Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,998,903 | C→A | 5.1% | L228I (CTC→ATC) | pldA → | outer membrane phospholipase A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,998,903 | 0 | C | A | 5.1% | 1211.3 / 26.0 | 312 | L228I (CTC→ATC) | pldA | outer membrane phospholipase A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (144/151); new base A (9/7); total (154/158) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.15e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
TTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTCAACCAGACC > CP009273/3998754‑3999052 | tttATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGc < 2:1658707/150‑1 (MQ=255) ttATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCt < 2:4026617/150‑1 (MQ=255) taCTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTCAAATAGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAg > 2:4498365/1‑150 (MQ=255) taCTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAg < 1:1910367/150‑1 (MQ=255) taCTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAg > 1:3456678/1‑150 (MQ=255) taCTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAg > 1:3803721/1‑150 (MQ=255) taCTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAg < 1:816119/150‑1 (MQ=255) aCTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGt > 1:3595830/1‑150 (MQ=255) cTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTg > 1:3257078/1‑150 (MQ=255) tCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGc < 2:501183/150‑1 (MQ=255) tGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAg > 1:4737744/1‑150 (MQ=255) aTGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGa > 2:4709167/1‑150 (MQ=255) cAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGTTCAGTGCGAAAGGACAGt > 1:1202642/1‑150 (MQ=255) aaaCGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACaa > 1:2823389/1‑150 (MQ=255) aCGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACt > 1:1650303/1‑150 (MQ=255) gTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGa > 1:3117137/1‑150 (MQ=255) tAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGaa < 1:1316703/150‑1 (MQ=255) tAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGaa > 2:465093/1‑150 (MQ=255) tAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGAGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGaa > 2:666640/1‑150 (MQ=255) ctggctggTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAacac > 2:1268869/1‑150 (MQ=255) tggctggTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACAcc > 1:2491783/1‑150 (MQ=255) gctggTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCgg < 1:1941733/150‑1 (MQ=255) tggTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCt > 1:2120323/1‑150 (MQ=255) gTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTAc < 2:2343333/150‑1 (MQ=255) tAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTAcg < 1:4190363/150‑1 (MQ=255) gAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTAcggc > 1:4139477/1‑150 (MQ=255) gTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACggcggc < 1:2194544/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGgcgc > 1:913057/1‑150 (MQ=255) gCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGa < 1:2519899/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGa < 2:2623889/150‑1 (MQ=255) ccGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGATCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAg < 1:142457/150‑1 (MQ=255) gTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGtt < 1:4477911/150‑1 (MQ=255) tGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTa > 2:4318678/1‑150 (MQ=255) tGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTa < 2:2860703/150‑1 (MQ=255) ggTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAg < 2:4245509/150‑1 (MQ=255) aTGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCt < 2:4744277/150‑1 (MQ=255) aTGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCt < 2:2594239/150‑1 (MQ=255) tggtggGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCtgat > 2:4373099/1‑147 (MQ=255) ggtggGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAg < 2:2401587/150‑1 (MQ=255) tggGTAATACTGACGATACCCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGtt < 2:4539974/150‑1 (MQ=255) tggGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGtt < 1:2899171/150‑1 (MQ=255) tggGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGtt < 2:2137047/150‑1 (MQ=255) ggTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTAc < 1:1749184/150‑1 (MQ=255) tAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTAccc < 1:1682223/150‑1 (MQ=255) aaTACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCg > 2:2373970/1‑150 (MQ=255) aaTACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCg < 2:765180/150‑1 (MQ=255) tGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTCAGTTACCCGATCAc > 2:4099745/1‑150 (MQ=255) tGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCAc > 2:812389/1‑150 (MQ=255) tGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCAc > 2:4402413/1‑150 (MQ=255) gACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCAcc > 2:3136832/1‑150 (MQ=255) aCGATACCCCGGATATCACCAAATATCTGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTTGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCa < 1:2579252/150‑1 (MQ=255) cGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCaa < 1:2072482/150‑1 (MQ=255) cGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCaa > 2:2897809/1‑150 (MQ=255) aaCCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACAt > 2:3739686/1‑150 (MQ=255) aaCCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACAt < 2:1031466/150‑1 (MQ=255) aaCCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACAt > 2:1328699/1‑150 (MQ=255) aaCCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACAt < 2:3292248/150‑1 (MQ=255) aaCCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGATCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACAt > 1:2772999/1‑150 (MQ=255) aCCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACAtg < 1:3506872/150‑1 (MQ=255) cGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTgc > 1:2605032/1‑150 (MQ=255) cGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTgc < 2:1891351/150‑1 (MQ=255) ggATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTgcg > 2:3449131/1‑150 (MQ=255) tatCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCt > 2:3601990/1‑150 (MQ=255) tatCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCt < 1:3972369/150‑1 (MQ=255) tatCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCt < 1:3868977/150‑1 (MQ=255) tCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCttt > 1:3637757/1‑150 (MQ=255) aCCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTtat < 1:4267792/150‑1 (MQ=255) ccAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTCCGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCACACATGTGCGCCTTtata > 1:1249991/1‑150 (MQ=255) ccAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTtata < 2:2010086/150‑1 (MQ=255) ccAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTtata < 2:3112740/150‑1 (MQ=255) cAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATAc > 1:2981120/1‑150 (MQ=255) cAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATAc > 2:3379474/1‑150 (MQ=255) aaaTATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACt < 1:4318678/150‑1 (MQ=255) aaaTATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACt < 2:20810/150‑1 (MQ=255) aaaTATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACt > 1:1023305/1‑150 (MQ=255) atatatGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCa > 2:1810649/1‑150 (MQ=255) tatatGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAg < 2:2747546/150‑1 (MQ=255) tatatGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAg < 2:3080967/150‑1 (MQ=255) gTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACa < 1:336097/150‑1 (MQ=255) gTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACa < 1:1053632/150‑1 (MQ=255) tacCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGATCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGc > 2:3404041/1‑150 (MQ=255) acCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCt < 1:3686067/150‑1 (MQ=255) aGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATg < 2:1108153/150‑1 (MQ=255) cTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGc > 1:1835797/1‑150 (MQ=255) aaaaTCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGaa > 1:1992312/1‑150 (MQ=255) aaaTCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTGAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAAt > 2:2234105/1‑150 (MQ=255) aaTCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATc < 1:3912905/150‑1 (MQ=255) aaTCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATc > 1:4328842/1‑150 (MQ=255) aaTCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATc > 1:4671139/1‑150 (MQ=255) tATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATc > 1:2552944/1‑150 (MQ=255) aTCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCg < 2:566631/150‑1 (MQ=255) cACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGAc < 2:1509151/150‑1 (MQ=255) cTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACAAGTGCCCCAAAATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCAACGACtat > 2:1149997/1‑150 (MQ=255) ggTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAAc < 2:1952092/150‑1 (MQ=255) aTGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTCa > 1:4785554/1‑150 (MQ=255) aTGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTCa > 2:253869/1‑150 (MQ=255) aTGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTCa > 1:631445/1‑150 (MQ=255) cGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTCAAcc < 1:237976/150‑1 (MQ=255) cGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTCAAcc < 2:2992268/150‑1 (MQ=255) ggTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTCAACCa < 1:4448014/150‑1 (MQ=255) | TTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGTGGGTAATACTGACGATAACCCGGATATCACCAAATATATGGGTTACTACCAGCTTAAAATCGGCTATCACCTCGGTGATGCGGTGCTCAGTGCGAAAGGACAGTACAACTGGAACACCGGCTACGGCGGCGCGGAGTTAGGCTTAAGTTACCCGATCACCAAACATGTGCGCCTTTATACTCAGGTTTACAGCGGCTATGGCGAATCGCTCATCGACTATAACTTCAACCAGACC > CP009273/3998754‑3999052 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |