| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 4,336,681 | 0 | A | T | 33.6% | 427.2 / inf | 315 | Y155N (TAC→AAC) | fumB | anaerobic class I fumarate hydratase (fumarase B) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (97/112); new base T (54/51); total (152/163) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.05e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 319 total aligned reads displayed.
AGTCAGCAGGGCTTTGGTTTCCTGGTAGAGATACGTTTTGTTGGCAGAGCCGCCGCCTTTCGCAACGCAAAGGAATTTGTACTCATCGCCATCTACCGCGTACAGGTCGATTTGCGCAGGCAGGTTAGTGCCGGTGTTGACCTCTTTGTACATGTCCAGCGCCGCATTCTGTGAATAGCGCAGGTTATCTTCGATATAGGTGTTATAGACGCCTTTCGACAGCGTTTCTTCATCACCGCCGCCGGTCCACACGCGCTGGCCTTTTTTACCGACGATGATCGCGGTGCCGGTATCCTGGC > CP009273/4336532‑4336830 | gTCAGCAGGGCTTTGGTTTCCTGGTAGAGATACGTTTTGTTGGCAGAGCCGCCGCCTTTCGCAACGCAAAGGAATTTGTACTCATCGCCATCTACCGCGTACAGGTCGATTTGCGCAGGCAGGTTAGTGCCGGTGTTGACCTCTTTGTAc > 1:3572520/1‑150 (MQ=255) cagcagGGCTTTGGTTTCCTGGTAGAGATACGTTTTGTTGGCAGAGCCGCCGCCTTTCGCAACGCAAAGGAATTTGTACTCATCGCCATCTACCGCGTACAGGTCGATTTGCGCAGGCAGGTTAGTGCCGGTGTTGACCTCTTTGTTCAt < 2:409143/150‑1 (MQ=255) gcagGGCTTTGGTTTCCTGGTAGAGATACGTTTTGTTGGCAGAGCCACCGCCTTTCGCAACGCAAAGGAATTTGTACTCATCGCCATCTACCGCGTACAGGTCGATTTGCGCAGGCAGGTTAGTGCCGGTGTTGACCTCTTTGTACATGt < 1:2791854/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |