| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,096,555 | G→T | 6.6% | S53S (TCG→TCT) | fieF → | ferrous iron and zinc transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,096,555 | 0 | G | T | 6.6% | 1044.8 / 25.6 | 275 | S53S (TCG→TCT) | fieF | ferrous iron and zinc transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (137/117); new base T (10/11); total (147/128) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
CTTATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTATTCA > CP009273/4096407‑4096704 | cTTATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGcgtcgt > 2:1973855/1‑150 (MQ=255) tATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTg > 2:651131/1‑150 (MQ=255) tATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTg < 2:2747017/150‑1 (MQ=255) tGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGAc > 2:3655361/1‑150 (MQ=255) gACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGTCGa > 1:1995474/1‑150 (MQ=255) cTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTa < 2:3324776/150‑1 (MQ=255) gTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATtg < 2:1804581/150‑1 (MQ=255) tCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATtgg < 2:4528553/150‑1 (MQ=255) aGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGCTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATtggtg > 1:764428/1‑150 (MQ=255) cGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGgtggtg > 1:2135854/1‑150 (MQ=255) gggCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGc < 1:3612627/150‑1 (MQ=255) ggcggcGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGCGTATTCGCGCCGCGCGGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGACTTTATTGGTGGTGCg > 2:4140490/1‑150 (MQ=255) ggcggcGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCg > 2:1758796/1‑150 (MQ=255) ggcggcGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTAGCGCCGCGCTGGTGGAGTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTAATGgtggtggg > 1:2065276/1‑148 (MQ=255) cggcgATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGat > 1:4172969/1‑150 (MQ=255) gcgATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGatat < 2:4448059/150‑1 (MQ=255) cgATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATCCCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATAtt < 2:389827/150‑1 (MQ=255) cgATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATAtt > 1:2286313/1‑150 (MQ=255) gATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTc < 1:1267043/150‑1 (MQ=255) gATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTc < 2:1503038/150‑1 (MQ=255) gATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTc > 2:2775196/1‑150 (MQ=255) gATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTc < 2:1838702/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTccc < 1:4392169/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGGGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTccc < 1:4751855/150‑1 (MQ=255) cGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAAc > 1:1497756/1‑150 (MQ=255) aCGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCt < 2:3022538/150‑1 (MQ=255) aCGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCt < 2:2021684/150‑1 (MQ=255) cGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTg < 2:592163/150‑1 (MQ=255) cGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTg < 2:1098583/150‑1 (MQ=255) gCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGcc < 1:977284/150‑1 (MQ=255) cGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCcg > 1:3149862/1‑150 (MQ=255) ggttgCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGAGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGGGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCcga > 2:338144/5‑150 (MQ=255) ggCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCAGCcgacga > 1:2349990/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGAt < 2:2917004/150‑1 (MQ=255) cTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATa > 2:4204144/1‑150 (MQ=255) cTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATa < 2:1520357/150‑1 (MQ=255) cGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATc > 1:267150/1‑150 (MQ=255) cGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATc > 1:3460973/1‑150 (MQ=255) gctgctATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCa > 2:4292784/1‑150 (MQ=255) tATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGt < 1:839845/150‑1 (MQ=255) cTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGt > 1:2611546/1‑150 (MQ=255) cTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGt < 2:1120079/150‑1 (MQ=255) tGATTAAATTTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTc < 2:774598/150‑1 (MQ=255) 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aTTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCAc > 2:3940348/1‑150 (MQ=255) aaTTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTaa < 1:2955227/150‑1 (MQ=255) aTTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTaaa > 1:3952318/1‑150 (MQ=255) aTTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTaaa > 2:1117491/1‑150 (MQ=255) tttttGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAg < 2:2455094/150‑1 (MQ=255) 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aTGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTc > 1:1761028/1‑150 (MQ=255) tggtATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTc < 1:3379336/150‑1 (MQ=255) tggtATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTc > 1:1103149/1‑150 (MQ=255) tataCCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTcgcg < 1:4619114/150‑1 (MQ=255) ataCCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACCATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCGGAGTCCCTCgcgg > 1:3737232/1‑150 (MQ=255) 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ctcGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGttt < 1:604585/150‑1 (MQ=255) ccgcGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTAtct < 1:2063064/150‑1 (MQ=255) cgcgCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTAtctc > 1:1033756/1‑150 (MQ=255) cgcgCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTAtctc < 1:4547505/150‑1 (MQ=255) cgcgCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTAtctc > 2:2462029/1‑150 (MQ=255) 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ggtggATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCt < 2:3563476/150‑1 (MQ=255) gtggATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTg < 2:1405055/150‑1 (MQ=255) tggATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGt < 1:1341512/150‑1 (MQ=255) tCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGa > 2:1381604/1‑150 (MQ=255) tCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGa > 2:2609513/1‑150 (MQ=255) cGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGAc > 2:2104912/1‑150 (MQ=255) gcgTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGt < 2:2222212/150‑1 (MQ=255) cgtcgtTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTa < 1:3259108/150‑1 (MQ=255) cgtcgtTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTa < 2:4400655/150‑1 (MQ=255) cgtcgtTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTa > 1:3983638/1‑150 (MQ=255) cgtTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGTCGGGTATTc > 2:1922359/1‑150 (MQ=255) gtTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTATTCa > 1:4419600/1‑150 (MQ=255) | CTTATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTATTCA > CP009273/4096407‑4096704 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |