| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 314,027 | C→T | 6.9% | E2K (GAA→AAA) | rclC ← | reactive chlorine species (RCS) stress resistance inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 314,027 | 0 | C | T | 6.9% | 652.8 / 25.2 | 188 | E2K (GAA→AAA) | rclC | reactive chlorine species (RCS) stress resistance inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (72/103); new base T (8/5); total (80/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.57e-01 | |||||||||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
GACTGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTGATACTG > CP009273/313880‑314175 | aCTGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGAAAATCTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGTCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCAt < 1:930724/150‑1 (MQ=255) cTGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCAtt > 1:3048839/1‑150 (MQ=255) cTGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCAtt > 1:4587246/1‑150 (MQ=255) tGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATtg > 1:917902/1‑150 (MQ=255) gTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATtgt > 2:1848216/1‑150 (MQ=255) tGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGaa < 1:4602030/150‑1 (MQ=255) gacgaATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACAt < 1:3337664/150‑1 (MQ=255) gaATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCt < 1:1634460/150‑1 (MQ=255) tGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttat < 1:1979875/150‑1 (MQ=255) tGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttat < 1:2699944/150‑1 (MQ=255) gtgtAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttattt < 1:2441172/150‑1 (MQ=255) gtgtAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttattt < 2:668632/150‑1 (MQ=255) gtAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttatttat < 1:1423612/150‑1 (MQ=255) gtAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttatttat < 2:1336468/150‑1 (MQ=255) gtAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttatttat < 2:1341762/150‑1 (MQ=255) tAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTtata < 2:3666975/150‑1 (MQ=255) aTGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACa < 2:2192258/150‑1 (MQ=255) tGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACaa > 1:579687/1‑150 (MQ=255) tGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATAc < 1:2433571/150‑1 (MQ=255) tGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATAc > 2:856326/1‑150 (MQ=255) tCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATGTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATActg > 2:2278927/1‑150 (MQ=255) ccTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGt < 1:627163/150‑1 (MQ=255) cGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGc < 1:172808/150‑1 (MQ=255) cGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGc < 1:171847/150‑1 (MQ=255) gTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCg < 2:4453768/150‑1 (MQ=255) gTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAAGACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCg < 1:4288966/150‑1 (MQ=255) aGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGtt < 2:3052553/150‑1 (MQ=255) gggACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTg < 1:2287717/150‑1 (MQ=255) gggACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTg < 2:3476472/150‑1 (MQ=255) gggACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTg < 2:4639440/150‑1 (MQ=255) gggACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTg > 1:120664/1‑150 (MQ=255) ggACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGa < 2:3271731/150‑1 (MQ=255) gACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAAGACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGaa < 2:97770/150‑1 (MQ=255) aCAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAat < 1:866718/150‑1 (MQ=255) cAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAatt > 1:395831/1‑150 (MQ=255) aaaCTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAatta < 2:987813/150‑1 (MQ=255) aaCTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAattat < 1:1976939/150‑1 (MQ=255) aCTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAattatt > 1:599440/1‑150 (MQ=255) tttAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATtattat < 1:4702362/150‑1 (MQ=255) taataaCCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCa < 2:43873/150‑1 (MQ=255) aataaCCCAATCCACATAAAAACAAGTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCaa < 2:4521065/150‑1 (MQ=255) aaTCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACACTACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATc < 2:4187965/150‑1 (MQ=255) aaTCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATc < 2:626183/150‑1 (MQ=255) aaTCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATc < 1:1653266/150‑1 (MQ=255) tAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGAc > 2:4749058/1‑150 (MQ=255) aaaaaCAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACt < 1:4496629/150‑1 (MQ=255) aaaaaCAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACt > 2:4248724/1‑150 (MQ=255) aCAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTcc < 1:1111773/150‑1 (MQ=255) aCAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTcc > 2:3617530/1‑150 (MQ=255) cAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCa < 1:2854418/150‑1 (MQ=255) cAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCa > 1:2159564/1‑150 (MQ=255) tGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGAt > 2:3949081/1‑150 (MQ=255) aaTACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGaa > 1:3756510/1‑150 (MQ=255) aTACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAg > 2:1512639/1‑150 (MQ=255) tACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGc > 1:4730456/1‑150 (MQ=255) tACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGc > 1:3483007/1‑150 (MQ=255) aCTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCa < 2:2114251/150‑1 (MQ=255) aCTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCa > 2:245684/1‑150 (MQ=255) aCTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCa < 2:3416348/150‑1 (MQ=255) cTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCAt < 2:1332392/150‑1 (MQ=255) tCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCAtt > 1:343634/1‑150 (MQ=255) cAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATta > 1:3147823/1‑150 (MQ=255) cAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCAGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATta < 1:3268032/150‑1 (MQ=255) gACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATtata < 2:4514828/150‑1 (MQ=255) gACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATtata < 2:3571351/150‑1 (MQ=255) gACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATtata < 1:4081735/150‑1 (MQ=255) gAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATAttt > 1:1825199/1‑150 (MQ=255) aaTCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATAtttt < 1:2036129/150‑1 (MQ=255) aaTCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATAtttt > 1:3842225/1‑150 (MQ=255) aTCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTc > 2:2481379/1‑150 (MQ=255) aTCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTc < 2:375091/150‑1 (MQ=255) tCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCt < 1:1389580/150‑1 (MQ=255) cAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTg < 1:3665672/150‑1 (MQ=255) aaTGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTgg < 1:1163977/150‑1 (MQ=255) tCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCtat > 2:2602699/1‑150 (MQ=255) gCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCa > 2:2340127/1‑150 (MQ=255) ccAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAg < 2:2614226/150‑1 (MQ=255) ccAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAg < 1:1771077/150‑1 (MQ=255) tttATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATg > 1:4328281/1‑150 (MQ=255) tttATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATg > 2:2553375/1‑150 (MQ=255) ttATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATgg > 1:150559/1‑150 (MQ=255) tATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGt < 2:1580105/150‑1 (MQ=255) aTCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTa > 1:1024073/1‑150 (MQ=255) aTCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTa < 2:2988816/150‑1 (MQ=255) gACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAg > 2:301251/1‑150 (MQ=255) gACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAg > 2:2730227/1‑150 (MQ=255) aCTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGa > 1:1550197/1‑150 (MQ=255) aCTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGa > 1:654666/1‑150 (MQ=255) ttAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAAc > 2:2039956/1‑150 (MQ=255) aGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCg > 1:2486486/1‑150 (MQ=255) ggTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCgg < 2:4002559/150‑1 (MQ=255) gTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGt > 2:1600926/1‑150 (MQ=255) gTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGt > 2:4003142/1‑150 (MQ=255) aGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATg < 1:3143346/150‑1 (MQ=255) ggTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGc > 1:3962226/1‑150 (MQ=255) ggTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGc > 1:1310030/1‑150 (MQ=255) aTTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTGa < 2:2678358/150‑1 (MQ=255) tttttCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTGAt > 1:2297035/1‑150 (MQ=255) ttCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTGATACt > 1:2921509/1‑150 (MQ=255) tCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTGATACTg > 1:1765615/1‑150 (MQ=255) | GACTGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTGATACTG > CP009273/313880‑314175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |