGGAAATTA > CP009273/2806382‑2806677 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |