| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,271,906 | C→T | 34.4% | E366E (GAG→GAA) | yjcF ← | pentapeptide repeats protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,271,906 | 0 | C | T | 34.4% | 260.5 / 194.2 | 192 | E366E (GAG→GAA) | yjcF | pentapeptide repeats protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (58/68); new base T (28/38); total (86/106) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
GCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACG > CP009273/4271757‑4272054 | gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGcc < 1:766041/150‑1 (MQ=255) cATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCt > 2:3903368/1‑150 (MQ=255) cATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCt > 2:1495415/1‑150 (MQ=255) aTGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTc < 2:3147745/150‑1 (MQ=255) tGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCa > 1:1759767/1‑150 (MQ=255) aaGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATc > 2:467264/1‑150 (MQ=255) aTTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGaa < 1:484007/150‑1 (MQ=255) aTTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGaa > 1:322669/1‑150 (MQ=255) ttATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGaaa > 1:1042049/1‑150 (MQ=255) tATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAAt < 1:2837822/150‑1 (MQ=255) aTCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAAtt > 2:4305814/1‑150 (MQ=255) cTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAac > 1:2331737/1‑150 (MQ=255) tCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAaca < 2:3800748/150‑1 (MQ=255) tCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAaca > 2:2202554/1‑150 (MQ=255) cAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAacac < 1:3947554/150‑1 (MQ=255) cAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAacac < 1:2447736/150‑1 (MQ=255) cAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAacac < 1:1453290/150‑1 (MQ=255) tttGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGAt < 1:4773588/150‑1 (MQ=255) ttGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATa < 1:302886/150‑1 (MQ=255) tgtgACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATag < 1:3982666/150‑1 (MQ=255) tgtgACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATag < 1:4092100/150‑1 (MQ=255) tgtgACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATag > 2:1586089/1‑150 (MQ=255) tgtgACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATag < 1:3047432/150‑1 (MQ=255) cATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACg < 1:2309661/150‑1 (MQ=255) aTGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTaaa > 1:282112/1‑150 (MQ=255) aTGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTaaa < 2:2967558/150‑1 (MQ=255) tGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAAc > 1:2956940/1‑150 (MQ=255) tGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAAc < 1:3861779/150‑1 (MQ=255) ggCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTACTGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCa < 2:3575967/150‑1 (MQ=255) ggCACAATCTTCTTCAAAGAATGTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCa < 1:2657819/150‑1 (MQ=255) caATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCt < 1:3064054/150‑1 (MQ=255) aaTCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCtt < 2:4069382/150‑1 (MQ=255) aaTCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCtt < 2:1007704/150‑1 (MQ=255) tcttctTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCtttt < 1:3802004/150‑1 (MQ=255) ttcttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAAAATCCAGGCTTTTGt > 2:2229549/1‑150 (MQ=255) cttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTa < 1:2920753/150‑1 (MQ=255) ttcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTaa < 1:4662580/150‑1 (MQ=255) tcAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTaaa < 1:1620076/150‑1 (MQ=255) aaGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaaca < 2:684336/150‑1 (MQ=255) gAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacaga > 2:3047021/1‑150 (MQ=255) ttCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaacag > 1:3379022/1‑150 (MQ=255) ttCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAaacagaacag > 1:4244042/1‑150 (MQ=255) tCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGt < 2:1108608/150‑1 (MQ=255) tGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTg > 1:3372362/1‑150 (MQ=255) tGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTg > 2:21900/1‑150 (MQ=255) gTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGa < 2:4318835/150‑1 (MQ=255) tAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGaa > 2:4493852/1‑150 (MQ=255) tgtTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATg > 1:3848883/1‑150 (MQ=255) gtTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATgg < 2:2229396/150‑1 (MQ=255) ttACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGc < 2:2614923/150‑1 (MQ=255) ccAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAAt < 2:2007116/150‑1 (MQ=255) atatCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCtt > 2:878713/1‑150 (MQ=255) tatCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTa > 2:4233222/1‑150 (MQ=255) atCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTaa < 1:4416218/150‑1 (MQ=255) atCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTaa < 1:337686/150‑1 (MQ=255) atCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTaa > 2:2860770/1‑150 (MQ=255) atCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTaa < 1:2201186/150‑1 (MQ=255) cACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAAt < 1:2141077/150‑1 (MQ=255) aCTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAAtt < 2:2244/150‑1 (MQ=255) aCTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAAtt < 1:2270317/150‑1 (MQ=255) aCTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAAtt > 2:4166086/1‑150 (MQ=255) cTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTg > 2:2271344/1‑150 (MQ=255) ttAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCa < 1:1565665/150‑1 (MQ=255) tAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCat > 1:276502/1‑150 (MQ=255) aaTGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCatt > 2:3488102/1‑150 (MQ=255) aaTGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCatt > 2:4607142/1‑150 (MQ=255) aTGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCatta > 2:305876/1‑150 (MQ=255) ggAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCattatt > 1:1431703/1‑150 (MQ=255) gagaTATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCAttatta > 2:2266278/1‑150 (MQ=255) gagaTATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTAGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCAttatta > 2:3201888/1‑150 (MQ=255) agaTATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTaa < 1:3691225/150‑1 (MQ=255) agaTATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTaa > 1:2430694/1‑150 (MQ=255) agaTATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTaa < 2:2820611/150‑1 (MQ=255) gaTATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTaaa < 1:367429/150‑1 (MQ=255) tatTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAAt > 1:1338599/1‑150 (MQ=255) tatTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAAt < 2:4361680/150‑1 (MQ=255) tttCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTaa > 1:2194917/1‑150 (MQ=255) tttCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTaa > 2:3247296/1‑150 (MQ=255) tCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTa > 1:3921300/1‑150 (MQ=255) tCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTa > 2:2739956/1‑150 (MQ=255) tCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTa < 2:2018175/150‑1 (MQ=255) accacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGc > 2:1315765/1‑150 (MQ=255) accacGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGc > 1:1069409/1‑150 (MQ=255) ggAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCatat > 2:3294703/1‑150 (MQ=255) gagaATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATAtt < 1:1586089/150‑1 (MQ=255) gagaATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATAtt < 1:20161/150‑1 (MQ=255) gagaATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATAtt < 1:20243/150‑1 (MQ=255) agaATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTa < 1:534304/150‑1 (MQ=255) aaTGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTaga < 2:1354969/150‑1 (MQ=255) aaTGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTaga > 1:511976/1‑150 (MQ=255) aTACCCATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTa > 2:703559/1‑150 (MQ=255) cccATTCCCTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACat > 1:4667347/1‑150 (MQ=255) ccATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACata < 2:3936576/150‑1 (MQ=255) tCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTTGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATaaa > 1:829848/1‑149 (MQ=255) tCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACAtatacc < 1:1170975/150‑3 (MQ=255) ccTGGACGCTAGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCa < 2:2955837/150‑1 (MQ=255) ggACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCAttt < 1:2978332/150‑1 (MQ=255) aGCTTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGaa > 2:2471961/1‑150 (MQ=255) gCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAAc < 1:3297214/150‑1 (MQ=255) ccTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACg > 2:1523623/1‑150 (MQ=255) | GCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTTCTGTAGTGTTACCAGGATATCACTATTAATGGAGATATTTTCCTCACCACGGAGAATGGTAATACCCATTCCCTGGACGCTAGCCTCATCGAAATTAACACGATAGAGACGGATATTAAACATCCAGGCTTTTGTTAAAACAGAACAGTTGAAATGGCAATTGCTTAAATTGGCATTATTAAAATTAACATTAGCCATATTAGAGTCGGTACATATAACCATTTCGAGGAACG > CP009273/4271757‑4272054 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |