| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,257,593 | C→T | 20.8% | N184N (AAC→AAT) | tyrB → | tyrosine aminotransferase, tyrosine‑repressible, PLP‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,257,593 | 0 | C | T | 20.8% | 800.0 / 191.1 | 331 | N184N (AAC→AAT) | tyrB | tyrosine aminotransferase, tyrosine‑repressible, PLP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (112/150); new base T (34/35); total (146/185) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.43e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
GTAGCAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCC > CP009273/4257444‑4257740 | tAGCAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAAcc < 1:4546037/150‑1 (MQ=255) tAGCAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAAcc > 1:807466/1‑150 (MQ=255) aGCAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAAtcc < 2:2157681/150‑1 (MQ=255) aGCAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAAtcc < 2:675749/150‑1 (MQ=255) gCAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCa > 1:472586/1‑150 (MQ=255) cAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCaa > 2:2026381/1‑150 (MQ=255) aaTATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAAc > 1:967535/1‑150 (MQ=255) aaTATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAAc > 2:2330668/1‑150 (MQ=255) tatTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACgg < 1:4293557/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGt > 2:3428021/1‑150 (MQ=255) cGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGc > 2:1876230/1‑150 (MQ=255) gCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGcc < 2:3645161/150‑1 (MQ=255) gCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGcc < 2:1909235/150‑1 (MQ=255) ccGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCg > 2:1261291/1‑150 (MQ=255) cGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGa > 1:1494924/1‑150 (MQ=255) ggCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGAtct < 1:195358/150‑1 (MQ=255) ggCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGAtct > 1:840938/1‑150 (MQ=255) cTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCa > 2:4021124/1‑150 (MQ=255) tGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCAc > 2:3602588/1‑150 (MQ=255) aaGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATc < 1:3922144/150‑1 (MQ=255) aGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCa < 2:1377004/150‑1 (MQ=255) aGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCa > 1:3053845/1‑150 (MQ=255) gTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAg < 1:1751135/150‑1 (MQ=255) gTGAGTACTGACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAg < 1:4155786/150‑1 (MQ=255) tGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTCTTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACGAATGATCAGt > 1:1063750/1‑150 (MQ=255) gTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTggg > 1:322768/1‑150 (MQ=255) gTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTggg > 1:637850/1‑150 (MQ=255) gTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTggg < 2:3138237/150‑1 (MQ=255) gTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTggg < 2:107511/150‑1 (MQ=255) cTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATg > 1:1416678/1‑150 (MQ=255) ttACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGc < 1:3126558/150‑1 (MQ=255) aCCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCgg < 2:2448601/150‑1 (MQ=255) cccTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTg < 1:2984160/150‑1 (MQ=255) tGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGAtt < 2:2799566/150‑1 (MQ=255) aTGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGaaa > 2:4088357/1‑150 (MQ=255) gACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAAtt < 1:3513620/150‑1 (MQ=255) aaGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCa > 1:4711905/1‑150 (MQ=255) aGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCaa > 2:1825383/1‑150 (MQ=255) cGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAg < 2:3935009/150‑1 (MQ=255) aCTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGcc > 2:4573436/1‑150 (MQ=255) cTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGccc > 1:1001581/1‑150 (MQ=255) cTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGccc > 1:2017312/1‑150 (MQ=255) tAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCcg > 2:4672832/1‑150 (MQ=255) cGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGa > 1:2628568/1‑150 (MQ=255) gCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGc < 2:452635/150‑1 (MQ=255) gTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCtt < 2:4152362/150‑1 (MQ=255) gTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTAACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCtt > 1:3174984/1‑150 (MQ=255) cgcTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTatt > 1:2185945/1‑150 (MQ=255) gcTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTattc < 1:4029631/150‑1 (MQ=255) cTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTattcc < 1:1263015/150‑1 (MQ=255) tttAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTattcca < 2:2195029/150‑1 (MQ=255) tttAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTattcca > 1:2461243/1‑150 (MQ=255) gACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTc < 1:3632615/150‑1 (MQ=255) aCCTGTTGGCGACGATGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACAAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCg > 2:1216969/1‑150 (MQ=255) cTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGat > 1:1057314/1‑150 (MQ=255) cTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGat < 1:544261/150‑1 (MQ=255) cTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGat < 1:2363098/150‑1 (MQ=255) tGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGata > 2:4765781/1‑150 (MQ=255) tGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGata < 2:3051129/150‑1 (MQ=255) ttGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATAtt < 1:4525633/150‑1 (MQ=255) tGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTg < 2:3248986/150‑1 (MQ=255) gCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGcc > 1:1299893/1‑150 (MQ=255) gACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTa > 2:1389948/1‑150 (MQ=255) aCGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTAt < 1:2675799/150‑1 (MQ=255) cGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATc < 1:3415318/150‑1 (MQ=255) gCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCa < 1:4237753/150‑1 (MQ=255) tGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAg > 2:967268/1‑150 (MQ=255) aaaaCATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGa > 2:832053/1‑150 (MQ=255) aCATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGAttt > 2:1958341/1‑150 (MQ=255) cATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTg > 2:2139457/1‑150 (MQ=255) aTTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTgg > 1:44000/1‑150 (MQ=255) ttACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGt < 1:3312615/150‑1 (MQ=255) tACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTg > 2:1613967/1‑150 (MQ=255) ccTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGcc > 2:2090723/1‑150 (MQ=255) ccTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGcc < 1:4435045/150‑1 (MQ=255) cccGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTa < 2:3896314/150‑1 (MQ=255) ccGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTAt < 1:2205207/150‑1 (MQ=255) gCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATgg > 2:411603/1‑150 (MQ=255) cAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGa < 1:3755008/150‑1 (MQ=255) cAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGa < 2:42924/150‑1 (MQ=255) aGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTACTGATCAGTGGGATGCGGTGATTGACATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGaa < 2:799152/150‑1 (MQ=255) aTTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAagag < 2:3770443/150‑1 (MQ=255) ttGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAATCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAgg < 1:2153312/150‑1 (MQ=255) tgtTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATg < 2:436768/150‑1 (MQ=255) gtTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGc < 2:3465689/150‑1 (MQ=255) gtTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGc > 1:2821298/1‑150 (MQ=255) tgctgcATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCt < 2:38471/150‑1 (MQ=255) ctgcATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTAc < 1:3380122/150‑1 (MQ=255) ctgcATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTAc < 1:2610512/150‑1 (MQ=255) gcATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGc > 1:3767814/1‑150 (MQ=255) cATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTc < 1:4672832/150‑1 (MQ=255) cATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTc < 1:2763887/150‑1 (MQ=255) tGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTcgc > 2:2699532/1‑150 (MQ=255) gTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTcgcg > 1:1609927/1‑150 (MQ=255) tGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGcc < 1:1805520/150‑1 (MQ=255) ccACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCAt < 2:1151867/150‑1 (MQ=255) cacaACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCAtt > 2:2339414/1‑150 (MQ=255) acaACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTg > 2:1483948/1‑150 (MQ=255) acaACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTg < 2:4711905/150‑1 (MQ=255) aaCCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGcc < 1:4083787/150‑1 (MQ=255) | GTAGCAATATTCGCCGGGGCTGGATTCGAAGTGAGTACTTACCCCTGGTATGACGAAGCGACTAACGGCGTGCGCTTTAATGACCTGTTGGCGACGCTGAAAACATTACCTGCCCGCAGTATTGTGTTGCTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCC > CP009273/4257444‑4257740 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |