| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,944,000 | T→A | 5.6% | pseudogene (81/984 nt) | ilvG → | pseudogene, acetolactate synthase 2 large subunit, valine‑insensitive; acetolactate synthase II, large subunit, cryptic, interrupted |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,944,000 | 0 | T | A | 5.6% | 1056.6 / 35.8 | 302 | pseudogene (81/984 nt) | ilvG | pseudogene, acetolactate synthase 2 large subunit, valine‑insensitive; acetolactate synthase II, large subunit, cryptic, interrupted |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (178/107); new base A (13/4); total (191/111) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
AACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCTGGTCCGGGCGCAACCAA > CP009273/3943851‑3944149 | aaCCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAAtt > 1:2743291/1‑150 (MQ=255) ccGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTAt < 1:925122/150‑1 (MQ=255) gaggagCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGc > 2:253525/1‑150 (MQ=255) aggagCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGcc < 1:3377052/150‑1 (MQ=255) ggagCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCg > 1:2071006/1‑150 (MQ=255) agCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATAATGCCGGt > 2:3653643/1‑150 (MQ=255) gCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGtt > 1:2528241/1‑150 (MQ=255) cAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGttt < 1:324393/150‑1 (MQ=255) cAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGttt > 1:3939647/1‑150 (MQ=255) aGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGTGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTa > 2:2399828/1‑150 (MQ=255) aGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTa < 2:4445120/150‑1 (MQ=255) aGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTa < 1:3874211/150‑1 (MQ=255) aTGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATg > 2:1095517/1‑150 (MQ=255) gAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCa > 1:1822159/1‑150 (MQ=255) aTAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCAtt > 2:3260171/1‑150 (MQ=255) aTAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCAtt > 2:1858514/1‑150 (MQ=255) tAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTg < 1:3171295/150‑1 (MQ=255) aCAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTa > 2:1147340/1‑150 (MQ=255) cAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCACTTATGCCGGTTTACGATGCATTGTAt > 2:3870160/1‑150 (MQ=255) aGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATg > 1:4420927/1‑150 (MQ=255) gCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGa < 2:1259764/150‑1 (MQ=255) cacaAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGAc > 1:1967072/1‑150 (MQ=255) aaaTTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGAcggcg > 2:1196549/1‑150 (MQ=255) aaaTTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGAcggcg < 1:3619060/150‑1 (MQ=255) aaTTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGAcggcgg < 2:1240555/150‑1 (MQ=255) aaTTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGAcggcgg < 1:60928/150‑1 (MQ=255) aaTTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGAcggcgg > 2:781069/1‑150 (MQ=255) aaTTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGAcggcgg < 1:1579653/150‑1 (MQ=255) tCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGt < 2:1896436/150‑1 (MQ=255) tCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGt > 1:1517628/1‑150 (MQ=255) tttCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAg > 1:516438/1‑150 (MQ=255) tctcAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCa > 1:1384966/1‑150 (MQ=255) tcAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACt < 2:4039918/150‑1 (MQ=255) tcAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACt < 2:1638426/150‑1 (MQ=255) cAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACtt > 2:3613645/1‑150 (MQ=255) cAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACtt < 1:2433086/150‑1 (MQ=255) aaGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTg > 1:3645710/1‑150 (MQ=255) aGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGc > 2:2586048/1‑150 (MQ=255) cAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGc > 1:1302035/1‑150 (MQ=255) cAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCAGTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGc > 2:3115737/1‑150 (MQ=255) ggACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCg > 1:2864005/1‑150 (MQ=255) gACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGa > 1:4762091/1‑150 (MQ=255) gACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGa > 1:4243174/1‑150 (MQ=255) tcGGGGAACTAACGATGTTTGGCGCTCAGTGGGTGGTACTTGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGGCgtc < 2:378451/149‑3 (MQ=255) ggggAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACAt > 2:1524357/1‑150 (MQ=255) aactaactATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGc < 2:2515924/150‑1 (MQ=255) actaactaTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCa > 1:2624306/1‑150 (MQ=255) ctaactaTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAg < 1:1127258/150‑1 (MQ=255) taactaTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAgg > 1:1205260/1‑150 (MQ=255) taactaTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAgg < 2:1517930/150‑1 (MQ=255) ctaTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTg < 1:2342520/150‑1 (MQ=255) taTGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGc < 2:2499217/150‑1 (MQ=255) aaTGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCa > 2:2045765/1‑150 (MQ=255) aTGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCaa > 1:1798731/1‑150 (MQ=255) tGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAAt < 2:4786849/150‑1 (MQ=255) tGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAAt < 2:1336568/150‑1 (MQ=255) ggCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATAATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATg < 1:2913681/150‑1 (MQ=255) gcACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATggcg > 1:870243/1‑150 (MQ=255) cacaGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATggcgg < 2:731498/150‑1 (MQ=255) tgggtggTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATc < 2:922384/150‑1 (MQ=255) gggtggTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCg > 2:854897/1‑150 (MQ=255) gggtggTACATGCGGTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTGTGCGGGTCTCCGGGTGGCGCACTTATGCCGGTTTACGAGGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCCGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCg < 2:3376449/150‑1 (MQ=255) gtggtACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGt > 1:4692568/1‑150 (MQ=255) tggtACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGtt < 2:221153/150‑1 (MQ=255) tACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATg > 2:1076192/1‑150 (MQ=255) tACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATg < 1:747164/150‑1 (MQ=255) cATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCt > 1:3540091/1‑150 (MQ=255) gCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGt < 2:3189246/150‑1 (MQ=255) cGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTg < 2:1429997/150‑1 (MQ=255) cGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATAATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTg > 2:4279642/1‑150 (MQ=255) cGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATAATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTg > 2:1877300/1‑150 (MQ=255) ttGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTTGCGCAATAATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCt < 1:1044441/150‑1 (MQ=255) tGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTa < 1:3746638/150‑1 (MQ=255) cGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTAcc > 1:3518965/1‑150 (MQ=255) cGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTAcc > 2:3968627/1‑150 (MQ=255) gCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGc < 1:1442906/150‑1 (MQ=255) cacaGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCa > 1:1248084/1‑150 (MQ=255) ggTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACt < 2:154847/150‑1 (MQ=255) tgtgAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTgg > 1:3704886/1‑150 (MQ=255) gtgAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGc < 2:1775364/150‑1 (MQ=255) ttCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGcc > 1:4563905/1‑150 (MQ=255) ggTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACg > 1:4323871/1‑150 (MQ=255) ggTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACg < 2:809189/150‑1 (MQ=255) gTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGt > 2:2965353/1‑150 (MQ=255) ttATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTc < 2:2390987/150‑1 (MQ=255) ttATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTc > 2:607648/1‑150 (MQ=255) tATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCt < 2:3907709/150‑1 (MQ=255) tATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCt < 2:2734015/150‑1 (MQ=255) tATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCt > 2:2139775/1‑150 (MQ=255) tATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCt < 2:1497884/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCTGGt < 2:4698319/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCTGGt < 2:2071006/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGAGGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCTGGTc < 1:2541029/150‑1 (MQ=255) atgcgcAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTCTGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCTGGTCCggg > 2:3004088/3‑150 (MQ=255) ggCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCTGGTCCGGgc > 1:4648187/1‑150 (MQ=255) ggCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCTGGTCCGGgc > 1:377653/1‑150 (MQ=255) ggCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCTGGTCCGGgc < 2:3529312/150‑1 (MQ=255) gcAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCTGGTCCGGGCGca > 1:4495545/1‑150 (MQ=255) aTTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCTGGTCCGGGCGcaacc > 1:2271202/1‑150 (MQ=255) aTTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCTGGTCCGGGCGcaacc < 1:4077175/150‑1 (MQ=255) | AACCGAGGAGCAGACAATGAATAACAGCACAAAATTCTGTTTCTCAAGATTCAGGACGGGGAACTAACTATGAATGGCGCACAGTGGGTGGTACATGCGTTGCGGGCACAGGGTGTGAACACCGTTTTCGGTTATCCGGGTGGCGCAATTATGCCGGTTTACGATGCATTGTATGACGGCGGCGTGGAGCACTTGCTATGCCGACATGAGCAGGGTGCGGCAATGGCGGCTATCGGTTATGCTCGTGCTACCGGCAAAACTGGCGTATGTATCGCCACGTCTGGTCCGGGCGCAACCAA > CP009273/3943851‑3944149 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |