Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 3,898,349 | 0 | G | A | 5.7% | 948.8 / 29.1 | 262 | F203F (TTC→TTT) | bglF | fused beta‑glucoside‑specific PTS enzymes: IIA component/IIB component/IIC component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (125/122); new base A (10/5); total (135/127) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.91e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
ATCAGACATAGCAATGGTGTGAAGAAATTTTTGATTGCCGACGGTAACCACGCATTAAGTCGGCGTTCCAGAATGCTGCACAACCAGGCAGAAAAAATAATGGGAATAACCGATGACGAGTAATTCAACAATGTGACCGGAATACCCAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGATTATCGGGAAGAA > CP009273/3898200‑3898498 | tCAGACATAGCAATGGTGTGAAGAAATTTTTGATTGCCGACGGTAACCACGCATTAAGTCGGCGTTCCAGAATGCTGCACAACCAGGCAGAAAAAATAATGGGAATAACCGATGACGAGTAATTCAACAATGTGACCGGAATACCCAGGa > 1:1994293/1‑150 (MQ=255) gACATAGCAATGGTGTGAAGAAATTTTTGATTGCCGACGGTAACCACGCATTAAGTCGGCGTTCCAGAATGCTGCACAACCAGGCAGAAAAAATAATGGGAATAACCGATGACGAGTAATTCAACAATGTGACCGGAATACCCAGGAAAt > 2:4400355/1‑150 (MQ=255) gACATAGCAATGGTGTGAAGAAATTTTTGATTGCCGACGGTAACCACGCATTAAGTCGGCGTTCCAGAATGCTGCACAACCAGGCAGAAAAAATAATGGGAATAACCGATGACGAGTAATTCAACAATGTGACCGGAATACCCAGGAAAt < 2:1161392/150‑1 (MQ=255) 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caaTGTGACCGGAATACCCAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACACTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTa > 1:4259423/1‑150 (MQ=255) aaTGTGACCGGAATACCCAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTAt < 1:3505886/150‑1 (MQ=255) aCCGGAATACCCAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAgg < 2:1792052/150‑1 (MQ=255) ggAATACCCAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGAtt < 2:2815052/150‑1 (MQ=255) gAATACCCAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGATTa < 2:1231255/150‑1 (MQ=255) gAATACCCAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGATTa > 1:4212496/1‑150 (MQ=255) aaTACCCAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGATTAt > 1:2311722/1‑150 (MQ=255) aTACCCAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGATTATc > 2:2992301/1‑150 (MQ=255) tACCCAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGATTATCg < 1:4210216/150‑1 (MQ=255) ccAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGAAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGATTATCGGga > 1:3108143/1‑150 (MQ=255) aGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGATTATCGGgacg > 1:217788/1‑148 (MQ=255) ggAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGATTATCGGgaaga < 1:760919/150‑1 (MQ=255) | ATCAGACATAGCAATGGTGTGAAGAAATTTTTGATTGCCGACGGTAACCACGCATTAAGTCGGCGTTCCAGAATGCTGCACAACCAGGCAGAAAAAATAATGGGAATAACCGATGACGAGTAATTCAACAATGTGACCGGAATACCCAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGATTATCGGGAAGAA > CP009273/3898200‑3898498 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |