| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,320,106 | T→A | 13.3% | intergenic (+51/‑213) | yjcZ → / → proP | YjcZ family protein, mutational suppressor of yhjH motility mutation/proline/glycine betaine transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,320,106 | 0 | T | A | 13.3% | 654.7 / 74.9 | 215 | intergenic (+51/‑213) | yjcZ/proP | YjcZ family protein, mutational suppressor of yhjH motility mutation/proline/glycine betaine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (99/87); new base A (12/17); total (111/104) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.18e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
CGCTGGCAAACTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTT > CP009273/4319957‑4320255 | cGCTGGCAAACTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAt > 2:2175044/1‑150 (MQ=255) gCAAACTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACaa > 2:2905684/1‑150 (MQ=255) aaaCTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAAt > 1:998351/1‑150 (MQ=255) aaaCTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAAt < 1:246240/150‑1 (MQ=255) aaCTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAAtt < 2:1281623/150‑1 (MQ=255) tGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTaa > 1:2418178/1‑150 (MQ=255) tGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTaa < 2:3394289/150‑1 (MQ=255) tGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTaa < 2:3393250/150‑1 (MQ=255) gTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTaaa < 2:1038872/150‑1 (MQ=255) cTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTgg < 2:470081/150‑1 (MQ=255) tGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGt > 1:2341514/1‑150 (MQ=255) aggCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGt < 2:3087641/148‑1 (MQ=255) aTGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGt < 2:699439/150‑1 (MQ=255) tGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTa < 1:379027/150‑1 (MQ=255) gCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTaa < 2:2065785/150‑1 (MQ=255) ccACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTaaa > 1:2306259/1‑150 (MQ=255) cGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAg < 1:2814827/150‑1 (MQ=255) gACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAgg > 1:1009392/1‑150 (MQ=255) aCTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGt < 1:3948210/150‑1 (MQ=255) ctctGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTc < 2:1727314/150‑1 (MQ=255) tctGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCa > 2:521402/1‑150 (MQ=255) ctGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCAt > 1:4487512/1‑150 (MQ=255) tGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCAtt < 2:1361045/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTa > 2:3436299/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTa < 2:900782/150‑1 (MQ=255) ttCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTaa < 2:342545/150‑1 (MQ=255) agcgcagcgTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTg < 2:1080270/150‑1 (MQ=255) gcgcagcgTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGc < 1:251864/150‑1 (MQ=255) cagcgTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCa < 1:2595458/150‑1 (MQ=255) cagcgTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCa > 2:3954916/1‑150 (MQ=255) agcgTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCaa > 2:3148325/1‑150 (MQ=255) cgTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAAtt > 2:2394000/1‑150 (MQ=255) cgTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAAtt < 2:1583155/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTc < 2:18372/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTc > 2:817774/1‑150 (MQ=255) tCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAANTCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTNAAACACTGGTAGGNTANAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCa < 1:1177622/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAgg < 2:2833723/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAgg > 1:1400482/1‑150 (MQ=255) tGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAgg < 2:4681490/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAgg > 1:1797874/1‑150 (MQ=255) gggggCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTc < 2:13137/150‑1 (MQ=255) ggggCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCa < 2:3739680/150‑1 (MQ=255) tGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGtt > 2:1828698/1‑150 (MQ=255) gCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGttt < 1:4356404/150‑1 (MQ=255) gCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGttt < 1:2086570/150‑1 (MQ=255) cTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTg > 1:515976/1‑150 (MQ=255) cTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTg < 2:4062827/150‑1 (MQ=255) cTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTg < 2:4621683/150‑1 (MQ=255) cGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGAt > 1:3734986/1‑150 (MQ=255) gAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGAtt > 1:2885290/1‑150 (MQ=255) aGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTg > 2:479163/1‑150 (MQ=255) ggAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGt < 1:3005643/150‑1 (MQ=255) aaaTCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTAc > 1:1090437/1‑150 (MQ=255) aaTCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACa > 1:3537042/1‑150 (MQ=255) aaTCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACa > 2:1709073/1‑150 (MQ=255) aTCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACAt > 1:1331884/1‑150 (MQ=255) tcttctCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACAtt > 1:3563177/1‑150 (MQ=255) cttctCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTc < 1:2170056/150‑1 (MQ=255) ttctCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTcc > 1:3988431/1‑150 (MQ=255) ctctGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCtt < 1:4512100/150‑1 (MQ=255) tctGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTa < 1:3122902/150‑1 (MQ=255) gTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAAcc < 1:1557662/150‑1 (MQ=255) aaaTTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCgg > 2:2218058/1‑150 (MQ=255) taTTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGa > 1:1943212/2‑150 (MQ=255) aaTTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGa > 1:1627216/1‑150 (MQ=255) taatCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCaaa > 2:2513231/1‑150 (MQ=255) atCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAAcc > 1:2197849/1‑150 (MQ=255) tCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAAccc < 1:648208/150‑1 (MQ=255) cAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCg > 1:4006073/1‑150 (MQ=255) ttACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTa > 2:2673015/1‑150 (MQ=255) tACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTAc < 1:2613561/150‑1 (MQ=255) tACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTAc > 1:38723/1‑150 (MQ=255) aCATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCATGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACg < 2:1098792/150‑1 (MQ=255) aCATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACg < 2:3812480/150‑1 (MQ=255) cATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGc > 2:2253852/1‑150 (MQ=255) tCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCtt > 2:3550514/1‑150 (MQ=255) tCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCtt < 2:3243070/150‑1 (MQ=255) aTGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAAGTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGtt < 2:957008/150‑1 (MQ=255) tGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTa < 1:4287754/150‑1 (MQ=255) gAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTAc < 2:456178/150‑1 (MQ=255) gAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTAc > 1:4693468/1‑150 (MQ=255) gTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACag < 1:4753973/150‑1 (MQ=255) aaaCGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGAtt > 2:850923/1‑150 (MQ=255) aaaCGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGAtt < 2:4218658/150‑1 (MQ=255) aCGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGc > 1:2125265/1‑150 (MQ=255) aCGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGc > 1:2963081/1‑150 (MQ=255) cGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCa < 2:1267616/150‑1 (MQ=255) aaaTCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGTCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATc > 2:3271338/1‑150 (MQ=255) cATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCa > 2:273495/1‑150 (MQ=255) aTGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCaa > 1:3072516/1‑150 (MQ=255) tgtgAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTc > 2:245695/1‑150 (MQ=255) gtgAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAACAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTcc < 1:107537/150‑1 (MQ=255) gtgAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTcc > 2:3729964/1‑150 (MQ=255) aaGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGc > 1:4564089/1‑150 (MQ=255) aaGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGc > 2:1442950/1‑150 (MQ=255) gTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTc < 1:449708/150‑1 (MQ=255) tGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTccc > 2:1651779/1‑150 (MQ=255) aTCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCt > 2:3199731/1‑150 (MQ=255) tCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCtt > 2:644776/1‑150 (MQ=255) tCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCtt > 2:2240522/1‑150 (MQ=255) | CGCTGGCAAACTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTT > CP009273/4319957‑4320255 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |